MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 12637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017338	GA	3	6	854926	854931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017338	TAC	2	6	854937	854942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017338	T	6	6	854982	854987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017338	TTA	2	6	854991	854996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017338	GGA	2	6	855007	855012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017338	GTG	2	6	857594	857599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017338	TTTAA	2	10	857611	857620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4009	NC_017338	TAC	2	6	857733	857738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017338	ATA	2	6	857739	857744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017338	TAT	2	6	857762	857767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017338	ATG	2	6	857792	857797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017338	ATT	2	6	857843	857848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017338	TAT	2	6	857885	857890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017338	AT	3	6	857889	857894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017338	ATT	2	6	857903	857908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017338	GAG	2	6	857911	857916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4019	NC_017338	T	6	6	858185	858190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017338	A	6	6	858196	858201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017338	TAA	2	6	858220	858225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017338	A	7	7	858241	858247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017338	TAAA	2	8	858249	858256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017338	AAT	2	6	858275	858280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017338	AT	3	6	858299	858304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017338	AT	3	6	858329	858334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017338	CAT	2	6	859247	859252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017338	TTA	2	6	859327	859332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017338	AG	3	6	859349	859354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017338	TTA	2	6	859378	859383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017338	ATA	2	6	859387	859392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017338	GTT	2	6	859405	859410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017338	TAAG	2	8	859423	859430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017338	ATT	2	6	859449	859454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017338	AAATTA	2	12	859474	859485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017338	TTA	2	6	860297	860302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017338	TA	3	6	860328	860333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017338	TGA	2	6	860334	860339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017338	TCA	2	6	860369	860374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4041	NC_017338	TTTA	2	8	861788	861795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017338	TGAA	2	8	861806	861813	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017338	GAT	2	6	863526	863531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017338	ATGTC	2	10	863572	863581	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4045	NC_017338	CAT	2	6	863601	863606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017338	ACGC	2	8	863620	863627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_017338	AT	3	6	863636	863641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017338	GTT	2	6	865069	865074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017338	T	7	7	865153	865159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017338	GATA	2	8	865182	865189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017338	T	7	7	865218	865224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017338	A	6	6	865234	865239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4056	NC_017338	ATTAA	2	10	865309	865318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017338	CTT	2	6	865713	865718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017338	GTT	2	6	865793	865798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017338	TTG	2	6	865846	865851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4063	NC_017338	ATTA	2	8	865950	865957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017338	ATT	2	6	865960	865965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017338	TAT	2	6	865971	865976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017338	AT	3	6	865975	865980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017338	TTA	2	6	865998	866003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4071	NC_017338	ATC	2	6	868507	868512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_017338	ATG	2	6	868599	868604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4091	NC_017338	TA	3	6	875986	875991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017338	ATGA	2	8	876027	876034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4100	NC_017338	TAAT	2	8	880605	880612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017338	A	6	6	880661	880666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4103	NC_017338	AAT	2	6	880688	880693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017338	TTA	2	6	880712	880717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017338	ATA	2	6	880721	880726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017338	GA	3	6	881013	881018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017338	TTA	2	6	881034	881039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017338	TAT	2	6	881043	881048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017338	ATAG	2	8	881050	881057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017338	TAA	2	6	881060	881065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017338	ATA	2	6	881427	881432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_017338	AT	3	6	882606	882611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017338	TCA	2	6	882650	882655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4115	NC_017338	TTA	2	6	882691	882696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017338	TA	3	6	882695	882700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017338	T	7	7	882701	882707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017338	AAAT	2	8	882720	882727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017338	ACTA	2	8	882734	882741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_017338	GTT	2	6	882776	882781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4123	NC_017338	TTA	2	6	883577	883582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_017338	A	6	6	883673	883678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017338	TTAA	2	8	883679	883686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017338	T	6	6	883687	883692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017338	CTTG	2	8	883709	883716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_017338	T	6	6	883764	883769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017338	ATG	2	6	883817	883822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_017338	AGT	2	6	883848	883853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017338	GTT	2	6	883862	883867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017338	A	7	7	883892	883898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017338	ATT	2	6	885168	885173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_017338	TTG	2	6	885211	885216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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