MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017341	TTTG	2	8	385571	385578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017341	ATT	2	6	385615	385620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_017341	T	6	6	385619	385624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017341	AT	3	6	385672	385677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_017341	TGT	2	6	385683	385688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017341	TA	3	6	386564	386569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017341	TAAA	2	8	386589	386596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017341	AT	3	6	386624	386629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017341	TA	3	6	386652	386657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_017341	AT	3	6	386678	386683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017341	TTAA	2	8	388947	388954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017341	TA	3	6	388959	388964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017341	AGA	2	6	388968	388973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017341	ACC	2	6	389215	389220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_017341	TAT	2	6	389228	389233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017341	AGT	2	6	389319	389324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017341	ATT	3	9	389329	389337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017341	ATT	2	6	389386	389391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017341	AGG	2	6	389435	389440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017341	A	6	6	390297	390302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017341	AGG	2	6	390310	390315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017341	CA	3	6	390316	390321	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_017341	GTT	2	6	390610	390615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_017341	T	6	6	390646	390651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_017341	TGA	2	6	390670	390675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017341	TTAAAA	2	12	390676	390687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017341	A	7	7	390684	390690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017341	AAT	2	6	390697	390702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017341	ATA	2	6	390732	390737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_017341	TA	3	6	390758	390763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017341	ATT	3	9	390779	390787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_017341	ATG	2	6	391530	391535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_017341	TAT	2	6	391572	391577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017341	TA	3	6	391584	391589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017341	AATA	2	8	391594	391601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_017341	TTTA	2	8	391610	391617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_017341	CCT	2	6	392854	392859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_017341	GTA	2	6	392910	392915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017341	GTA	2	6	392955	392960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017341	GTA	2	6	392967	392972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017341	TATT	2	8	392984	392991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017341	ATA	2	6	393672	393677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017341	ATT	2	6	393682	393687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_017341	AAG	2	6	393702	393707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_017341	AATAAA	2	12	393735	393746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_017341	AT	3	6	393750	393755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017341	ACA	2	6	394410	394415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_017341	TTA	2	6	395301	395306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017341	TGT	2	6	395321	395326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017341	TA	3	6	397612	397617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017341	AT	3	6	397639	397644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_017341	TA	3	6	397717	397722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017341	AAGT	2	8	397800	397807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_017341	A	6	6	397813	397818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017341	GTG	2	6	399124	399129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017341	TG	3	6	399128	399133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_017341	CAA	2	6	399184	399189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_017341	ATAG	2	8	399200	399207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017341	A	7	7	399220	399226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_017341	ATA	2	6	399267	399272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017341	TA	3	6	399277	399282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017341	A	6	6	399330	399335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017341	AAGTT	2	10	399414	399423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017341	TGTT	2	8	399431	399438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017341	TA	3	6	399523	399528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017341	GTTT	2	8	399574	399581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017341	AAT	2	6	399615	399620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017341	AAAG	2	8	399623	399630	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_017341	AAAG	2	8	399993	400000	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017341	CT	3	6	400697	400702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_017341	GCTAT	2	10	402167	402176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1572	NC_017341	AAC	2	6	402241	402246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_017341	ATA	2	6	402261	402266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017341	TGG	2	6	402268	402273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_017341	GAG	2	6	402278	402283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017341	AATAA	2	10	402288	402297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_017341	AGG	2	6	402298	402303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_017341	TTAT	2	8	402336	402343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_017341	TAT	2	6	402366	402371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_017341	AT	4	8	402370	402377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_017341	T	6	6	403408	403413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017341	T	7	7	403434	403440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017341	CGT	2	6	403520	403525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017341	AC	3	6	403981	403986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_017341	T	6	6	403991	403996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_017341	TAAAAT	2	12	404059	404070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_017341	TAT	2	6	404778	404783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_017341	AT	3	6	404782	404787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017341	ATTA	2	8	404801	404808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_017341	AATTAT	2	12	404815	404826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_017341	T	6	6	404884	404889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017341	AAACT	2	10	404910	404919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1593	NC_017341	GTT	2	6	404940	404945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_017341	T	6	6	404961	404966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017341	TTG	2	6	405049	405054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017341	GTT	2	6	405129	405134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_017341	A	6	6	405144	405149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017341	GTA	2	6	405177	405182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017341	ATT	2	6	405292	405297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017341	TA	3	6	405311	405316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_017341	AGA	2	6	405319	405324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017341	AAT	2	6	405327	405332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017341	AT	3	6	405331	405336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017341	A	6	6	405406	405411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017341	GAT	2	6	405413	405418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017341	ATA	2	6	405470	405475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_017341	A	7	7	405491	405497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_017341	TAAA	2	8	405511	405518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017341	CTT	2	6	405529	405534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_017341	TCA	2	6	406600	406605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017341	TG	3	6	406632	406637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017341	T	8	8	406650	406657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017341	AT	3	6	406723	406728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_017341	ATG	2	6	406733	406738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_017341	CGT	2	6	406748	406753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1617	NC_017341	TAA	2	6	406793	406798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_017341	CT	3	6	406854	406859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_017341	CTT	2	6	406944	406949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_017341	T	6	6	406983	406988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017341	CT	3	6	407049	407054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_017341	TCT	2	6	407203	407208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017341	TTA	2	6	407215	407220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017341	TTGC	2	8	407285	407292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_017341	TTA	2	6	407356	407361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017341	TAT	2	6	407427	407432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_017341	AGG	2	6	407466	407471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017341	TA	4	8	408109	408116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017341	CTTT	2	8	408165	408172	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_017341	CAT	2	6	408187	408192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_017341	AAT	2	6	408234	408239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017341	CTT	2	6	408293	408298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_017341	ATA	2	6	408307	408312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_017341	CAT	2	6	408370	408375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_017341	GTT	2	6	408414	408419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_017341	ACGA	2	8	408869	408876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1637	NC_017341	TAA	2	6	408911	408916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_017341	AG	4	8	408995	409002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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