MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TCH60 chromosome

Total Repeats: 11288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017342	CCAA	2	8	1098477	1098484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_017342	TAA	3	9	1098514	1098522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_017342	ACA	2	6	1098524	1098529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_017342	CAGC	2	8	1098545	1098552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_017342	CAG	3	9	1098561	1098569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017342	CAG	2	6	1098576	1098581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_017342	AGC	2	6	1098589	1098594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_017342	ACA	2	6	1098650	1098655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_017342	TGA	2	6	1098664	1098669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017342	AACTGT	2	12	1098706	1098717	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4511	NC_017342	ATTA	2	8	1098742	1098749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017342	ATTT	2	8	1105476	1105483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017342	GTGGCT	2	12	1105592	1105603	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4514	NC_017342	ATT	2	6	1105618	1105623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017342	CATA	2	8	1105643	1105650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4516	NC_017342	T	6	6	1105683	1105688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_017342	ACT	2	6	1105723	1105728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_017342	ATT	2	6	1105731	1105736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_017342	CAAA	2	8	1105775	1105782	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_017342	ATTT	2	8	1109499	1109506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017342	AAT	2	6	1111280	1111285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_017342	AAAT	2	8	1111335	1111342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_017342	AT	3	6	1111368	1111373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_017342	GAG	2	6	1111413	1111418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_017342	CGG	2	6	1111437	1111442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_017342	TTA	2	6	1111474	1111479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_017342	TAA	2	6	1111513	1111518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_017342	A	6	6	1111539	1111544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_017342	GAT	2	6	1111623	1111628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_017342	TAT	2	6	1111645	1111650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_017342	T	6	6	1113542	1113547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_017342	AATC	2	8	1113550	1113557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4533	NC_017342	ATTAAA	2	12	1113562	1113573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_017342	T	6	6	1113614	1113619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017342	AGT	2	6	1113673	1113678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017342	TTAT	2	8	1113679	1113686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_017342	ACTA	2	8	1114564	1114571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_017342	TTAA	2	8	1114585	1114592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_017342	TTAT	2	8	1115488	1115495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_017342	ATTTA	2	10	1115497	1115506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_017342	TCT	2	6	1115610	1115615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_017342	TCTT	2	8	1115621	1115628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_017342	AT	3	6	1115633	1115638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017342	GAA	2	6	1115644	1115649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017342	AAC	2	6	1115742	1115747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_017342	AAC	2	6	1115790	1115795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_017342	TAAG	2	8	1115843	1115850	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017342	T	6	6	1115872	1115877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017342	ACATTC	2	12	1115878	1115889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_017342	T	6	6	1115909	1115914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017342	TAG	2	6	1115962	1115967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017342	A	7	7	1115988	1115994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017342	AAT	2	6	1116317	1116322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017342	AGT	2	6	1116325	1116330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017342	TA	4	8	1116339	1116346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017342	CTTT	2	8	1116385	1116392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4557	NC_017342	TGA	2	6	1116409	1116414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017342	TTG	2	6	1116434	1116439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017342	ATA	2	6	1116472	1116477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017342	TCA	2	6	1116490	1116495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_017342	TA	3	6	1116504	1116509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017342	AGGAT	2	10	1116622	1116631	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017342	AAT	2	6	1116642	1116647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017342	CTT	2	6	1116729	1116734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_017342	A	6	6	1116746	1116751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017342	AAATT	2	10	1116756	1116765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_017342	ATG	2	6	1116771	1116776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_017342	GAA	2	6	1116794	1116799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_017342	A	6	6	1116857	1116862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_017342	TGG	2	6	1116928	1116933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_017342	TAA	2	6	1116943	1116948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_017342	GTT	2	6	1116971	1116976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_017342	TGA	2	6	1117015	1117020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_017342	A	6	6	1117068	1117073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017342	TAAA	2	8	1117116	1117123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017342	TACT	2	8	1117225	1117232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_017342	AT	3	6	1117237	1117242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_017342	TAA	2	6	1117290	1117295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_017342	CAG	2	6	1117311	1117316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_017342	TA	3	6	1117353	1117358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017342	AT	3	6	1117380	1117385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017342	AGAA	2	8	1117408	1117415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_017342	AAC	2	6	1117422	1117427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_017342	TGC	2	6	1117459	1117464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_017342	AAC	2	6	1117488	1117493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_017342	GTT	2	6	1117498	1117503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_017342	GTG	2	6	1118611	1118616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017342	CCT	2	6	1118617	1118622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_017342	TTC	2	6	1118624	1118629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_017342	A	6	6	1118646	1118651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017342	TAA	2	6	1118675	1118680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017342	ATTA	2	8	1118683	1118690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_017342	ATA	2	6	1118751	1118756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017342	TAA	2	6	1118770	1118775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_017342	CAT	2	6	1118782	1118787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_017342	A	6	6	1118818	1118823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017342	AT	3	6	1120211	1120216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017342	AGT	2	6	1120234	1120239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017342	AAT	2	6	1120304	1120309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_017342	T	7	7	1121045	1121051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_017342	ATG	2	6	1121056	1121061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_017342	GTT	2	6	1121139	1121144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_017342	AG	3	6	1121198	1121203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_017342	TAA	2	6	1122374	1122379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_017342	CAG	2	6	1122668	1122673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_017342	TTG	2	6	1122696	1122701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_017342	TAG	2	6	1122737	1122742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017342	TTG	2	6	1122754	1122759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_017342	TA	3	6	1122763	1122768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017342	TAAT	2	8	1122777	1122784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_017342	AAGC	2	8	1122865	1122872	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_017342	AT	3	6	1122884	1122889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017342	T	6	6	1122928	1122933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017342	AT	3	6	1122994	1122999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017342	AATA	2	8	1123000	1123007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_017342	TG	4	8	1123048	1123055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017342	TTG	2	6	1123079	1123084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_017342	ACTT	2	8	1123102	1123109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4619	NC_017342	AAG	2	6	1124697	1124702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017342	A	6	6	1124746	1124751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_017342	TAA	2	6	1124813	1124818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017342	ATA	2	6	1124819	1124824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_017342	ATA	2	6	1124928	1124933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_017342	TAAA	2	8	1124971	1124978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_017342	A	6	6	1124976	1124981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_017342	AATA	2	8	1124992	1124999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_017342	AAAT	2	8	1125010	1125017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_017342	ATA	2	6	1125558	1125563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_017342	GAT	2	6	1125573	1125578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_017342	AGAT	2	8	1125618	1125625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_017342	AAT	2	6	1125629	1125634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4633	NC_017342	TATAA	2	10	1125676	1125685	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4894	NC_017342	TAA	2	6	1186147	1186152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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