MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 11288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017342	TAAA	2	8	362004	362011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017342	AT	4	8	362013	362020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017342	TAAA	2	8	363273	363280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017342	CGT	2	6	363283	363288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017342	TAA	2	6	363307	363312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017342	ATT	2	6	363315	363320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017342	CAT	2	6	363372	363377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_017342	GCTTT	2	10	363463	363472	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1509	NC_017342	A	6	6	363537	363542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017342	TCA	2	6	363568	363573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017342	AAAC	2	8	363618	363625	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1512	NC_017342	AAC	2	6	363675	363680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_017342	CAG	2	6	363725	363730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017342	GAT	2	6	363734	363739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017342	TAT	2	6	363765	363770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017342	AAC	2	6	363835	363840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017342	TC	3	6	365398	365403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_017342	TATAA	2	10	365418	365427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017342	CAT	2	6	365437	365442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017342	TAA	2	6	365446	365451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017342	TA	3	6	365477	365482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017342	AAT	2	6	365504	365509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017342	CGT	2	6	365543	365548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017342	AAT	2	6	365562	365567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017342	ATA	2	6	365610	365615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017342	AAT	2	6	365633	365638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017342	GTT	2	6	365656	365661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017342	CAA	2	6	365705	365710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_017342	T	6	6	365812	365817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017342	T	6	6	366594	366599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017342	TTTA	2	8	369122	369129	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017342	TTA	2	6	371816	371821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017342	TC	3	6	378347	378352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_017342	TAT	2	6	383387	383392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017342	AT	4	8	383391	383398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017342	AATT	2	8	383428	383435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017342	ATT	2	6	383449	383454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_017342	TTTA	2	8	383463	383470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017342	AAT	2	6	383483	383488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017342	AGT	2	6	383499	383504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017342	CTTT	2	8	383537	383544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_017342	A	7	7	383548	383554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017342	TC	3	6	383573	383578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_017342	T	6	6	383646	383651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017342	GAT	2	6	383676	383681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017342	TAT	2	6	383682	383687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017342	ATT	2	6	386333	386338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017342	TC	3	6	386360	386365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_017342	A	6	6	386389	386394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017342	ATT	2	6	386409	386414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017342	AAAT	2	8	386435	386442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017342	T	6	6	386498	386503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017342	TA	3	6	386527	386532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017342	ACA	2	6	386587	386592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_017342	ATA	2	6	388652	388657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017342	TA	3	6	388664	388669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017342	T	6	6	388684	388689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017342	AAACAA	2	12	388742	388753	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1559	NC_017342	AAGT	2	8	388774	388781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017342	AT	3	6	388787	388792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017342	CTCA	2	8	390333	390340	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_017342	TCTT	2	8	390359	390366	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_017342	TAT	2	6	390372	390377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017342	AT	3	6	390376	390381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017342	AAAT	2	8	391945	391952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017342	AT	3	6	391975	391980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017342	AAAG	2	8	392032	392039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017342	TTA	2	6	392040	392045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017342	CATA	2	8	392111	392118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_017342	ATT	2	6	393114	393119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017342	AT	3	6	393170	393175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017342	AAAG	2	8	393308	393315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_017342	TAT	2	6	395764	395769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017342	CAG	2	6	395778	395783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017342	GAA	2	6	395785	395790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017342	TAT	3	9	395794	395802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017342	CTG	2	6	395814	395819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_017342	TAT	2	6	395824	395829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017342	TA	4	8	397041	397048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017342	CTC	2	6	397720	397725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_017342	TA	3	6	397730	397735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017342	TTTA	2	8	397741	397748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017342	AT	3	6	397767	397772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_017342	TA	3	6	399911	399916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_017342	ATA	3	9	399914	399922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017342	T	6	6	399923	399928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017342	GTT	2	6	400015	400020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017342	ATT	2	6	400061	400066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017342	ATG	2	6	400069	400074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017342	ATT	2	6	400851	400856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017342	A	8	8	400858	400865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017342	TGA	2	6	400871	400876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_017342	ATG	2	6	400944	400949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017342	TAT	2	6	401654	401659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017342	CAA	2	6	401681	401686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_017342	T	6	6	401705	401710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017342	AAT	2	6	401735	401740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017342	ATTT	2	8	401755	401762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017342	TA	3	6	401802	401807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017342	CAA	2	6	401830	401835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_017342	TAA	2	6	401836	401841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017342	TTA	2	6	401865	401870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017342	A	6	6	401932	401937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017342	TCC	2	6	402592	402597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_017342	TAA	2	6	402617	402622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017342	GT	3	6	402633	402638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017342	AAT	2	6	402644	402649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017342	TAT	2	6	402650	402655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017342	TA	3	6	402674	402679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017342	ATA	2	6	402703	402708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017342	A	6	6	402769	402774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017342	TCT	2	6	402809	402814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_017342	CTT	2	6	405525	405530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_017342	TCA	2	6	406707	406712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_017342	ATG	2	6	406743	406748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017342	TTA	2	6	406847	406852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017342	AT	3	6	408516	408521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017342	T	6	6	408559	408564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017342	AAAAT	2	10	408572	408581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017342	GTG	2	6	408621	408626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017342	ATG	2	6	408631	408636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017342	CAT	2	6	408699	408704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017342	TTA	2	6	408725	408730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017342	CTA	2	6	408736	408741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_017342	A	6	6	408765	408770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017342	ATTT	2	8	408806	408813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017342	ATT	2	6	408814	408819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017342	GAT	2	6	408824	408829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017342	CTC	2	6	409617	409622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_017342	CTC	2	6	409650	409655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_017342	ACA	2	6	409670	409675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_017342	ATT	2	6	409787	409792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_017342	T	6	6	409791	409796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017342	TC	3	6	409800	409805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_017342	ATTT	2	8	410457	410464	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017342	TTATT	2	10	410492	410501	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_017342	TAT	2	6	410581	410586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_017342	ATC	2	6	410609	410614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1639	NC_017342	TCC	2	6	421866	421871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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