MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 11288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017342	ATTA	2	8	202273	202280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017342	AAAT	2	8	202286	202293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017342	A	6	6	202302	202307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017342	ATT	2	6	202356	202361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017342	T	7	7	203307	203313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017342	CT	3	6	203368	203373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_017342	AG	3	6	203407	203412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017342	ATTT	2	8	203415	203422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017342	TTA	2	6	203434	203439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017342	TAT	3	9	203907	203915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017342	TA	4	8	203939	203946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017342	ATT	2	6	203980	203985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017342	ATTT	2	8	203999	204006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017342	T	6	6	204004	204009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017342	AAAG	2	8	204029	204036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017342	AAC	2	6	204364	204369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017342	TAC	2	6	204398	204403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017342	TCA	2	6	204415	204420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017342	CA	3	6	204449	204454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_017342	ATA	2	6	204466	204471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017342	ATTA	2	8	204556	204563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017342	TCT	2	6	204575	204580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017342	TCA	2	6	204634	204639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017342	TAA	2	6	204640	204645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017342	CA	3	6	204703	204708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_017342	TTTAT	2	10	204709	204718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017342	A	6	6	204750	204755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017342	TA	3	6	204767	204772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017342	T	7	7	204784	204790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017342	A	6	6	204803	204808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017342	TTAT	2	8	204906	204913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017342	ATG	2	6	204916	204921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017342	AAT	2	6	204960	204965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017342	T	6	6	204970	204975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017342	CTT	3	9	204978	204986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017342	GGTT	2	8	205006	205013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017342	TTC	2	6	205079	205084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017342	TAG	2	6	205131	205136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017342	TTTCC	2	10	205138	205147	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1040	NC_017342	TA	3	6	205178	205183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017342	ATG	2	6	205231	205236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017342	AT	3	6	206078	206083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017342	TTC	2	6	206101	206106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017342	T	6	6	206128	206133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017342	ATA	2	6	206140	206145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017342	TAA	3	9	207073	207081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017342	AT	3	6	207084	207089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017342	AT	3	6	207146	207151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017342	CCAT	2	8	207152	207159	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_017342	TCA	2	6	207182	207187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017342	TA	3	6	207197	207202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017342	TTTA	2	8	207226	207233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017342	AAAT	2	8	207287	207294	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017342	TATC	2	8	207336	207343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_017342	TTA	2	6	207356	207361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017342	CATT	2	8	207440	207447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_017342	TAT	2	6	207502	207507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017342	AT	3	6	207558	207563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017342	AGC	3	9	209260	209268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017342	T	6	6	209378	209383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017342	TTC	2	6	209440	209445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017342	GCA	2	6	209471	209476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017342	TAAA	2	8	211105	211112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017342	ACA	2	6	211122	211127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017342	CTT	2	6	211146	211151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017342	ATT	2	6	211402	211407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017342	ATTT	2	8	211418	211425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017342	A	6	6	211445	211450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017342	TA	3	6	211462	211467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017342	ATTA	2	8	211510	211517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017342	CAA	2	6	211526	211531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017342	A	7	7	211540	211546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017342	ATT	2	6	212164	212169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017342	CT	3	6	215420	215425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_017342	GTT	2	6	225651	225656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017342	A	6	6	225662	225667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017342	T	6	6	226065	226070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017342	ATA	2	6	226092	226097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017342	TA	3	6	226096	226101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017342	ATT	2	6	226103	226108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017342	GTATAT	2	12	226110	226121	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017342	T	6	6	226124	226129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017342	T	7	7	226143	226149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017342	AAAT	2	8	226150	226157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017342	AT	3	6	226156	226161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017342	AT	3	6	226173	226178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017342	CATT	2	8	226190	226197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_017342	ATTAA	2	10	226224	226233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017342	ATG	2	6	227253	227258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017342	T	6	6	227335	227340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017342	TTA	2	6	227346	227351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017342	TTA	2	6	227365	227370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017342	ATT	2	6	227374	227379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017342	TAA	2	6	227426	227431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017342	ATAA	2	8	227459	227466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017342	GGA	2	6	227470	227475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017342	GGA	2	6	229059	229064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017342	A	6	6	231834	231839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017342	TC	3	6	233020	233025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_017342	AAC	2	6	233063	233068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_017342	ATC	2	6	233115	233120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017342	CTC	2	6	234158	234163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_017342	A	6	6	234222	234227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017342	