MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 11288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017342	AGG	2	6	1315817	1315822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017342	TTA	2	6	1315826	1315831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017342	TCA	2	6	1319040	1319045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017342	ATG	2	6	1319050	1319055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017342	ACA	2	6	1319249	1319254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017342	ACA	2	6	1319263	1319268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_017342	TA	3	6	1319305	1319310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017342	GAA	2	6	1319313	1319318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017342	A	6	6	1319323	1319328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017342	AATA	2	8	1319334	1319341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017342	ATG	2	6	1319408	1319413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017342	AGT	2	6	1319474	1319479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017342	GAAA	2	8	1319485	1319492	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017342	TAA	2	6	1319502	1319507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_017342	T	6	6	1319510	1319515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017342	CAA	2	6	1319533	1319538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_017342	AAT	2	6	1319564	1319569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017342	CAA	2	6	1319591	1319596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_017342	AAT	2	6	1319677	1319682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_017342	TGGGG	2	10	1319691	1319700	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_017342	AAT	2	6	1319791	1319796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017342	TGGGG	2	10	1319805	1319814	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017342	AAAT	2	8	1319875	1319882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_017342	ATT	2	6	1319893	1319898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017342	AT	3	6	1319940	1319945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017342	AGT	2	6	1320923	1320928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017342	AT	3	6	1320932	1320937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017342	TAA	2	6	1322389	1322394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_017342	GAA	2	6	1322397	1322402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017342	TTA	2	6	1322423	1322428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017342	TAAAT	2	10	1322460	1322469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017342	AGA	2	6	1322493	1322498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017342	ATG	2	6	1323071	1323076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017342	ATT	2	6	1323102	1323107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017342	TCA	3	9	1323141	1323149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_017342	AAC	2	6	1323174	1323179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_017342	A	7	7	1323225	1323231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017342	TAG	2	6	1323288	1323293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017342	TATTT	2	10	1324429	1324438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017342	AATT	2	8	1325013	1325020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017342	TA	3	6	1325026	1325031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017342	TAA	2	6	1325033	1325038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017342	ATA	2	6	1325069	1325074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017342	ATG	2	6	1325135	1325140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017342	ACA	2	6	1325168	1325173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_017342	TTA	2	6	1325186	1325191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017342	TAG	2	6	1325196	1325201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017342	A	6	6	1325205	1325210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017342	AAT	2	6	1325228	1325233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017342	TGAAAA	2	12	1325240	1325251	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017342	A	6	6	1325248	1325253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017342	ATA	2	6	1325303	1325308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017342	AAATTA	2	12	1325910	1325921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017342	ATA	3	9	1325965	1325973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017342	AATA	2	8	1326043	1326050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017342	T	6	6	1326120	1326125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017342	ATG	2	6	1326148	1326153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017342	GAG	2	6	1326167	1326172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017342	TAAT	2	8	1328277	1328284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017342	AT	3	6	1328286	1328291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017342	AC	4	8	1328298	1328305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_017342	ATT	2	6	1328306	1328311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017342	TGGA	2	8	1328313	1328320	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017342	AAC	2	6	1328321	1328326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_017342	TG	3	6	1328335	1328340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_017342	T	7	7	1328341	1328347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017342	AAT	2	6	1328357	1328362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_017342	TAT	2	6	1328363	1328368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_017342	TATC	2	8	1328377	1328384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5570	NC_017342	A	6	6	1328894	1328899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_017342	AT	4	8	1328950	1328957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_017342	TA	3	6	1328984	1328989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017342	AT	3	6	1329015	1329020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017342	ATC	2	6	1330053	1330058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_017342	AGCG	2	8	1330069	1330076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5576	NC_017342	TAA	2	6	1330082	1330087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_017342	ATGT	2	8	1330112	1330119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_017342	AAT	2	6	1330131	1330136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_017342	TAG	2	6	1330206	1330211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_017342	TAA	2	6	1330582	1330587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_017342	TA	3	6	1330596	1330601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_017342	A	6	6	1330601	1330606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017342	CAT	2	6	1331408	1331413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_017342	TAA	2	6	1331456	1331461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_017342	CAAT	2	8	1331471	1331478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_017342	TGT	2	6	1331496	1331501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_017342	AGT	2	6	1331507	1331512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5589	NC_017342	TTA	2	6	1331574	1331579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_017342	GGC	2	6	1331985	1331990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5592	NC_017342	A	6	6	1334417	1334422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_017342	TGT	2	6	1334460	1334465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_017342	A	7	7	1335752	1335758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_017342	ATA	2	6	1335785	1335790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_017342	TTAAAA	2	12	1335835	1335846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_017342	TAT	2	6	1335887	1335892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_017342	TAA	2	6	1335897	1335902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017342	ATC	2	6	1335958	1335963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_017342	TCC	2	6	1336717	1336722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_017342	TA	3	6	1336779	1336784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017342	TTA	2	6	1336800	1336805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017342	ATAAC	2	10	1336821	1336830	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5605	NC_017342	TAT	2	6	1336831	1336836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017342	TAT	2	6	1339051	1339056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_017342	TAT	2	6	1339084	1339089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_017342	TGC	2	6	1339100	1339105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_017342	AATT	2	8	1339110	1339117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017342	T	6	6	1339119	1339124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017342	ACT	2	6	1339154	1339159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_017342	TAT	2	6	1340401	1340406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_017342	AAT	2	6	1340467	1340472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017342	ATA	2	6	1340528	1340533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_017342	GTTAGA	2	12	1340749	1340760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_017342	AT	3	6	1340840	1340845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_017342	TA	3	6	1341407	1341412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017342	TGAAA	2	10	1341421	1341430	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_017342	A	6	6	1341447	1341452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017342	GTC	2	6	1341470	1341475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_017342	TTTTAT	2	12	1341502	1341513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017342	A	6	6	1341578	1341583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017342	A	6	6	1341585	1341590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017342	ATG	2	6	1341597	1341602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_017342	TA	3	6	1341681	1341686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_017342	AAG	2	6	1341702	1341707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_017342	AAT	2	6	1342560	1342565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_017342	TAA	2	6	1342617	1342622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_017342	GAT	2	6	1342663	1342668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017342	T	6	6	1342676	1342681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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