MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 11288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017342	GAT	2	6	87803	87808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017342	TGT	2	6	87887	87892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017342	AG	3	6	87976	87981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017342	AAATA	2	10	87997	88006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017342	AAG	2	6	88014	88019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017342	TTTA	2	8	88060	88067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017342	TCC	2	6	88406	88411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_017342	T	6	6	90022	90027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017342	TAA	2	6	90931	90936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017342	ATT	2	6	90944	90949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017342	CAAA	2	8	90965	90972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_017342	TAT	2	6	91013	91018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017342	T	6	6	91036	91041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017342	AC	3	6	91844	91849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_017342	TC	3	6	93470	93475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_017342	ATT	2	6	93485	93490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017342	TAA	2	6	93499	93504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017342	TCA	2	6	93518	93523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017342	AAT	2	6	93540	93545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017342	TGT	2	6	93553	93558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017342	ATAA	2	8	94337	94344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017342	ATT	2	6	94348	94353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017342	ATATAC	2	12	94382	94393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
524	NC_017342	AATTT	2	10	94398	94407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017342	ATTA	2	8	94408	94415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017342	TTA	3	9	94425	94433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017342	CAT	2	6	94439	94444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017342	T	7	7	94444	94450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017342	ATT	2	6	94451	94456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017342	CTA	2	6	94487	94492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017342	TATT	2	8	94562	94569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017342	TAA	2	6	94589	94594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017342	ATG	2	6	94621	94626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017342	AAT	2	6	94969	94974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017342	A	7	7	94994	95000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017342	CAT	2	6	95047	95052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017342	TCAT	2	8	97336	97343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_017342	ACTT	2	8	97375	97382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
539	NC_017342	ATT	2	6	97399	97404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017342	TAA	2	6	97413	97418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017342	CT	3	6	97455	97460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
542	NC_017342	TTTA	2	8	97461	97468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017342	TTTA	2	8	97496	97503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017342	ACT	2	6	97504	97509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017342	A	6	6	97533	97538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017342	TCC	2	6	100444	100449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_017342	TAT	2	6	100489	100494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017342	TGG	2	6	100501	100506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017342	TGG	2	6	100536	100541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017342	CAAA	2	8	100584	100591	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_017342	ACG	2	6	100601	100606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017342	TAT	2	6	100684	100689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017342	ATTT	2	8	101384	101391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017342	TTA	3	9	101417	101425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017342	TTA	2	6	101447	101452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017342	ATT	3	9	101503	101511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017342	AT	3	6	101524	101529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017342	TTAA	2	8	101543	101550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017342	GTT	2	6	101570	101575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017342	ATC	2	6	101583	101588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017342	A	6	6	101631	101636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017342	AAC	2	6	101643	101648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017342	AAT	2	6	101649	101654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017342	T	6	6	101724	101729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017342	ATC	2	6	101735	101740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017342	TAT	2	6	102509	102514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017342	AAAC	2	8	102526	102533	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
568	NC_017342	TAAT	2	8	102583	102590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017342	ACG	3	9	102673	102681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017342	TTA	2	6	102754	102759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017342	ATTG	2	8	102770	102777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017342	TAT	2	6	103482	103487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017342	AT	3	6	103518	103523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017342	CTA	2	6	103561	103566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017342	TA	3	6	103571	103576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017342	TAAT	2	8	103636	103643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017342	T	6	6	103666	103671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017342	T	7	7	103686	103692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017342	CTTT	2	8	103704	103711	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_017342	TTA	2	6	103803	103808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017342	A	6	6	103848	103853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017342	TGC	2	6	103870	103875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017342	TAT	2	6	103905	103910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017342	ATT	2	6	104651	104656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017342	TAT	2	6	104694	104699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017342	TG	3	6	104866	104871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017342	TCT	2	6	104890	104895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017342	AAG	2	6	104916	104921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017342	TAT	2	6	105986	105991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017342	AGA	2	6	106036	106041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017342	ATC	2	6	106085	106090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017342	CAT	2	6	106163	106168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017342	ACAA	2	8	106195	106202	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_017342	AAT	2	6	106206	106211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017342	CAT	2	6	106221	106226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017342	CAAAA	2	10	106231	106240	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
597	NC_017342	ATG	2	6	106252	106257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017342	GTA	2	6	106305	106310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017342	ATT	2	6	107367	107372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_017342	ATT	2	6	107466	107471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017342	A	6	6	107485	107490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017342	A	6	6	107553	107558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017342	ATC	2	6	107577	107582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017342	ACG	2	6	107615	107620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017342	AT	3	6	108350	108355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017342	TAGAT	2	10	108356	108365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017342	TTA	2	6	108370	108375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017342	T	6	6	108435	108440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017342	TGC	2	6	108488	108493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017342	TG	3	6	108501	108506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017342	A	6	6	108527	108532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017342	AT	3	6	108565	108570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017342	CTAC	2	8	109355	109362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_017342	TAAT	2	8	109430	109437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017342	TAA	2	6	109452	109457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017342	T	6	6	109481	109486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017342	ATTTTA	2	12	109508	109519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017342	CAT	2	6	109551	109556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017342	TCG	2	6	109558	109563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_017342	TAA	2	6	109640	109645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017342	AATA	2	8	109674	109681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017342	T	6	6	109692	109697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017342	ATC	2	6	109719	109724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017342	TAT	2	6	109732	109737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017342	TA	3	6	109744	109749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017342	GGA	2	6	111034	111039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017342	ATT	2	6	111087	111092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017342	ATT	2	6	111139	111144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017342	GAA	2	6	111149	111154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017342	AT	3	6	111194	111199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017342	A	6	6	111240	111245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017342	TGG	2	6	111269	111274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017342	ATT	2	6	111333	111338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017342	AT	3	6	111343	111348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017342	CAAA	2	8	111411	111418	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_017342	ATT	2	6	111452	111457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017342	ATT	2	6	111470	111475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017342	TTTA	2	8	111672	111679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017342	TAA	2	6	111703	111708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017342	TA	3	6	111732	111737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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683	NC_017342	AGA	2	6	113861	113866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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