MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ECT-R 2

Total Repeats: 226

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017343	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017343	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017343	TAAATC	2	12	17172	17183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017343	ATTTAT	2	12	49293	49304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017343	AACAAA	2	12	62873	62884	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017343	AATATA	2	12	72174	72185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017343	TTAAAT	2	12	83316	83327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017343	TAACAA	2	12	84673	84684	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017343	AATGTA	2	12	108212	108223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017343	CTGTAA	2	12	110033	110044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017343	GTTTTT	2	12	121241	121252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017343	GATTTT	2	12	138028	138039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017343	ATTAAT	2	12	153204	153215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017343	TCCCAC	2	12	154462	154473	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017343	TTTATA	2	12	176315	176326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017343	ATTAAT	2	12	176338	176349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017343	TTTTTA	2	12	197166	197177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017343	GATTTT	2	12	207319	207330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017343	ATATGA	2	12	228033	228044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017343	GGAATA	2	12	242895	242906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017343	ATATAG	2	12	264122	264133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017343	ATTTTC	2	12	269439	269450	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017343	ATAATT	2	12	270388	270399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017343	TAACTT	2	12	286023	286034	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017343	ATATGA	2	12	335825	335836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017343	TTCATT	2	12	340280	340291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017343	TTGTAA	2	12	345583	345594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017343	AATGTA	2	12	383579	383590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017343	AATTTG	2	12	383686	383697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017343	TAAAGA	2	12	385674	385685	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017343	TGAAAT	2	12	407075	407086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017343	TTTAAT	2	12	412079	412090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017343	TGTATA	2	12	421299	421310	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017343	TTTTTA	2	12	435155	435166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017343	AAAATG	2	12	440588	440599	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017343	ACGTTG	2	12	460952	460963	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017343	AAAATA	2	12	461674	461685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017343	GTTTGG	2	12	467517	467528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017343	TTATAA	2	12	482371	482382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017343	AAATTT	2	12	489130	489141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017343	TTATAA	2	12	544280	544291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017343	GTTATA	2	12	544951	544962	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017343	CTTAAA	2	12	553383	553394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017343	ACATGT	2	12	563357	563368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017343	ATTGCG	2	12	592518	592529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017343	AATGAT	2	12	596436	596447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017343	TAGATG	2	12	596509	596520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017343	TAAAAT	2	12	611829	611840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017343	TTATTT	2	12	617947	617958	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017343	CATTAT	2	12	634025	634036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017343	GTTTGG	2	12	645018	645029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017343	CATCAA	2	12	646076	646087	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017343	TAATTT	2	12	650316	650327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017343	ATAAAA	2	12	651223	651234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017343	TGAATA	2	12	666792	666803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017343	TTAAAA	2	12	692801	692812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017343	TAGTTA	2	12	697236	697247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017343	TTTTTA	2	12	715511	715522	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017343	TGAAAA	2	12	723754	723765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017343	AATGAT	2	12	752377	752388	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017343	ACAAAA	2	12	792611	792622	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017343	TAAAAA	2	12	811911	811922	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017343	TATCAA	2	12	818305	818316	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017343	TTTTGA	2	12	822125	822136	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017343	TCATTT	2	12	828117	828128	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017343	AAATTA	2	12	838286	838297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017343	AAGCAC	2	12	847019	847030	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017343	CCAAAC	2	12	852108	852119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017343	TAAAAT	2	12	856387	856398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017343	TTTAAT	2	12	929129	929140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017343	ACAATA	2	12	946530	946541	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017343	AACGGA	2	12	961053	961064	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017343	AAAAGC	2	12	965651	965662	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017343	CTAAAT	2	12	980048	980059	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017343	CATTTA	2	12	989201	989212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017343	ATCATA	2	12	991096	991107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017343	