MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017341	AACA	2	8	2704659	2704666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13002	NC_017341	GTT	2	6	2704686	2704691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_017341	TAT	2	6	2704742	2704747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_017341	CAA	2	6	2704769	2704774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_017341	ATC	2	6	2704790	2704795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_017341	ATAA	2	8	2704817	2704824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_017341	TTG	2	6	2704845	2704850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_017341	TTCAA	2	10	2704875	2704884	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13009	NC_017341	TAT	2	6	2707812	2707817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_017341	T	7	7	2707848	2707854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_017341	CT	3	6	2707886	2707891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_017341	A	7	7	2707912	2707918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_017341	ATT	2	6	2707924	2707929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017341	ATG	2	6	2707945	2707950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_017341	AAT	2	6	2707958	2707963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_017341	TTA	2	6	2707971	2707976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_017341	CAT	2	6	2708864	2708869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_017341	CTT	2	6	2708907	2708912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_017341	TAT	2	6	2708986	2708991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_017341	GAGGT	2	10	2709016	2709025	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017341	TGA	2	6	2709062	2709067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_017341	CAT	2	6	2709266	2709271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_017341	TTTC	2	8	2709345	2709352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13024	NC_017341	T	9	9	2709372	2709380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_017341	AATC	2	8	2709417	2709424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13026	NC_017341	AATT	2	8	2709449	2709456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_017341	A	6	6	2709486	2709491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_017341	TTA	2	6	2709499	2709504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_017341	TTG	2	6	2709548	2709553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_017341	A	8	8	2709573	2709580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_017341	A	7	7	2709610	2709616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_017341	A	6	6	2710069	2710074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_017341	ATTAT	2	10	2710135	2710144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_017341	TCT	2	6	2710186	2710191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_017341	TAT	2	6	2710197	2710202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_017341	TA	4	8	2710221	2710228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_017341	TAT	2	6	2710240	2710245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_017341	AAT	2	6	2710249	2710254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_017341	AAT	2	6	2710304	2710309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_017341	T	6	6	2710309	2710314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_017341	A	7	7	2710337	2710343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_017341	TGA	2	6	2710377	2710382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_017341	CTA	2	6	2710454	2710459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_017341	TTCGA	2	10	2710472	2710481	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13045	NC_017341	CAT	2	6	2710490	2710495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_017341	TTA	3	9	2710496	2710504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_017341	TA	3	6	2710556	2710561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_017341	TA	4	8	2710566	2710573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_017341	AT	3	6	2710614	2710619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_017341	ATT	2	6	2710655	2710660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_017341	TCA	2	6	2710737	2710742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_017341	TA	3	6	2710764	2710769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_017341	TAT	2	6	2710781	2710786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_017341	TAT	2	6	2711069	2711074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_017341	CT	3	6	2711098	2711103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13056	NC_017341	A	6	6	2711105	2711110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017341	AT	3	6	2711122	2711127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_017341	T	6	6	2711143	2711148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_017341	TTA	3	9	2711189	2711197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_017341	CTT	2	6	2711198	2711203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_017341	AAT	2	6	2711218	2711223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_017341	TAA	3	9	2711224	2711232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_017341	TGT	2	6	2711252	2711257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_017341	CAAG	2	8	2711271	2711278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13065	NC_017341	AAATT	2	10	2711293	2711302	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_017341	ATG	2	6	2711308	2711313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_017341	ATG	2	6	2711319	2711324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_017341	AGA	2	6	2711330	2711335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_017341	A	6	6	2711343	2711348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_017341	GGAGT	2	10	2711349	2711358	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_017341	GAA	2	6	2711410	2711415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_017341	GAA	2	6	2711487	2711492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_017341	A	6	6	2711527	2711532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_017341	GACT	2	8	2711620	2711627	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13075	NC_017341	ACT	2	6	2712983	2712988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_017341	AAT	2	6	2713032	2713037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_017341	TAAAA	2	10	2713052	2713061	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_017341	TGATA	2	10	2713143	2713152	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_017341	ATA	2	6	2714380	2714385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_017341	AGC	2	6	2714395	2714400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_017341	CTG	2	6	2714432	2714437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_017341	TGAA	2	8	2714462	2714469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_017341	ATT	2	6	2714491	2714496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_017341	C	6	6	2715057	2715062	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13085	NC_017341	T	6	6	2715115	2715120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_017341	ATAA	2	8	2715125	2715132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_017341	GTC	2	6	2715133	2715138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13088	NC_017341	TA	3	6	2715146	2715151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_017341	TGC	2	6	2715176	2715181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_017341	TAC	2	6	2715201	2715206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_017341	TTAAA	2	10	2715239	2715248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_017341	TTA	2	6	2715279	2715284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_017341	TTA	2	6	2715298	2715303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_017341	AC	3	6	2715310	2715315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_017341	CTA	2	6	2715354	2715359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13096	NC_017341	CAATTG	2	12	2715374	2715385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13097	NC_017341	TA	3	6	2715386	2715391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_017341	T	6	6	2715420	2715425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_017341	A	7	7	2715435	2715441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_017341	T	7	7	2717624	2717630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_017341	ATA	2	6	2720073	2720078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_017341	TTTA	2	8	2720128	2720135	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_017341	AAT	2	6	2720136	2720141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_017341	A	6	6	2720203	2720208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_017341	TA	3	6	2722736	2722741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_017341	CCT	2	6	2722764	2722769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13107	NC_017341	ATT	2	6	2722807	2722812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_017341	TATC	2	8	2722825	2722832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13109	NC_017341	AC	3	6	2722878	2722883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13110	NC_017341	ATA	2	6	2723481	2723486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_017341	TAAA	2	8	2723753	2723760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_017341	ATGG	2	8	2723775	2723782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_017341	CAT	2	6	2725406	2725411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_017341	ATTG	2	8	2725496	2725503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_017341	TAA	2	6	2726153	2726158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_017341	TAA	2	6	2726208	2726213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_017341	AGT	2	6	2726282	2726287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_017341	TAC	2	6	2726300	2726305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_017341	CATT	2	8	2726311	2726318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13120	NC_017341	T	6	6	2726317	2726322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_017341	TCAT	2	8	2726612	2726619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13122	NC_017341	ATTA	2	8	2726632	2726639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_017341	CTT	2	6	2726643	2726648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_017341	TA	3	6	2726650	2726655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_017341	AG	3	6	2726666	2726671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_017341	TTG	2	6	2726673	2726678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_017341	TC	3	6	2726698	2726703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13128	NC_017341	GTAAAA	2	12	2726722	2726733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_017341	TA	3	6	2726748	2726753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_017341	AAT	2	6	2726800	2726805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_017341	TAA	2	6	2729221	2729226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_017341	AT	3	6	2729312	2729317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_017341	ATTT	2	8	2729384	2729391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_017341	CGT	2	6	2729392	2729397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13249	NC_017341	AATA	2	8	2755316	2755323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13254	NC_017341	GTCCT	2	10	2755443	2755452	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13255	NC_017341	ATTG	2	8	2755492	2755499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13258	NC_017341	ATA	2	6	2755679	2755684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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