MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 12637

< Previous12...14151617181920212223242526Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017338	ATTAA	2	10	2774624	2774633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_017338	CCT	2	6	2774644	2774649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_017338	AAT	2	6	2774684	2774689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_017338	ATT	2	6	2774719	2774724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_017338	ACT	2	6	2774749	2774754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_017338	TA	3	6	2774866	2774871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_017338	ACC	2	6	2781839	2781844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_017338	GTC	2	6	2781886	2781891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_017338	CTC	2	6	2781899	2781904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_017338	TAA	2	6	2781929	2781934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017338	T	6	6	2781996	2782001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017338	CTT	2	6	2782070	2782075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_017338	TTA	2	6	2782094	2782099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_017338	TTTC	2	8	2782111	2782118	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12515	NC_017338	TTA	2	6	2782126	2782131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_017338	TAT	2	6	2783284	2783289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_017338	ATTTT	2	10	2783351	2783360	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_017338	T	6	6	2783357	2783362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_017338	CTATTT	2	12	2783866	2783877	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12520	NC_017338	AT	3	6	2786442	2786447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_017338	CATT	2	8	2786461	2786468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12522	NC_017338	CAA	2	6	2786482	2786487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_017338	A	6	6	2787066	2787071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_017338	CCT	2	6	2787931	2787936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_017338	T	7	7	2787936	2787942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_017338	A	7	7	2787952	2787958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_017338	TAT	2	6	2787959	2787964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_017338	TAG	2	6	2788041	2788046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017338	ATA	3	9	2788061	2788069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_017338	CAG	2	6	2788130	2788135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_017338	TAA	2	6	2788190	2788195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_017338	A	7	7	2788194	2788200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_017338	TTCGAA	2	12	2788201	2788212	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12534	NC_017338	GGT	2	6	2788240	2788245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_017338	GTAT	2	8	2788249	2788256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_017338	CTCAT	2	10	2788825	2788834	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12537	NC_017338	AT	4	8	2788852	2788859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_017338	ATC	2	6	2788876	2788881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_017338	T	6	6	2788899	2788904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_017338	AGGT	2	8	2788960	2788967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_017338	TTTCA	2	10	2789953	2789962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12542	NC_017338	TTTTA	2	10	2789980	2789989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_017338	ATG	2	6	2790098	2790103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_017338	T	7	7	2791202	2791208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_017338	CATA	2	8	2791214	2791221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12546	NC_017338	TAAAT	2	10	2791256	2791265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_017338	AAC	2	6	2791939	2791944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_017338	TTTA	2	8	2792006	2792013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_017338	TTA	2	6	2792504	2792509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_017338	T	6	6	2792533	2792538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_017338	TAA	2	6	2792568	2792573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_017338	TCT	2	6	2792588	2792593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_017338	AAT	2	6	2792610	2792615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_017338	ATT	2	6	2792652	2792657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_017338	AGAA	2	8	2792713	2792720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_017338	ATCT	2	8	2794211	2794218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12557	NC_017338	A	6	6	2794392	2794397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_017338	ATTT	2	8	2794443	2794450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_017338	CA	3	6	2794493	2794498	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12560	NC_017338	CCT	2	6	2795494	2795499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12561	NC_017338	TAA	2	6	2795560	2795565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_017338	AAT	2	6	2795641	2795646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_017338	TAAA	2	8	2796296	2796303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_017338	A	6	6	2796310	2796315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_017338	TAT	2	6	2796321	2796326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_017338	TA	3	6	2796341	2796346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_017338	T	6	6	2796384	2796389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_017338	TTG	2	6	2796400	2796405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_017338	CTT	2	6	2797524	2797529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_017338	AGT	2	6	2797548	2797553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_017338	AGG	2	6	2797695	2797700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_017338	ACTT	2	8	2798531	2798538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12573	NC_017338	GTAG	2	8	2798542	2798549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_017338	T	7	7	2798556	2798562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_017338	ATA	2	6	2798576	2798581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_017338	CTT	2	6	2798614	2798619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_017338	T	6	6	2799200	2799205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_017338	AAT	2	6	2799210	2799215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_017338	CTCA	2	8	2799301	2799308	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12580	NC_017338	CTA	2	6	2799314	2799319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_017338	TTCA	2	8	2799348	2799355	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12582	NC_017338	CTA	2	6	2799380	2799385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_017338	ATT	2	6	2799394	2799399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_017338	A	6	6	2802073	2802078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_017338	GATTTT	2	12	2802090	2802101	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_017338	A	6	6	2802135	2802140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_017338	GA	3	6	2802142	2802147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_017338	CAA	2	6	2802402	2802407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_017338	GCT	2	6	2802420	2802425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12590	NC_017338	T	6	6	2802428	2802433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_017338	ACAA	2	8	2802483	2802490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12592	NC_017338	T	7	7	2802509	2802515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_017338	ATTT	2	8	2802571	2802578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_017338	A	6	6	2802581	2802586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_017338	TAA	2	6	2802629	2802634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017338	T	6	6	2802679	2802684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_017338	CAA	2	6	2802985	2802990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12598	NC_017338	TTG	2	6	2803002	2803007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_017338	T	7	7	2803011	2803017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_017338	ATA	2	6	2803030	2803035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_017338	ATA	2	6	2803039	2803044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_017338	GAT	2	6	2803059	2803064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_017338	ACA	2	6	2803736	2803741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12604	NC_017338	AGAC	2	8	2803764	2803771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12605	NC_017338	ATG	2	6	2803827	2803832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_017338	AAT	2	6	2804304	2804309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_017338	TTA	2	6	2804310	2804315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_017338	TAA	2	6	2804318	2804323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_017338	TAAT	2	8	2804729	2804736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_017338	CA	3	6	2804757	2804762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12611	NC_017338	ATT	2	6	2804879	2804884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_017338	ATATAA	2	12	2804919	2804930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_017338	A	7	7	2804953	2804959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_017338	TCA	2	6	2805002	2805007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12615	NC_017338	CCT	2	6	2808514	2808519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12616	NC_017338	CTT	2	6	2808539	2808544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_017338	CCT	2	6	2809963	2809968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_017338	TTA	2	6	2809998	2810003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_017338	GGT	2	6	2810056	2810061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_017338	TTAT	2	8	2810455	2810462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_017338	TATT	2	8	2810517	2810524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_017338	A	8	8	2810538	2810545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_017338	TGA	2	6	2810552	2810557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_017338	ACT	2	6	2810845	2810850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_017338	TAC	2	6	2810892	2810897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_017338	T	7	7	2810905	2810911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_017338	ATT	2	6	2811044	2811049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_017338	AC	4	8	2811067	2811074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12629	NC_017338	AC	3	6	2811153	2811158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12630	NC_017338	TG	3	6	2811226	2811231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12631	NC_017338	GTC	2	6	2811237	2811242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12632	NC_017338	ATTT	2	8	2811263	2811270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12633	NC_017338	TAA	2	6	2811303	2811308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12634	NC_017338	TTA	2	6	2811334	2811339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12635	NC_017338	ATT	2	6	2811351	2811356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12636	NC_017338	GT	3	6	2811363	2811368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12637	NC_017338	AAGA	2	8	2811416	2811423	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...14151617181920212223242526Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.