MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus str. JKD6008 chromosome

Total Repeats: 13986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017341	AT	3	6	1047868	1047873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017341	A	6	6	1047923	1047928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017341	CAT	2	6	1047933	1047938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017341	ATG	2	6	1047958	1047963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017341	TAA	3	9	1048055	1048063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017341	GCA	2	6	1048110	1048115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017341	AGA	2	6	1048201	1048206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_017341	TATAT	2	10	1048223	1048232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017341	CAG	2	6	1048258	1048263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017341	AGG	2	6	1048289	1048294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017341	AGTA	2	8	1048317	1048324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017341	TAT	3	9	1048335	1048343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017341	AAAAGC	2	12	1048418	1048429	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5014	NC_017341	CTA	2	6	1048435	1048440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017341	TGG	2	6	1048449	1048454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017341	TAT	2	6	1048467	1048472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017341	TTA	2	6	1048478	1048483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017341	A	6	6	1048490	1048495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017341	AAC	2	6	1048508	1048513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017341	CAAT	2	8	1051478	1051485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_017341	AAT	2	6	1051763	1051768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017341	AAATT	2	10	1051856	1051865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017341	AGA	2	6	1051873	1051878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017341	AAATT	2	10	1051884	1051893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017341	ATT	2	6	1051963	1051968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017341	ATT	3	9	1051985	1051993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017341	AAT	2	6	1052005	1052010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017341	ATT	2	6	1052028	1052033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017341	ATT	2	6	1052071	1052076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017341	TTA	2	6	1052093	1052098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017341	A	6	6	1053888	1053893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017341	A	7	7	1053940	1053946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017341	T	6	6	1054402	1054407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017341	ATTA	2	8	1054413	1054420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017341	TTA	2	6	1054429	1054434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017341	TATTG	2	10	1054442	1054451	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_017341	TTG	2	6	1054457	1054462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017341	TCA	2	6	1054479	1054484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017341	TAAA	2	8	1054502	1054509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017341	TAT	2	6	1054585	1054590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017341	AGT	2	6	1054602	1054607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017341	ATG	2	6	1054621	1054626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017341	TTA	2	6	1054645	1054650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017341	TAA	2	6	1054693	1054698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017341	A	6	6	1054726	1054731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017341	TAA	2	6	1054732	1054737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017341	ATA	3	9	1054774	1054782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017341	TA	3	6	1054781	1054786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017341	CTA	2	6	1054790	1054795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017341	GTT	2	6	1054798	1054803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017341	TG	3	6	1054814	1054819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017341	TA	3	6	1055973	1055978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017341	AT	3	6	1055986	1055991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017341	TCC	2	6	1056240	1056245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_017341	TA	3	6	1056355	1056360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017341	TAA	2	6	1056369	1056374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017341	ATG	2	6	1056386	1056391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017341	AGT	2	6	1056983	1056988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017341	T	6	6	1057965	1057970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017341	ATA	2	6	1058079	1058084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017341	A	6	6	1058092	1058097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017341	GAA	2	6	1058101	1058106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017341	CGT	2	6	1062776	1062781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_017341	TTA	2	6	1062782	1062787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017341	CGA	2	6	1062789	1062794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017341	T	6	6	1062803	1062808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017341	TAAT	2	8	1062836	1062843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017341	AGATA	2	10	1062852	1062861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017341	AGAA	2	8	1062881	1062888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017341	ATT	3	9	1062901	1062909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017341	A	6	6	1062916	1062921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017341	ATG	2	6	1064486	1064491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017341	ATA	2	6	1064533	1064538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017341	A	6	6	1065637	1065642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017341	TTTA	2	8	1065643	1065650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017341	AT	3	6	1065691	1065696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017341	AAAT	2	8	1065697	1065704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017341	TAT	2	6	1065764	1065769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017341	AATA	2	8	1065828	1065835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017341	TAA	3	9	1065873	1065881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017341	AAT	3	9	1065895	1065903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017341	AT	3	6	1065937	1065942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017341	GAA	2	6	1065963	1065968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017341	TGAG	2	8	1066012	1066019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017341	GTA	2	6	1066047	1066052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017341	TAT	2	6	1066071	1066076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017341	A	6	6	1066095	1066100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017341	ACG	2	6	1066125	1066130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017341	TAA	2	6	1067354	1067359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017341	A	6	6	1067382	1067387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017341	GTA	2	6	1067439	1067444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017341	ACT	2	6	1067445	1067450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017341	TAT	2	6	1068550	1068555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_017341	CAA	2	6	1068573	1068578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017341	A	7	7	1068616	1068622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017341	ATA	2	6	1068627	1068632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017341	ATA	2	6	1068639	1068644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017341	AAC	2	6	1068658	1068663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_017341	CA	3	6	1069121	1069126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_017341	TGTA	2	8	1069210	1069217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017341	A	6	6	1069219	1069224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017341	TGAT	2	8	1069246	1069253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017341	TATT	2	8	1073063	1073070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_017341	ATTA	2	8	1073084	1073091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017341	TA	3	6	1073116	1073121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017341	A	7	7	1073175	1073181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017341	A	7	7	1073184	1073190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017341	GTGAC	2	10	1073206	1073215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5109	NC_017341	TTA	2	6	1073252	1073257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017341	TCC	2	6	1073728	1073733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_017341	CATTTA	2	12	1073749	1073760	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5112	NC_017341	TAA	3	9	1073767	1073775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_017341	GTAAAA	2	12	1073815	1073826	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017341	AGG	2	6	1073882	1073887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017341	GACTT	2	10	1075110	1075119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5116	NC_017341	AAT	2	6	1075139	1075144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017341	A	6	6	1075152	1075157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017341	GAT	2	6	1075166	1075171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5122	NC_017341	ATG	2	6	1075683	1075688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017341	ATA	2	6	1075722	1075727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_017341	TGAT	2	8	1076945	1076952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017341	ATCATA	2	12	1076977	1076988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5126	NC_017341	GTA	2	6	1077057	1077062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017341	A	6	6	1077072	1077077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017341	ATG	2	6	1077163	1077168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017341	A	6	6	1077173	1077178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_017341	TAAT	2	8	1077228	1077235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_017341	TTA	2	6	1077266	1077271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_017341	TAAT	2	8	1106798	1106805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_017341	GTTA	2	8	1106806	1106813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_017341	ATTTA	2	10	1106828	1106837	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_017341	TTG	2	6	1110574	1110579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_017341	CTA	2	6	1110767	1110772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5262	NC_017341	TGTT	2	8	1112764	1112771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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