MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	ATAAAT	2	12	2776	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017338	TTTAAA	2	12	2953	2964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017338	TAAATC	2	12	16636	16647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017338	AAAAAT	2	12	37836	37847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017338	GCTAAA	2	12	42376	42387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017338	AATTAA	2	12	52468	52479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017338	ATGATT	2	12	58888	58899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017338	TTAAAT	2	12	107613	107624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017338	AATGTA	2	12	133157	133168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017338	GTTTTT	2	12	146161	146172	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017338	TGAAAG	2	12	147028	147039	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017338	ATTAAT	2	12	171572	171583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017338	TTTATA	2	12	192740	192751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017338	ATTAAT	2	12	192763	192774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017338	ATATGA	2	12	239639	239650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017338	ATATAG	2	12	278372	278383	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017338	ATAATT	2	12	284650	284661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017338	AATTAT	2	12	292072	292083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017338	AACGAT	2	12	294797	294808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017338	TAACTT	2	12	303173	303184	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017338	ATATGA	2	12	353133	353144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017338	TTGTAA	2	12	361600	361611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017338	AATTTG	2	12	399492	399503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017338	ATTGAT	2	12	420410	420421	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017338	TATAAT	2	12	423954	423965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017338	CATTAG	2	12	434752	434763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017338	TGTATA	2	12	442872	442883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017338	TTTTTA	2	12	454234	454245	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017338	AAAATG	2	12	459667	459678	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017338	ACGTTG	2	12	480073	480084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017338	AAAATA	2	12	480799	480810	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017338	TTATAA	2	12	500137	500148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017338	AAATTT	2	12	506897	506908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017338	AATTTT	2	12	539682	539693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017338	TTATAA	2	12	562524	562535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017338	GTTATA	2	12	563195	563206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017338	TTAAAA	2	12	571628	571639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017338	ACATGT	2	12	581596	581607	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017338	ATTGCG	2	12	611403	611414	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017338	TAAAAT	2	12	630742	630753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017338	TTTTAA	2	12	637578	637589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017338	CATTAT	2	12	653696	653707	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017338	CATCAA	2	12	664094	664105	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017338	TAATTT	2	12	668334	668345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017338	TAAAAA	2	12	680698	680709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017338	TGAATA	2	12	684811	684822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017338	GGATTC	2	12	696161	696172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017338	AAATAT	2	12	698952	698963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017338	TTAAAA	2	12	711094	711105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017338	TAGTTA	2	12	715536	715547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017338	TTTTTA	2	12	733895	733906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017338	TGAAAA	2	12	742126	742137	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017338	AATGAT	2	12	770698	770709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017338	ATTTAA	2	12	775045	775056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017338	TAGAAT	2	12	830954	830965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017338	TAAAAA	2	12	833093	833104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017338	TATCAA	2	12	839702	839713	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017338	AATATA	2	12	841076	841087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017338	TTTTGA	2	12	843523	843534	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017338	TCATTT	2	12	849515	849526	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017338	TAAAAA	2	12	852602	852613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017338	AAATTA	2	12	859474	859485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017338	TAAAAT	2	12	876101	876112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017338	TTTAAT	2	12	949647	949658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017338	AACGGA	2	12	981573	981584	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017338	ATTCGA	2	12	982884	982895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017338	CATTTA	2	12	1011337	1011348	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017338	ATCATA	2	12	1013241	1013252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017338	TCAAAA	2	12	1019747	1019758	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017338	TATGTA	2	12	1033426	1033437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017338	TTTTCT	2	12	1033521	1033532	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017338	TTTATA	2	12	1071270	1071281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017338	GACTGA	2	12	1072839	1072850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017338	GAATTA	2	12	1077850	1077861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017338	TGATTT	2	12	1095038	1095049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017338	ATTTTT	2	12	1095213	1095224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017338	ATAATT	2	12	1096010	1096021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017338	TCATTA	2	12	1101094	1101105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017338	TAATGA	2	12	1109186	1109197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017338	TGTATT	2	12	1117430	1117441	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017338	AAATAT	2	12	1118747	1118758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017338	TTATAG	2	12	1121915	1121926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017338	ATTTAT	2	12	1127632	1127643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017338	AAATTT	2	12	1132501	1132512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017338	AAGTAA	2	12	1154207	1154218	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017338	TCGTTT	2	12	1157989	1158000	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017338	TTAATT	2	12	1168706	1168717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017338	ATTTTT	2	12	1169434	1169445	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017338	TCAAAA	2	12	1169550	1169561	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017338	AATTAA	2	12	1171642	1171653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017338	TGATTT	2	12	1176608	1176619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017338	AGCTAA	2	12	1196527	1196538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017338	GAAATT	2	12	1218156	1218167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017338	AATGAT	2	12	1230935	1230946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017338	TAAAGA	2	12	1245403	1245414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017338	TTTCAT	2	12	1261211	1261222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017338	TATATT	2	12	1266017	1266028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017338	ATGTAT	2	12	1291740	1291751	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017338	AAAGAA	2	12	1291878	1291889	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017338	ATTTTA	2	12	1293206	1293217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017338	TTAAAG	2	12	1296844	1296855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017338	AAAGAG	2	12	1297384	1297395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017338	TTAAAG	2	12	1297553	1297564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017338	TTAAAG	2	12	1298588	1298599	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017338	TTAAAG	2	12	1299644	1299655	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017338	AAAGAG	2	12	1300407	1300418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017338	TTAAAG	2	12	1300481	1300492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017338	GAAAAA	2	12	1300627	1300638	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017338	ATTAAA	2	12	1328369	1328380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017338	ATATAA	2	12	1336027	1336038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017338	GTTTTA	2	12	1365843	1365854	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017338	ATACTT	2	12	1371133	1371144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017338	TAAAAT	2	12	1381976	1381987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017338	TATCTT	2	12	1403709	1403720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017338	TTGATT	2	12	1403772	1403783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017338	AATAAA	2	12	1414437	1414448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017338	TACTTG	2	12	1472117	1472128	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017338	TTAATC	2	12	1485605	1485616	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017338	TGAAAA	2	12	1505026	1505037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017338	GCTCTT	2	12	1527741	1527752	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017338	CAGTTG	2	12	1529658	1529669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017338	AATAAA	2	12	1576006	1576017	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017338	ATAAAA	2	12	1579794	1579805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017338	ATAATG	2	12	1580583	1580594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017338	ATTATC	2	12	1589819	1589830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017338	ACAAGA	2	12	1591752	1591763	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017338	TTATAG	2	12	1613784	1613795	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017338	AATTTA	2	12	1621819	1621830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017338	AGCCAA	2	12	1649704	1649715	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017338	TTGACT	2	12	1649723	1649734	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017338	TTTAAC	2	12	1654606	1654617	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017338	TTATAA	2	12	1657144	1657155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017338	ACCTTT	2	12	1667101	1667112	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017338	AGTTTT	2	12	1693861	1693872	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017338	AATTAA	2	12	1695105	1695116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_017338	AATTTA	2	12	1708054	1708065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017338	ATTTTC	2	12	1714089	1714100	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.