MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017341	AATT	2	8	251037	251044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017341	GTA	2	6	251045	251050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017341	AAAT	2	8	251065	251072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017341	AT	4	8	251117	251124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017341	TGT	2	6	251529	251534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017341	GAC	2	6	251540	251545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017341	AAAT	2	8	251547	251554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017341	ATT	2	6	251566	251571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017341	A	6	6	251590	251595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017341	AAAGT	2	10	251606	251615	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017341	CTC	2	6	252986	252991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_017341	ATT	2	6	253011	253016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017341	CTA	2	6	253017	253022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017341	AATT	2	8	253038	253045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017341	ATAA	2	8	253059	253066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017341	T	6	6	253101	253106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017341	CGA	2	6	253152	253157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017341	GC	3	6	253160	253165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_017341	ATTT	2	8	253166	253173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017341	A	6	6	253183	253188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017341	TTG	2	6	253191	253196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017341	A	6	6	253206	253211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017341	ATA	2	6	253221	253226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017341	AAT	2	6	253243	253248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017341	TAAAA	2	10	253318	253327	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017341	AAAT	2	8	253332	253339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017341	AAAT	2	8	253390	253397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017341	AGC	2	6	253485	253490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017341	A	6	6	254555	254560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017341	GTT	2	6	254628	254633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017341	AAATT	2	10	254635	254644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017341	TTC	2	6	254843	254848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017341	AGT	2	6	254940	254945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017341	TGA	2	6	254967	254972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017341	CAA	2	6	255040	255045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017341	TTG	2	6	255074	255079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017341	TGC	2	6	255080	255085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017341	AAATT	2	10	255114	255123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017341	GTTT	2	8	255193	255200	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017341	CAT	2	6	255289	255294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_017341	AAG	2	6	255311	255316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017341	ACAA	2	8	255344	255351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_017341	AAACT	2	10	255353	255362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_017341	AGTG	2	8	255394	255401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017341	CCG	2	6	255419	255424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017341	T	6	6	255430	255435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017341	CAC	2	6	255474	255479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_017341	CAT	2	6	255490	255495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017341	TAA	2	6	255498	255503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017341	AC	3	6	255525	255530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_017341	AAT	2	6	255534	255539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017341	AGA	2	6	255573	255578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017341	ACC	2	6	255622	255627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_017341	GTAA	2	8	255648	255655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017341	A	6	6	255654	255659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017341	ATG	2	6	255661	255666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017341	CCAC	2	8	255743	255750	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1058	NC_017341	CCA	2	6	255848	255853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_017341	GGT	2	6	255869	255874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017341	TGT	2	6	255894	255899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017341	ATA	2	6	255914	255919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017341	TAA	2	6	256027	256032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017341	TAC	2	6	256161	256166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_017341	TAA	2	6	256198	256203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017341	CAC	2	6	256254	256259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_017341	CAA	2	6	256267	256272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017341	CTG	2	6	256324	256329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017341	TCA	2	6	256350	256355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017341	ATT	2	6	256368	256373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017341	AT	4	8	256405	256412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017341	T	6	6	256534	256539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017341	CAC	2	6	256656	256661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_017341	ATAA	2	8	256662	256669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017341	AAC	2	6	256689	256694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017341	AT	4	8	256708	256715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017341	TTAA	2	8	257659	257666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017341	A	6	6	257849	257854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017341	TGT	2	6	257872	257877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017341	ATG	2	6	257890	257895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_017341	AGG	2	6	257977	257982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017341	GGA	2	6	260548	260553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1084	NC_017341	AT	3	6	261042	261047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017341	AGGG	2	8	261051	261058	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_017341	TAA	2	6	264841	264846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017341	TAT	2	6	264855	264860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017341	AT	3	6	264862	264867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017341	ATG	2	6	264874	264879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017341	TAA	2	6	264884	264889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017341	AAC	2	6	264966	264971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1097	NC_017341	ATG	2	6	265113	265118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017341	AT	3	6	268599	268604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017341	AAG	2	6	268641	268646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017341	ATG	2	6	268676	268681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017341	A	7	7	268752	268758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017341	CAG	2	6	268759	268764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017341	CTG	2	6	268795	268800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017341	TGA	2	6	268886	268891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017341	TTG	2	6	268937	268942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017341	TAC	2	6	269022	269027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017341	A	6	6	269062	269067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017341	TTG	2	6	269183	269188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017341	A	6	6	269208	269213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017341	T	6	6	269395	269400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017341	CATA	2	8	269518	269525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_017341	A	6	6	270746	270751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017341	ATTA	2	8	270758	270765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017341	ATAA	2	8	270776	270783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017341	TTA	2	6	270807	270812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017341	AAT	2	6	270965	270970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017341	ATATAG	2	12	270974	270985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017341	GGA	2	6	270992	270997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017341	TA	3	6	274454	274459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017341	TTTTA	2	10	276249	276258	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017341	GAG	2	6	276331	276336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017341	CAG	2	6	277061	277066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017341	ATA	2	6	277089	277094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017341	CAT	2	6	277105	277110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017341	GAAAA	2	10	277116	277125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017341	T	6	6	277192	277197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017341	AAT	2	6	277198	277203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017341	TAT	2	6	277227	277232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017341	ATAAA	2	10	277234	277243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017341	ATAATT	2	12	277245	277256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017341	T	8	8	279779	279786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017341	AGG	2	6	279874	279879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017341	ATA	2	6	281039	281044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017341	TTA	2	6	281061	281066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017341	A	7	7	281071	281077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017341	TATT	2	8	281121	281128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017341	CGTT	2	8	281158	281165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1264	NC_017341	GAT	2	6	321607	321612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1273	NC_017341	ATTT	2	8	321807	321814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_017341	AAG	2	6	321819	321824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_017341	TA	3	6	352215	352220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_017341	AAT	2	6	352248	352253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_017341	TAAG	2	8	353324	353331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_017341	CCT	2	6	354755	354760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1419	NC_017341	TCC	2	6	357458	357463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1420	NC_017341	TTGTAA	2	12	357467	357478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_017341	TTAG	2	8	357627	357634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_017341	TGG	2	6	357648	357653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_017341	TCGG	2	8	359574	359581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1429	NC_017341	AT	3	6	360122	360127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_017341	GATAA	2	10	360136	360145	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_017341	T	6	6	360159	360164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_017341	TCC	2	6	361533	361538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1433	NC_017341	A	6	6	361661	361666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_017341	ATT	2	6	361699	361704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_017341	T	6	6	361789	361794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_017341	ATT	2	6	366553	366558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_017341	GAT	2	6	366567	366572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1446	NC_017341	TAT	2	6	366616	366621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_017341	ATA	2	6	366645	366650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_017341	ATA	2	6	366674	366679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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