TCAAAA	2	12	997603	997614	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017343	ATTGCA	2	12	998740	998751	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017343	TTTTCT	2	12	1011470	1011481	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017343	TTTATA	2	12	1047673	1047684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017343	GAATTA	2	12	1054246	1054257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017343	ATTTTA	2	12	1054569	1054580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017343	ATTTTT	2	12	1071623	1071634	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017343	ATAATT	2	12	1072420	1072431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017343	TCATTA	2	12	1077633	1077644	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017343	TAATGA	2	12	1085719	1085730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017343	CCAAAC	2	12	1097573	1097584	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017343	ATTTAT	2	12	1106405	1106416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017343	AAATTT	2	12	1111125	1111136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017343	AAGTAA	2	12	1132830	1132841	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017343	TCGTTT	2	12	1135957	1135968	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017343	TTAATT	2	12	1146673	1146684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017343	AATTAA	2	12	1149409	1149420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017343	GAAATT	2	12	1194445	1194456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017343	AATGAT	2	12	1207228	1207239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017343	TAAAGA	2	12	1221705	1221716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017343	TTTCAT	2	12	1237508	1237519	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017343	TATATT	2	12	1242164	1242175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017343	CATATT	2	12	1267242	1267253	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017343	ATGTAT	2	12	1267862	1267873	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017343	AAAGAA	2	12	1268094	1268105	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017343	ATTAAA	2	12	1299674	1299685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017343	ATATAA	2	12	1307711	1307722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017343	AAAATA	2	12	1321779	1321790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017343	GTTTTA	2	12	1337525	1337536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017343	TAAAAT	2	12	1353682	1353693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017343	TATCTT	2	12	1375783	1375794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017343	TTGATT	2	12	1375846	1375857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017343	ATTCTA	2	12	1383187	1383198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017343	AATAAA	2	12	1386040	1386051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017343	TATTCT	2	12	1434021	1434032	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017343	TACTTG	2	12	1444269	1444280	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017343	AAAAAT	2	12	1444285	1444296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017343	TTAATC	2	12	1457795	1457806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017343	TATGAT	2	12	1493632	1493643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017343	AATAAA	2	12	1498745	1498756	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017343	ATAAAA	2	12	1502532	1502543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017343	ACAAGA	2	12	1509890	1509901	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017343	TAAAAA	2	12	1522792	1522803	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017343	TTATAG	2	12	1531925	1531936	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017343	AATTTA	2	12	1539960	1539971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017343	AGCCAA	2	12	1567864	1567875	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017343	TTGACT	2	12	1567883	1567894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017343	TTTAAC	2	12	1572767	1572778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017343	TTATAA	2	12	1575252	1575263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017343	ACCTTT	2	12	1585209	1585220	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017343	TTTTAT	2	12	1588028	1588039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017343	AGTTTT	2	12	1613917	1613928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017343	AATTAA	2	12	1615162	1615173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017343	TAAAAC	2	12	1618302	1618313	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017343	TTAAAT	2	12	1625621	1625632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017343	AATTTA	2	12	1628111	1628122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017343	ATTTTC	2	12	1634146	1634157	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017343	TTTTAG	2	12	1640351	1640362	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017343	TTTCAT	2	12	1686905	1686916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017343	TAATTA	2	12	1720308	1720319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017343	TATCAA	2	12	1724210	1724221	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017343	TAAAAA	2	12	1726410	1726421	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_017343	CATACA	2	12	1753635	1753646	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_017343	ATTATA	2	12	1797016	1797027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017343	ATTCAA	2	12	1812275	1812286	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017343	TAAAAA	2	12	1816995	1817006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017343	TAAATT	2	12	1832759	1832770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017343	TCTAAC	2	12	1885489	1885500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017343	TTTTAA	2	12	1890404	1890415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017343	TAATTT	2	12	1900521	1900532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017343	AATTTA	2	12	1950237	1950248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017343	TTTAAA	2	12	1950608	1950619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017343	AATATT	2	12	2006101	2006112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017343	CCTATT	2	12	2011866	2011877	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_017343	AATTAA	2	12	2148587	2148598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.