MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017341	ATC	2	6	637287	637292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_017341	ACA	2	6	638876	638881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_017341	T	6	6	638895	638900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017341	ATA	2	6	638914	638919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017341	CTT	2	6	638928	638933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017341	TTTA	2	8	638950	638957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017341	ACA	2	6	638962	638967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017341	TAG	2	6	638988	638993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017341	TCAA	2	8	638998	639005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_017341	AT	3	6	639015	639020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017341	TAA	2	6	639106	639111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017341	CCT	2	6	640719	640724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_017341	ATT	2	6	641165	641170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017341	AATT	2	8	641175	641182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017341	T	6	6	641229	641234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017341	TTG	2	6	641254	641259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017341	ATG	2	6	641287	641292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_017341	ATGA	2	8	641308	641315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017341	TTAA	2	8	642131	642138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017341	GAT	2	6	642187	642192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017341	ATA	2	6	643395	643400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017341	ATT	2	6	643426	643431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017341	T	7	7	643430	643436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017341	ATA	2	6	643443	643448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017341	AAT	2	6	643466	643471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017341	AAAT	2	8	644233	644240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017341	TTA	2	6	644243	644248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017341	ATTT	2	8	644291	644298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017341	AAAT	2	8	644305	644312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017341	TG	3	6	644403	644408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017341	GAT	2	6	644451	644456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017341	ATT	3	9	644463	644471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017341	AACA	2	8	644535	644542	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_017341	TA	3	6	644555	644560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017341	TAA	2	6	646049	646054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017341	TA	3	6	646072	646077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_017341	TAG	2	6	646091	646096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017341	TAA	2	6	646146	646151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017341	TA	3	6	646160	646165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017341	ATT	2	6	646332	646337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017341	ATTGCG	2	12	646386	646397	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3042	NC_017341	CTT	2	6	646402	646407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017341	TA	3	6	646413	646418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017341	TAA	2	6	646438	646443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017341	A	6	6	646442	646447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017341	TAC	2	6	646453	646458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_017341	TA	3	6	646533	646538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017341	TGAG	2	8	646570	646577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017341	ATTA	2	8	649740	649747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017341	TTA	3	9	649784	649792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017341	TTTC	2	8	649821	649828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3052	NC_017341	ATA	3	9	649855	649863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017341	TAA	2	6	649881	649886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017341	ATT	2	6	649894	649899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017341	CCT	2	6	650095	650100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_017341	TTATA	2	10	650115	650124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017341	TG	3	6	650138	650143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_017341	TAAA	2	8	650220	650227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017341	TA	3	6	650228	650233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017341	AT	3	6	650272	650277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017341	AG	3	6	650282	650287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017341	AATGAT	2	12	650304	650315	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017341	TAGATG	2	12	650377	650388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017341	TGTA	2	8	650402	650409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_017341	TAA	2	6	650443	650448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017341	TA	3	6	650477	650482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017341	ATG	2	6	650489	650494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017341	A	7	7	650500	650506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017341	CACAT	2	10	650511	650520	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3070	NC_017341	GTG	2	6	650545	650550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017341	TAA	2	6	650555	650560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017341	ATA	3	9	651437	651445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017341	TCA	2	6	651452	651457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017341	TGA	2	6	651501	651506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_017341	TTG	2	6	651507	651512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017341	TCAT	2	8	651520	651527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_017341	CAA	2	6	652646	652651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017341	TAA	2	6	652691	652696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017341	TTA	2	6	652740	652745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017341	TA	3	6	652755	652760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_017341	TAA	2	6	653187	653192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017341	AAT	2	6	653194	653199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_017341	CTT	2	6	654769	654774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_017341	T	6	6	654797	654802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017341	TAT	2	6	654804	654809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017341	TA	4	8	654842	654849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017341	GATA	2	8	655253	655260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017341	AGA	2	6	655290	655295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017341	TCA	2	6	656120	656125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_017341	GTT	2	6	656198	656203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017341	A	6	6	656213	656218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017341	TAA	3	9	656238	656246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017341	TAG	2	6	656260	656265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_017341	ATT	2	6	656297	656302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_017341	A	7	7	656304	656310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017341	ATA	2	6	656351	656356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017341	TAG	2	6	656433	656438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017341	ACT	2	6	656459	656464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017341	ATA	2	6	656505	656510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_017341	AT	4	8	656520	656527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017341	T	7	7	656635	656641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017341	ATC	2	6	657441	657446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_017341	TAA	2	6	657558	657563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017341	AGG	2	6	657576	657581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017341	CAT	2	6	659516	659521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_017341	ATGAT	2	10	659535	659544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017341	ATA	2	6	659549	659554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017341	TAA	2	6	659559	659564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017341	TA	4	8	659607	659614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017341	GAAA	2	8	659629	659636	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017341	TAG	2	6	659666	659671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017341	TA	3	6	659678	659683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017341	ATT	3	9	659689	659697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017341	GTA	2	6	659699	659704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017341	AGTT	2	8	659806	659813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017341	ATA	2	6	659863	659868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_017341	AAT	2	6	659871	659876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017341	ATG	2	6	659930	659935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017341	TAA	2	6	659944	659949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017341	AAT	2	6	659955	659960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017341	ATC	2	6	663016	663021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017341	TAATT	2	10	663022	663031	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017341	AGA	2	6	663032	663037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_017341	T	6	6	663049	663054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017341	A	7	7	663080	663086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017341	ATAG	2	8	663103	663110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017341	A	6	6	663119	663124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017341	CGA	2	6	663135	663140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_017341	AAAG	2	8	663153	663160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_017341	GCA	2	6	663524	663529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_017341	CCA	2	6	663544	663549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_017341	TGA	2	6	665422	665427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017341	TATG	2	8	665484	665491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017341	GATA	2	8	665496	665503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_017341	ATG	3	9	665542	665550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_017341	ATG	2	6	665603	665608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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