MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017341	ATAAAT	2	12	2776	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017341	TAAATC	2	12	16638	16649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017341	ATTTAT	2	12	37648	37659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017341	AAAAAT	2	12	43799	43810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017341	ATTTGG	2	12	63040	63051	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017341	AATATA	2	12	94634	94645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017341	TTAACA	2	12	104492	104503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017341	TAAGAA	2	12	126862	126873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017341	GTTTTT	2	12	140928	140939	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017341	TTTATA	2	12	189300	189311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017341	ATTAAT	2	12	189323	189334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017341	AAATTT	2	12	213839	213850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017341	AGTGGA	2	12	249207	249218	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017341	ATATAG	2	12	270974	270985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017341	ATAATT	2	12	277245	277256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017341	AATTAT	2	12	284667	284678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017341	AACGAT	2	12	287371	287382	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017341	TAACTT	2	12	295746	295757	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017341	GTAAAA	2	12	341742	341753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017341	TAAAAT	2	12	347665	347676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017341	ATATGA	2	12	347709	347720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017341	TTCATT	2	12	352164	352175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017341	TTGTAA	2	12	357467	357478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017341	TTAAAA	2	12	390676	390687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017341	AATAAA	2	12	393735	393746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017341	TAAAAT	2	12	404059	404070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017341	AATTAT	2	12	404815	404826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017341	AATGTA	2	12	410094	410105	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017341	AATTTG	2	12	410201	410212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017341	TAAAGA	2	12	412174	412185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017341	TTTTAT	2	12	454923	454934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017341	TTGAAA	2	12	461765	461776	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017341	TGTATA	2	12	477161	477172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017341	TTTTTA	2	12	490339	490350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017341	AAAATG	2	12	495772	495783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017341	ACGTTG	2	12	516219	516230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017341	AAAATA	2	12	516943	516954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017341	GTTGGT	2	12	518298	518309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017341	GCTATT	2	12	518370	518381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017341	TATGGT	2	12	525082	525093	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017341	TTATAA	2	12	536258	536269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017341	AAATTT	2	12	543017	543028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017341	TTATAA	2	12	598157	598168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017341	GTTATA	2	12	598828	598839	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017341	CTTAAA	2	12	607260	607271	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017341	ACATGT	2	12	617231	617242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017341	ACTGCA	2	12	624852	624863	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017341	TTAAAA	2	12	625248	625259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017341	TCAGAT	2	12	626754	626765	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017341	GACTCA	2	12	626799	626810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017341	GATTCA	2	12	626817	626828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017341	GACTCA	2	12	626835	626846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017341	GACTCA	2	12	626871	626882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017341	GACTCA	2	12	626907	626918	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017341	TCAGAT	2	12	626927	626938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017341	GATTCA	2	12	626960	626971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017341	TCAGAC	2	12	627005	627016	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017341	GACTCA	2	12	627020	627031	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017341	GATTCA	2	12	627038	627049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017341	GACTCA	2	12	627056	627067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017341	GACTCA	2	12	627074	627085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017341	GATTCA	2	12	627110	627121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017341	TCAGAT	2	12	627131	627142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017341	TCAGAT	2	12	627167	627178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017341	GATTCA	2	12	627182	627193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017341	ATTGCG	2	12	646386	646397	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017341	AATGAT	2	12	650304	650315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017341	TAGATG	2	12	650377	650388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017341	TAAAAT	2	12	665698	665709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017341	GTAAAA	2	12	672213	672224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017341	TTTTAA	2	12	679136	679147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017341	CATCAA	2	12	705845	705856	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017341	TAATTT	2	12	710085	710096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017341	TGAATA	2	12	726563	726574	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017341	GGATTC	2	12	737914	737925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017341	AAATAT	2	12	740706	740717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017341	TTAAAA	2	12	752709	752720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017341	TAGTTA	2	12	757144	757155	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017341	TTTTTA	2	12	775419	775430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017341	TGAAAA	