MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 6625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017338	TAA	3	9	1404	1412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017338	CCA	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017338	CTA	3	9	1572	1580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017338	AAT	2	6	2836	2841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017338	TAA	2	6	2931	2936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017338	CGT	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017338	ATT	2	6	3157	3162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017338	AGG	2	6	6475	6480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017338	TAT	2	6	10122	10127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017338	ATT	2	6	10142	10147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017338	ATT	2	6	10208	10213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017338	ACA	2	6	10224	10229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017338	ATA	2	6	10267	10272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017338	AAG	2	6	10327	10332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017338	TAA	2	6	11953	11958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017338	ATA	2	6	12223	12228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017338	ATT	2	6	12236	12241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017338	ATA	2	6	13616	13621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017338	GTG	2	6	13631	13636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017338	AAC	2	6	13695	13700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017338	CAA	2	6	13748	13753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017338	CAT	2	6	13805	13810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017338	GTA	2	6	13852	13857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017338	ATG	2	6	13889	13894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017338	TCA	2	6	13932	13937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017338	AAC	2	6	13972	13977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017338	TAT	2	6	14142	14147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017338	AGG	2	6	14180	14185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017338	AAC	2	6	15354	15359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017338	TCA	2	6	15381	15386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017338	CTT	2	6	15525	15530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017338	AGG	2	6	15564	15569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017338	AAT	2	6	16675	16680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017338	TTA	2	6	16749	16754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017338	ATA	2	6	16818	16823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017338	AAT	2	6	21652	21657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017338	AGG	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017338	GAT	2	6	23355	23360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017338	AAG	2	6	23395	23400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017338	ATT	2	6	23487	23492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017338	ATA	2	6	23493	23498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017338	TTC	2	6	23538	23543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017338	CGG	2	6	23663	23668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017338	ACC	2	6	23969	23974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017338	CTT	2	6	23991	23996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017338	ATA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017338	ATT	2	6	24139	24144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017338	TAA	2	6	24167	24172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017338	ATA	2	6	24350	24355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017338	ATA	2	6	29051	29056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017338	GTG	2	6	29089	29094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017338	AGT	2	6	29169	29174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017338	TAA	2	6	29239	29244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017338	ATA	2	6	29313	29318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017338	CTG	2	6	30259	30264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017338	GAC	2	6	30268	30273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017338	TGT	2	6	30293	30298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017338	TGG	2	6	30299	30304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017338	TGT	2	6	30312	30317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017338	AAT	2	6	30377	30382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017338	ATA	2	6	30419	30424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017338	TAC	2	6	32793	32798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017338	TAA	2	6	32889	32894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017338	TAA	2	6	33064	33069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017338	TAA	2	6	33091	33096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017338	GGA	2	6	33129	33134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017338	AAG	2	6	33706	33711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017338	ATA	2	6	33780	33785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017338	GAA	2	6	33899	33904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017338	ATA	2	6	33913	33918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017338	AGG	2	6	33930	33935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017338	TAA	2	6	35236	35241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017338	TAA	2	6	35391	35396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017338	ATT	2	6	35431	35436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017338	TAA	2	6	35463	35468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017338	GTT	2	6	35470	35475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017338	AAT	2	6	35487	35492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017338	ATG	2	6	35570	35575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017338	AGA	2	6	36564	36569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017338	TAT	2	6	36619	36624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017338	TTA	2	6	36681	36686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017338	AGA	2	6	36707	36712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017338	TGA	2	6	37006	37011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017338	TAA	2	6	37241	37246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017338	CTT	2	6	37757	37762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017338	ATA	2	6	37814	37819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017338	GTA	2	6	41213	41218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017338	GTA	2	6	41229	41234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017338	AAT	2	6	41245	41250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017338	AAG	2	6	42278	42283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017338	CCA	2	6	42430	42435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_017338	CAC	2	6	44036	44041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017338	TCG	2	6	44056	44061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017338	CAA	2	6	44084	44089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017338	ATG	2	6	45013	45018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017338	GAT	2	6	45021	45026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017338	ATT	2	6	45421	45426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017338	CCT	2	6	45428	45433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017338	CAT	2	6	45464	45469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017338	ATA	2	6	45474	45479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017338	TTA	2	6	45497	45502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017338	ATT	2	6	45609	45614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017338	TGA	2	6	45624	45629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017338	TTC	2	6	45717	45722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017338	ATT	2	6	45914	45919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017338	TTC	2	6	47584	47589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017338	CTC	2	6	48947	48952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017338	ATA	2	6	48964	48969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017338	TTC	2	6	49050	49055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017338	ATT	2	6	49134	49139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017338	TCC	2	6	51261	51266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017338	AAT	2	6	51267	51272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017338	TAA	2	6	51327	51332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017338	TGT	2	6	52531	52536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017338	AAT	2	6	52550	52555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017338	ATC	2	6	52573	52578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017338	GTA	2	6	52579	52584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017338	AAT	2	6	52605	52610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017338	ATC	2	6	52628	52633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017338	GTA	2	6	52634	52639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017338	AAT	2	6	52660	52665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017338	ATC	2	6	52683	52688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017338	GTA	2	6	52689	52694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017338	AAT	2	6	52715	52720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017338	ATC	2	6	52738	52743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017338	GTA	2	6	52744	52749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017338	AAT	2	6	52770	52775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017338	ATC	2	6	52793	52798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017338	GTA	2	6	52799	52804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017338	AAT	2	6	52825	52830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017338	ATC	2	6	52848	52853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017338	GTA	2	6	52854	52859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017338	AAT	2	6	52880	52885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017338	ATC	2	6	52903	52908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017338	GTA	2	6	52909	52914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017338	AAT	2	6	52935	52940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017338	ATC	2	6	52958	52963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017338	GTA	2	6	52964	52969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017338	GGA	2	6	53046	53051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017338	TTA	2	6	54780	54785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017338	AAT	2	6	54836	54841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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