AATT	2	8	234242	234249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017342	ATTC	2	8	234253	234260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_017342	TG	3	6	234301	234306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017342	ATC	2	6	234315	234320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017342	CTCAT	2	10	234336	234345	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1109	NC_017342	ATA	2	6	235762	235767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017342	GAA	2	6	235768	235773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017342	GAA	2	6	235836	235841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017342	TTC	2	6	235854	235859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017342	ATT	3	9	235870	235878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017342	CT	3	6	236292	236297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_017342	TTAA	2	8	236314	236321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017342	TAA	2	6	236486	236491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017342	TC	3	6	236497	236502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_017342	TCA	2	6	236572	236577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017342	ATGAT	2	10	236588	236597	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017342	ATA	2	6	236602	236607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017342	TA	3	6	236614	236619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017342	ATTA	2	8	236628	236635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017342	TCA	2	6	237681	237686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017342	ATT	2	6	237734	237739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017342	ATA	2	6	237756	237761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017342	GCAT	2	8	237812	237819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_017342	TATGA	2	10	240149	240158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017342	T	6	6	240203	240208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017342	CAT	2	6	240221	240226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017342	AAT	2	6	240235	240240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017342	T	6	6	240295	240300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017342	ATA	2	6	240351	240356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017342	AGG	2	6	240370	240375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017342	ATC	2	6	241211	241216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017342	ATCGTT	2	12	241228	241239	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1136	NC_017342	TAG	2	6	241243	241248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017342	TCA	2	6	241250	241255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_017342	TTAG	2	8	241306	241313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_017342	ATT	2	6	241318	241323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_017342	T	7	7	241322	241328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_017342	ACA	2	6	243080	243085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1143	NC_017342	TA	4	8	244857	244864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1162	NC_017342	TTTTC	2	10	251485	251494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1174	NC_017342	TAAT	2	8	257845	257852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_017342	CAA	2	6	277617	277622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1265	NC_017342	T	6	6	279375	279380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_017342	TTCCAC	2	12	279395	279406	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1268	NC_017342	TTTAA	2	10	280739	280748	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_017342	AT	3	6	280765	280770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_017342	TA	3	6	280772	280777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_017342	ACT	2	6	280778	280783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_017342	T	7	7	280805	280811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_017342	CAC	2	6	281560	281565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1274	NC_017342	T	6	6	281626	281631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_017342	TA	3	6	281673	281678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1276	NC_017342	ATTCA	2	10	281693	281702	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1277	NC_017342	TAT	2	6	281761	281766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1288	NC_017342	TGAA	2	8	289974	289981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1399	NC_017342	AT	3	6	328399	328404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_017342	T	6	6	328430	328435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1402	NC_017342	AATCA	2	10	328527	328536	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1403	NC_017342	T	6	6	328545	328550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1406	NC_017342	TCA	2	6	328974	328979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1408	NC_017342	CA	3	6	329042	329047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1409	NC_017342	CCT	2	6	333354	333359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1410	NC_017342	ATT	2	6	333370	333375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_017342	AGTTG	2	10	333386	333395	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_017342	TAA	2	6	333465	333470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_017342	T	7	7	333497	333503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_017342	TAT	2	6	333600	333605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_017342	TAA	3	9	333610	333618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_017342	TAA	2	6	333652	333657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_017342	CAAA	2	8	333701	333708	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1419	NC_017342	TA	3	6	333760	333765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_017342	CTT	2	6	333781	333786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1421	NC_017342	ATTA	2	8	333791	333798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_017342	TAAG	2	8	333817	333824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_017342	T	6	6	333884	333889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_017342	ATA	2	6	333902	333907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_017342	A	6	6	336130	336135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_017342	CAA	2	6	336167	336172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1427	NC_017342	GGT	2	6	336237	336242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_017342	T	7	7	336242	336248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_017342	AT	3	6	337922	337927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_017342	TA	3	6	338597	338602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_017342	TAC	2	6	338645	338650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_017342	A	6	6	338681	338686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_017342	TATT	2	8	338692	338699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_017342	TTAA	2	8	338742	338749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1438	NC_017342	TAC	2	6	340198	340203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_017342	AAC	2	6	340338	340343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_017342	TATAAA	2	12	340375	340386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_017342	ATT	2	6	344908	344913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_017342	AG	3	6	344945	344950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_017342	ATC	2	6	345487	345492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1451	NC_017342	ATG	2	6	345501	345506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_017342	TTATT	2	10	345520	345529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_017342	CGT	2	6	345583	345588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1456	NC_017342	ATG	2	6	345672	345677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1462	NC_017342	AT	3	6	353748	353753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_017342	ATC	2	6	353776	353781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1475	NC_017342	TA	3	6	355490	355495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1476	NC_017342	A	7	7	355605	355611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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