MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251

Total Repeats: 13257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017349	TG	3	6	1097134	1097139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017349	ACTTC	2	10	1097155	1097164	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5003	NC_017349	TAG	2	6	1097170	1097175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017349	TCC	2	6	1099109	1099114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_017349	TGTT	2	8	1099121	1099128	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017349	TA	3	6	1099165	1099170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017349	ATTC	2	8	1099178	1099185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5008	NC_017349	ATC	2	6	1099188	1099193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_017349	TAA	2	6	1099208	1099213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017349	TAA	2	6	1099223	1099228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017349	TCA	2	6	1099235	1099240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017349	A	6	6	1099254	1099259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017349	ATG	2	6	1099302	1099307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017349	ATA	2	6	1099312	1099317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017349	TATT	2	8	1099373	1099380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017349	AAAT	2	8	1099382	1099389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017349	AAGA	2	8	1099412	1099419	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017349	AT	3	6	1099486	1099491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017349	TTAT	2	8	1099499	1099506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017349	CAT	2	6	1099538	1099543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_017349	GT	3	6	1099574	1099579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017349	CCTT	2	8	1100141	1100148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_017349	GTT	2	6	1100184	1100189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017349	ACT	2	6	1100236	1100241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_017349	A	6	6	1100295	1100300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017349	ATTT	2	8	1100339	1100346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017349	ATC	2	6	1100347	1100352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017349	TATAA	2	10	1100367	1100376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017349	TGTAA	2	10	1100417	1100426	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017349	ATTTA	2	10	1100464	1100473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017349	AAC	2	6	1101147	1101152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_017349	TAT	2	6	1101165	1101170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017349	T	7	7	1101178	1101184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017349	ATTT	2	8	1101222	1101229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017349	AAATG	2	10	1103436	1103445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017349	AGG	2	6	1103464	1103469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017349	T	6	6	1106235	1106240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017349	AGT	2	6	1106252	1106257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017349	CATG	2	8	1106294	1106301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_017349	TTCG	2	8	1106624	1106631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_017349	T	6	6	1106654	1106659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017349	TAA	2	6	1106675	1106680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017349	T	6	6	1106747	1106752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017349	TAG	2	6	1111102	1111107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017349	TAA	2	6	1111130	1111135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017349	TGA	2	6	1112190	1112195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017349	AGTA	2	8	1112206	1112213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017349	TTA	2	6	1112226	1112231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017349	TTAA	2	8	1112269	1112276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017349	TAT	2	6	1112357	1112362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017349	GTA	2	6	1112425	1112430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017349	TTA	2	6	1112434	1112439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017349	AAAG	2	8	1112451	1112458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017349	GTT	2	6	1112925	1112930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017349	ATT	2	6	1112932	1112937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017349	CAAC	2	8	1112943	1112950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_017349	CTT	2	6	1114337	1114342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017349	ATA	2	6	1114352	1114357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017349	TAA	2	6	1114361	1114366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017349	ATTT	2	8	1114386	1114393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017349	T	7	7	1114397	1114403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017349	ATT	2	6	1114414	1114419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017349	TAT	2	6	1114485	1114490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017349	CCT	2	6	1115126	1115131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_017349	TAG	2	6	1115171	1115176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017349	AAG	2	6	1115220	1115225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017349	TAA	2	6	1115250	1115255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017349	GAT	2	6	1115267	1115272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017349	ATA	2	6	1116166	1116171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017349	TCA	2	6	1116205	1116210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017349	TG	3	6	1116217	1116222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017349	ATA	2	6	1116490	1116495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017349	A	6	6	1116495	1116500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017349	AAGA	2	8	1116528	1116535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017349	ATA	2	6	1118404	1118409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017349	TA	3	6	1118453	1118458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017349	A	6	6	1118466	1118471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017349	TA	3	6	1119210	1119215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017349	ATT	2	6	1119218	1119223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017349	TA	3	6	1119309	1119314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017349	AT	3	6	1119612	1119617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017349	TTTATA	2	12	1119665	1119676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017349	TGT	2	6	1119705	1119710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017349	CTT	2	6	1119711	1119716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017349	GTCA	2	8	1119725	1119732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_017349	TA	3	6	1119832	1119837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017349	TA	3	6	1121213	1121218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017349	TGA	2	6	1121237	1121242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017349	AAC	2	6	1121269	1121274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_017349	TTTTG	2	10	1121287	1121296	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017349	AAACA	2	10	1121332	1121341	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5092	NC_017349	TGG	2	6	1121386	1121391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017349	ATG	2	6	1121405	1121410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017349	ATA	2	6	1121434	1121439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017349	ATTTT	2	10	1121457	1121466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017349	T	6	6	1121470	1121475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017349	CAA	2	6	1121503	1121508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_017349	TGT	2	6	1121523	1121528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017349	ATT	3	9	1121547	1121555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017349	TAT	2	6	1121649	1121654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017349	TTAG	2	8	1121659	1121666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017349	GAG	2	6	1121683	1121688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017349	TAAAA	2	10	1125158	1125167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017349	ACA	2	6	1125177	1125182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017349	A	6	6	1125238	1125243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017349	T	6	6	1125284	1125289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017349	CAT	2	6	1126214	1126219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_017349	A	7	7	1126220	1126226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017349	GAATTA	2	12	1126238	1126249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017349	GAT	2	6	1126264	1126269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017349	GAC	2	6	1126354	1126359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_017349	T	7	7	1126384	1126390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017349	TTA	2	6	1126468	1126473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017349	TAAAT	2	10	1126502	1126511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017349	AATTT	2	10	1126561	1126570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017349	AGG	2	6	1126630	1126635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017349	ATTA	2	8	1127554	1127561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017349	T	6	6	1128090	1128095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017349	GAA	2	6	1128099	1128104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017349	T	7	7	1128149	1128155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017349	ATG	2	6	1128237	1128242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017349	GAT	2	6	1128260	1128265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017349	TAAT	2	8	1128312	1128319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017349	GTT	2	6	1128322	1128327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017349	T	6	6	1128326	1128331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017349	GGT	2	6	1128354	1128359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017349	ATC	2	6	1129897	1129902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_017349	A	6	6	1130857	1130862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017349	TCC	2	6	1130864	1130869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_017349	TG	3	6	1130919	1130924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_017349	GAATT	2	10	1130950	1130959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_017349	TAA	2	6	1131044	1131049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_017349	A	6	6	1164385	1164390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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