MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 12637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017338	TTTG	2	8	235931	235938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_017338	GAC	2	6	235943	235948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_017338	TATTT	2	10	235977	235986	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017338	TA	3	6	235995	236000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017338	AT	3	6	236073	236078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017338	TTA	2	6	236112	236117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017338	T	6	6	236125	236130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017338	AT	3	6	236139	236144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017338	TGT	2	6	236192	236197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017338	ACAT	2	8	236257	236264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_017338	TGA	2	6	236266	236271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017338	A	7	7	236293	236299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017338	CAA	2	6	236303	236308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017338	AAAG	2	8	239428	239435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017338	CTT	2	6	239468	239473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017338	GTA	2	6	239504	239509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017338	ATC	2	6	239608	239613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017338	TTA	2	6	239621	239626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017338	ATATGA	2	12	239639	239650	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017338	GAT	2	6	241524	241529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017338	A	7	7	242034	242040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017338	AT	3	6	242115	242120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017338	GGA	2	6	242176	242181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017338	A	6	6	242185	242190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017338	ACA	2	6	244223	244228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017338	GAT	2	6	244243	244248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017338	ATT	2	6	244296	244301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017338	AACAT	2	10	244319	244328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_017338	AT	3	6	244335	244340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017338	AAT	3	9	244396	244404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017338	AC	4	8	244451	244458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_017338	AGATA	2	10	244498	244507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017338	ATT	2	6	244523	244528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017338	AAT	2	6	244665	244670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017338	TTCA	2	8	244710	244717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_017338	ATC	2	6	245945	245950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017338	CT	3	6	245951	245956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_017338	TCC	2	6	248238	248243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_017338	GATAA	2	10	248256	248265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017338	ATTG	2	8	248304	248311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017338	T	6	6	248375	248380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017338	TCC	2	6	249635	249640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_017338	ATA	2	6	249646	249651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017338	ACA	2	6	249685	249690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017338	ACC	2	6	249733	249738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017338	ATAAC	2	10	252903	252912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_017338	ATA	2	6	252950	252955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017338	TGAAT	2	10	253014	253023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017338	TA	3	6	253038	253043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017338	ATTAA	2	10	253155	253164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017338	TAT	2	6	253173	253178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017338	T	6	6	254473	254478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017338	CGT	2	6	254483	254488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017338	TCA	2	6	254536	254541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017338	T	6	6	255162	255167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017338	TA	3	6	255203	255208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017338	T	6	6	255224	255229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017338	TAA	2	6	255244	255249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017338	ATA	2	6	256844	256849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017338	TTAT	2	8	256850	256857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017338	T	6	6	256896	256901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017338	ATT	2	6	256913	256918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017338	TAA	2	6	256945	256950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017338	AGA	2	6	256962	256967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017338	T	7	7	257061	257067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017338	ATT	2	6	257106	257111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017338	A	6	6	257125	257130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017338	ATGA	2	8	257174	257181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017338	T	6	6	257193	257198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017338	CT	3	6	258714	258719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_017338	ATT	2	6	258749	258754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017338	TTTG	2	8	258762	258769	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017338	A	6	6	258838	258843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017338	A	6	6	259323	259328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017338	CTC	2	6	260719	260724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_017338	ATT	2	6	260744	260749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_017338	CTA	2	6	260750	260755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017338	AATT	2	8	260771	260778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017338	ATAA	2	8	260792	260799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017338	T	6	6	260834	260839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017338	CGA	2	6	260885	260890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017338	GC	3	6	260893	260898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_017338	ATTT	2	8	260899	260906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017338	A	6	6	260916	260921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017338	TTG	2	6	260924	260929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017338	A	6	6	260939	260944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_017338	TAAAA	2	10	261051	261060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017338	AAAT	2	8	261065	261072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017338	AAAT	2	8	261123	261130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017338	AGC	2	6	261218	261223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1094	NC_017338	GTT	2	6	262361	262366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017338	AAATT	2	10	262368	262377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017338	GAT	2	6	262413	262418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017338	TAC	2	6	262445	262450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017338	ATG	2	6	262456	262461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017338	CTT	2	6	262509	262514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017338	ATT	2	6	264105	264110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017338	AT	4	8	264142	264149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017338	TTG	2	6	264220	264225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017338	T	6	6	264271	264276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017338	CAC	2	6	264393	264398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_017338	ATAA	2	8	264399	264406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017338	AAC	2	6	264426	264431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017338	AT	3	6	264445	264450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017338	TTAA	2	8	265395	265402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017338	ATGT	2	8	265498	265505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017338	A	6	6	265518	265523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017338	AT	3	6	265545	265550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017338	A	6	6	265592	265597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017338	TGT	2	6	265615	265620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017338	ATG	2	6	265633	265638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017338	GT	3	6	265670	265675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017338	AGG	2	6	265720	265725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017338	GGA	2	6	268291	268296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017338	AT	3	6	268619	268624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017338	TTG	2	6	268660	268665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017338	TAA	2	6	268754	268759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017338	AT	3	6	268785	268790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017338	AGGG	2	8	268794	268801	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017338	AAT	2	6	272438	272443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017338	TG	3	6	272482	272487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017338	GTT	2	6	272506	272511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017338	TAA	2	6	272584	272589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017338	TAT	2	6	272598	272603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017338	AT	3	6	272605	272610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017338	ATG	2	6	272617	272622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017338	TAA	2	6	272627	272632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017338	AAC	2	6	272709	272714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017338	TAA	2	6	272785	272790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017338	ATG	2	6	272855	272860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017338	GGA	2	6	272873	272878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_017338	AT	3	6	276341	276346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_017338	AAG	2	6	276384	276389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_017338	ATG	2	6	276419	276424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1453	NC_017338	GGA	2	6	370602	370607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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