MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017341	TTA	2	6	844643	844648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017341	TAG	2	6	844662	844667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017341	AAAGA	2	10	844668	844677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017341	AGT	2	6	844716	844721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017341	TAT	2	6	844777	844782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017341	TTGT	2	8	844916	844923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017341	TTGT	2	8	844971	844978	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017341	AT	3	6	845029	845034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017341	AAGC	2	8	845100	845107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_017341	TGAT	2	8	845118	845125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017341	ATA	2	6	845139	845144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017341	AAT	2	6	845147	845152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017341	ATTT	2	8	845164	845171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017341	TGATA	2	10	845204	845213	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017341	AGA	2	6	845214	845219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017341	TAT	2	6	848995	849000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017341	TAA	2	6	849018	849023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017341	GAG	2	6	849025	849030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017341	TAA	2	6	849035	849040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017341	ATT	2	6	850009	850014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017341	ATTT	2	8	850020	850027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017341	TCA	2	6	850036	850041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017341	AAT	2	6	850051	850056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017341	TTAAA	2	10	850066	850075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017341	TA	3	6	850082	850087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017341	T	7	7	850137	850143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017341	TAT	2	6	850210	850215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017341	ATT	2	6	850350	850355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017341	ATT	2	6	850406	850411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017341	A	6	6	850576	850581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017341	TTG	2	6	850584	850589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017341	TTCA	2	8	850600	850607	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_017341	ACT	2	6	850612	850617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017341	AATAT	2	10	850621	850630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017341	ATG	2	6	850674	850679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017341	AAAT	2	8	850714	850721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017341	CAT	2	6	850766	850771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017341	A	6	6	850791	850796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017341	TATGA	2	10	852721	852730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017341	A	7	7	852744	852750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017341	T	6	6	853795	853800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017341	AAT	2	6	853822	853827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017341	ACTA	2	8	853833	853840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_017341	CAT	2	6	853912	853917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017341	TAAT	2	8	853954	853961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017341	ACAAAA	2	12	853989	854000	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4047	NC_017341	ATAA	2	8	854006	854013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017341	GTATT	2	10	854049	854058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017341	TTA	2	6	854059	854064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017341	CCT	2	6	854071	854076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_017341	AAT	2	6	854292	854297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017341	TTA	2	6	854307	854312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017341	AGG	2	6	854315	854320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017341	AAT	2	6	854976	854981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017341	TGAA	2	8	855013	855020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017341	TTTG	2	8	855088	855095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017341	ACATT	2	10	855109	855118	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4058	NC_017341	TGT	2	6	855128	855133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017341	TAA	2	6	856101	856106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017341	ATT	2	6	856109	856114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017341	GTT	2	6	856115	856120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017341	ATT	2	6	856133	856138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017341	AAT	2	6	856144	856149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017341	T	7	7	856161	856167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017341	TAA	2	6	856179	856184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017341	TAA	2	6	856200	856205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017341	TAG	2	6	856295	856300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017341	TATT	2	8	856333	856340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_017341	T	6	6	856376	856381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017341	AACAC	2	10	856434	856443	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4071	NC_017341	TGT	2	6	856483	856488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017341	A	7	7	856519	856525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017341	TTA	2	6	856549	856554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017341	AT	3	6	856564	856569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017341	ACT	2	6	856573	856578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_017341	GAA	2	6	856639	856644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017341	TTA	2	6	856663	856668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017341	CAAA	2	8	857402	857409	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_017341	GACA	2	8	857423	857430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_017341	AATT	2	8	857435	857442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017341	GA	3	6	857490	857495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017341	TAGT	2	8	857507	857514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017341	TATT	2	8	857515	857522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017341	ATTT	2	8	857537	857544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017341	TGAG	2	8	857545	857552	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017341	ATTT	2	8	857580	857587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017341	CGT	2	6	857588	857593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017341	A	6	6	857667	857672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017341	TTCG	2	8	857691	857698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_017341	ACT	3	9	857703	857711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_017341	ATA	2	6	857760	857765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017341	AATAA	2	10	857814	857823	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017341	TTG	2	6	857830	857835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017341	AT	3	6	857851	857856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017341	ATT	2	6	857874	857879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017341	AATAG	2	10	857914	857923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_017341	AGG	2	6	859088	859093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017341	ATTA	2	8	860162	860169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017341	TA	3	6	860216	860221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017341	AGG	2	6	860238	860243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017341	T	6	6	863884	863889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017341	ATA	2	6	863894	863899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017341	TAA	2	6	863935	863940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017341	ATT	2	6	865319	865324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017341	TAAAT	2	10	865334	865343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017341	T	6	6	865419	865424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017341	TAA	2	6	865451	865456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017341	TAA	2	6	865469	865474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017341	TAA	2	6	865506	865511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017341	TTA	2	6	865553	865558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017341	TAAA	2	8	865570	865577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017341	AT	3	6	865599	865604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017341	GAG	2	6	865605	865610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017341	TAC	2	6	866107	866112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017341	TA	3	6	866119	866124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017341	GGA	2	6	866131	866136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017341	T	6	6	866401	866406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017341	AT	3	6	866451	866456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017341	AGG	2	6	867254	867259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017341	TTTG	2	8	870195	870202	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017341	TAT	2	6	870206	870211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017341	TCA	2	6	870280	870285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_017341	AC	4	8	870286	870293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_017341	TAA	2	6	870300	870305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017341	AAT	2	6	870320	870325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017341	AGA	2	6	870439	870444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_017341	CAT	2	6	870461	870466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_017341	ATG	2	6	870488	870493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017341	AC	3	6	870513	870518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_017341	CCG	2	6	870562	870567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_017341	T	6	6	870607	870612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017341	TGT	2	6	870650	870655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_017341	GGA	2	6	870697	870702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_017341	TG	3	6	870754	870759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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