MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017341	GAT	2	6	2812824	2812829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_017341	T	6	6	2812860	2812865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_017341	AAAC	2	8	2812886	2812893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13504	NC_017341	TTA	2	6	2812993	2812998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_017341	GTT	2	6	2813018	2813023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_017341	T	6	6	2813025	2813030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_017341	ATTT	2	8	2813031	2813038	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_017341	TATT	2	8	2813041	2813048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_017341	CCT	2	6	2813110	2813115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13510	NC_017341	CAT	2	6	2813134	2813139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_017341	T	6	6	2813703	2813708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_017341	TA	3	6	2813776	2813781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_017341	AC	3	6	2813800	2813805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13514	NC_017341	ATAA	2	8	2813807	2813814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_017341	TGT	2	6	2813827	2813832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_017341	T	6	6	2813858	2813863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_017341	TTA	2	6	2813877	2813882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_017341	AAT	2	6	2813884	2813889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_017341	ATC	2	6	2813949	2813954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_017341	CATA	2	8	2814024	2814031	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13521	NC_017341	TTA	2	6	2814133	2814138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_017341	CCT	2	6	2814142	2814147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13523	NC_017341	TTA	2	6	2814153	2814158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_017341	AC	3	6	2814191	2814196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13525	NC_017341	CGA	2	6	2814214	2814219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_017341	ATT	2	6	2814230	2814235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_017341	ATC	2	6	2814289	2814294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_017341	AAT	2	6	2814295	2814300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_017341	ATT	2	6	2814302	2814307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_017341	ATT	2	6	2814310	2814315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_017341	TA	3	6	2814336	2814341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_017341	T	6	6	2814358	2814363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_017341	AT	3	6	2814537	2814542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_017341	AAAT	2	8	2814544	2814551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_017341	TAAT	2	8	2814606	2814613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_017341	TTAATT	2	12	2814614	2814625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_017341	AT	3	6	2814689	2814694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_017341	AT	3	6	2814723	2814728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_017341	GTA	2	6	2814735	2814740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_017341	TTAT	2	8	2814758	2814765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_017341	GTAT	2	8	2814788	2814795	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_017341	TCA	2	6	2814838	2814843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_017341	GTTA	2	8	2814874	2814881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_017341	TGT	2	6	2814907	2814912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_017341	TA	3	6	2814935	2814940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_017341	TA	3	6	2814948	2814953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_017341	A	6	6	2814991	2814996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_017341	TTATC	2	10	2815010	2815019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13549	NC_017341	ATTGTT	2	12	2815028	2815039	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_017341	GTA	2	6	2815044	2815049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_017341	ATATA	2	10	2815069	2815078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_017341	TGAT	2	8	2815095	2815102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_017341	A	7	7	2817916	2817922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_017341	TAA	2	6	2817926	2817931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_017341	A	6	6	2817946	2817951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_017341	TCT	2	6	2819554	2819559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_017341	TTCTA	2	10	2819816	2819825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13558	NC_017341	AT	4	8	2819848	2819855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_017341	T	6	6	2819859	2819864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_017341	AGG	2	6	2819958	2819963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_017341	A	7	7	2821401	2821407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13562	NC_017341	T	6	6	2821439	2821444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_017341	T	6	6	2821497	2821502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_017341	T	6	6	2821548	2821553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_017341	CAT	2	6	2821554	2821559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13566	NC_017341	AATTA	2	10	2821596	2821605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_017341	TAT	2	6	2821614	2821619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_017341	T	6	6	2821635	2821640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_017341	TAA	2	6	2822168	2822173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_017341	ATG	2	6	2822197	2822202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_017341	AATT	2	8	2822282	2822289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_017341	TCAC	2	8	2822330	2822337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13573	NC_017341	CAA	2	6	2823211	2823216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13574	NC_017341	A	7	7	2823215	2823221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_017341	A	6	6	2823245	2823250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_017341	A	7	7	2825844	2825850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_017341	TTC	2	6	2825867	2825872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_017341	TA	3	6	2825878	2825883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_017341	TCA	2	6	2825979	2825984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_017341	CAA	2	6	2826006	2826011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_017341	TAAC	2	8	2826019	2826026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13582	NC_017341	ATTAA	2	10	2826029	2826038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_017341	TCA	2	6	2826039	2826044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13584	NC_017341	A	6	6	2826052	2826057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13588	NC_017341	TTA	2	6	2830435	2830440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_017341	TCC	2	6	2831686	2831691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13591	NC_017341	ATA	2	6	2831799	2831804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_017341	ATAA	2	8	2831819	2831826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_017341	T	6	6	2831851	2831856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13594	NC_017341	TGT	2	6	2831880	2831885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_017341	T	6	6	2831892	2831897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_017341	ATGA	2	8	2831908	2831915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_017341	TTCT	2	8	2831923	2831930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13598	NC_017341	A	7	7	2831937	2831943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_017341	GTA	2	6	2831963	2831968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_017341	ACAAA	2	10	2831990	2831999	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13601	NC_017341	TAT	2	6	2832004	2832009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_017341	A	6	6	2832511	2832516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_017341	CATG	2	8	2832523	2832530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13604	NC_017341	ATA	2	6	2832566	2832571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_017341	T	6	6	2832586	2832591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_017341	TAC	2	6	2832649	2832654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13608	NC_017341	CTC	2	6	2832705	2832710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13609	NC_017341	TA	3	6	2832772	2832777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_017341	ATT	2	6	2832796	2832801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_017341	CTT	3	9	2832820	2832828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_017341	TA	3	6	2832832	2832837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_017341	TCC	2	6	2834378	2834383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13614	NC_017341	TAAA	2	8	2834405	2834412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_017341	TTAAT	2	10	2834416	2834425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_017341	ATT	2	6	2834444	2834449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_017341	TATT	2	8	2834452	2834459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_017341	TATT	2	8	2834484	2834491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_017341	TTCTT	2	10	2834494	2834503	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13620	NC_017341	T	6	6	2834502	2834507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_017341	TAAA	2	8	2834526	2834533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13622	NC_017341	ATT	2	6	2834592	2834597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_017341	A	6	6	2834605	2834610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_017341	ACA	2	6	2834616	2834621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13625	NC_017341	AT	4	8	2834643	2834650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_017341	ACT	2	6	2834655	2834660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13627	NC_017341	TA	3	6	2834681	2834686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13628	NC_017341	CAT	2	6	2834716	2834721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13629	NC_017341	A	6	6	2834728	2834733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13630	NC_017341	CAT	2	6	2834747	2834752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13632	NC_017341	TTA	2	6	2835346	2835351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.