MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 11288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017342	CTTT	2	8	986369	986376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_017342	TTTTTA	2	12	986398	986409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017342	AATA	2	8	986430	986437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017342	TG	3	6	986446	986451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017342	TG	3	6	986453	986458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017342	ATGA	2	8	986470	986477	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017342	TAA	2	6	986495	986500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017342	TAAGGC	2	12	986556	986567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4009	NC_017342	TTAA	2	8	986617	986624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017342	TGG	2	6	986661	986666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017342	AGA	2	6	986682	986687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017342	ATCG	2	8	987639	987646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_017342	T	6	6	987689	987694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017342	T	6	6	987732	987737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017342	A	7	7	987746	987752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017342	AAT	2	6	987803	987808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017342	AGG	2	6	987826	987831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017342	TA	3	6	988752	988757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017342	AAG	2	6	988826	988831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017342	T	6	6	988846	988851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017342	ATA	2	6	988854	988859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017342	TTA	2	6	988867	988872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017342	TAAT	2	8	988883	988890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017342	TAT	2	6	988901	988906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017342	AGT	2	6	988916	988921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017342	TAA	2	6	988956	988961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017342	ATT	2	6	988973	988978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017342	AAT	2	6	990096	990101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017342	TA	3	6	990115	990120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017342	AAC	2	6	990122	990127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_017342	TAA	2	6	990170	990175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017342	A	6	6	990773	990778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017342	TTG	2	6	990803	990808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017342	TGA	2	6	991606	991611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017342	A	6	6	991629	991634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017342	TACTTA	2	12	991691	991702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4037	NC_017342	TTG	2	6	991722	991727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017342	TAAA	2	8	992660	992667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017342	ATT	2	6	992678	992683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017342	AGC	2	6	992717	992722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_017342	TAA	2	6	992728	992733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017342	A	6	6	992732	992737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017342	ATT	2	6	992759	992764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017342	ATT	2	6	992771	992776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017342	CTT	2	6	992790	992795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017342	TAA	2	6	992837	992842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017342	TCT	2	6	994987	994992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017342	ATG	2	6	995005	995010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017342	T	6	6	995021	995026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017342	GA	3	6	995040	995045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017342	CCT	2	6	997142	997147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_017342	A	6	6	997168	997173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017342	GAT	2	6	997187	997192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017342	AGG	2	6	1000251	1000256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017342	ATT	2	6	1001359	1001364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017342	AAT	2	6	1001533	1001538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017342	TTG	2	6	1001752	1001757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017342	AT	3	6	1001783	1001788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017342	T	6	6	1001790	1001795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017342	TGT	2	6	1001805	1001810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017342	ACA	2	6	1001818	1001823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017342	AT	3	6	1001901	1001906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017342	TAA	2	6	1001927	1001932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017342	AAG	2	6	1001951	1001956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017342	AGG	2	6	1001963	1001968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017342	CAT	2	6	1001969	1001974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_017342	CAT	2	6	1002355	1002360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017342	GACA	2	8	1002375	1002382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_017342	ATG	2	6	1002384	1002389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017342	TTAGC	2	10	1004100	1004109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4071	NC_017342	T	6	6	1004115	1004120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017342	ACA	2	6	1004121	1004126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017342	AT	3	6	1004161	1004166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017342	ATT	2	6	1004168	1004173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017342	AAT	2	6	1005038	1005043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017342	AT	3	6	1005070	1005075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017342	TGA	2	6	1005086	1005091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017342	TTAA	2	8	1005093	1005100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017342	ATA	2	6	1005115	1005120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017342	AAT	2	6	1005230	1005235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017342	ATT	2	6	1005265	1005270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017342	GAG	2	6	1005318	1005323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017342	GAT	2	6	1005377	1005382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017342	T	7	7	1006948	1006954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017342	ATG	2	6	1010209	1010214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017342	ACT	2	6	1010218	1010223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017342	TAA	2	6	1010286	1010291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017342	TGA	2	6	1010319	1010324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017342	TGTTT	2	10	1010354	1010363	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017342	GTA	2	6	1010720	1010725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017342	GATA	2	8	1010759	1010766	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017342	TGT	2	6	1010775	1010780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017342	ACA	2	6	1010806	1010811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017342	TCA	2	6	1010853	1010858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017342	AAAAT	2	10	1012149	1012158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017342	TTTA	2	8	1012232	1012239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017342	GTT	2	6	1012247	1012252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017342	ATC	2	6	1012335	1012340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017342	ATG	2	6	1012394	1012399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017342	GTTTT	2	10	1012409	1012418	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017342	AATT	2	8	1012475	1012482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017342	ACT	2	6	1013420	1013425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017342	A	6	6	1013505	1013510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017342	ACT	2	6	1013513	1013518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017342	ATG	2	6	1013568	1013573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017342	CAT	2	6	1014583	1014588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017342	AAAG	2	8	1014647	1014654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017342	T	6	6	1016862	1016867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017342	A	7	7	1016901	1016907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017342	A	6	6	1018266	1018271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017342	T	6	6	1018295	1018300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017342	AAG	2	6	1018321	1018326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017342	CTT	2	6	1018381	1018386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017342	TTG	2	6	1018393	1018398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017342	TCT	2	6	1018407	1018412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_017342	ATA	2	6	1018413	1018418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017342	TA	4	8	1018417	1018424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017342	ACC	2	6	1018846	1018851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_017342	TA	3	6	1018867	1018872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017342	AAT	2	6	1018874	1018879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017342	ATA	3	9	1018888	1018896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017342	AAG	2	6	1018925	1018930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017342	A	6	6	1018936	1018941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017342	TA	3	6	1018970	1018975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017342	TAAC	2	8	1019057	1019064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_017342	AC	3	6	1019104	1019109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_017342	AGG	2	6	1019181	1019186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017342	AGG	2	6	1019514	1019519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017342	AGG	2	6	1020204	1020209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017342	AGG	2	6	1021135	1021140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017342	AGG	2	6	1022343	1022348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017342	AGG	2	6	1022712	1022717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017342	TAAG	2	8	1024016	1024023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017342	AGG	2	6	1024024	1024029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_017342	A	6	6	1052533	1052538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_017342	AATG	2	8	1053356	1053363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_017342	TAT	2	6	1053385	1053390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_017342	TAT	2	6	1053499	1053504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_017342	GTGAAT	2	12	1054390	1054401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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