2	12	783661	783672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017341	TTTTAC	2	12	820902	820913	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017341	ACAAAA	2	12	853989	854000	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017341	GTTCTT	2	12	872182	872193	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017341	TTCTTT	2	12	872213	872224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017341	TAAAAA	2	12	873131	873142	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017341	TATCAA	2	12	879631	879642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017341	TTTTGA	2	12	883403	883414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017341	TCATTT	2	12	889396	889407	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017341	TAATTA	2	12	908148	908159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017341	ACTAAA	2	12	913986	913997	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017341	ATTTTG	2	12	917222	917233	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017341	AAATTA	2	12	920756	920767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017341	AAGCAC	2	12	929487	929498	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017341	TAAAAT	2	12	937163	937174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017341	TTTAAT	2	12	1010569	1010580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017341	GTAAAA	2	12	1023820	1023831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017341	ACAATA	2	12	1029297	1029308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017341	AACGGA	2	12	1043819	1043830	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017341	AAAAGC	2	12	1048418	1048429	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017341	CATTTA	2	12	1073749	1073760	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017341	GTAAAA	2	12	1073815	1073826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017341	ATCATA	2	12	1076977	1076988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017341	TCAAAA	2	12	1083485	1083496	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017341	ATTGCA	2	12	1084564	1084575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017341	TTTTCT	2	12	1097292	1097303	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017341	TTTATA	2	12	1133305	1133316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017341	GAATTA	2	12	1139878	1139889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017341	ATTTTT	2	12	1157257	1157268	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017341	ATAATT	2	12	1158054	1158065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017341	TAATGA	2	12	1171093	1171104	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017341	ATTTAT	2	12	1190049	1190060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017341	ATTATA	2	12	1193967	1193978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017341	AAATTT	2	12	1194776	1194787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017341	AAGTAA	2	12	1216479	1216490	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017341	TCGTTT	2	12	1219606	1219617	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017341	TTAATT	2	12	1230322	1230333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017341	AATTAA	2	12	1233058	1233069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017341	GAAATT	2	12	1277966	1277977	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017341	AATGAT	2	12	1290741	1290752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017341	TTTCAT	2	12	1321026	1321037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017341	TATATT	2	12	1325685	1325696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017341	CATATT	2	12	1350754	1350765	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017341	ATGTAT	2	12	1351375	1351386	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017341	AAAGAA	2	12	1351607	1351618	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017341	TTTTAC	2	12	1354275	1354286	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017341	TTAAAG	2	12	1357991	1358002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017341	TTTTAC	2	12	1368653	1368664	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017341	ATTAAA	2	12	1387930	1387941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017341	ATATAA	2	12	1395911	1395922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017341	GTAAAA	2	12	1407490	1407501	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017341	AAAATA	2	12	1411311	1411322	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_017341	TAAAAT	2	12	1442633	1442644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_017341	AAATTT	2	12	2621250	2621261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_017341	ATTTTT	2	12	2644797	2644808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017341	ATTTTG	2	12	2657299	2657310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_017341	CTCTTT	2	12	2667900	2667911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_017341	ATTTAA	2	12	2670378	2670389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017341	AATTAA	2	12	2674879	2674890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017341	TTTCAA	2	12	2675062	2675073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
257	NC_017341	TCAAAA	2	12	2684970	2684981	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_017341	ATTTCG	2	12	2687158	2687169	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_017341	TTTTGT	2	12	2698622	2698633	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017341	CAATTG	2	12	2715374	2715385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
261	NC_017341	GTAAAA	2	12	2726722	2726733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017341	ATTTAT	3	18	2738284	2738301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017341	TTTGAA	2	12	2742744	2742755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017341	TTTTTG	2	12	2745542	2745553	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017341	TTATTT	2	12	2751585	2751596	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017341	TCATTT	2	12	2780294	2780305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
267	NC_017341	GTAAAT	2	12	2795645	2795656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017341	TAGTAT	2	12	2805611	2805622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017341	GTTAAA	2	12	2810191	2810202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017341	TTAATT	2	12	2814614	2814625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017341	ATTGTT	2	12	2815028	2815039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_017341	CTATTT	2	12	2890271	2890282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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277	NC_017341	ATATAA	2	12	2917828	2917839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.