MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JKD6159 chromosome

Total Repeats: 12637

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017338	ATT	2	6	88524	88529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017338	ACT	2	6	88533	88538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017338	TAA	2	6	88560	88565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017338	CAA	2	6	88568	88573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017338	TAT	2	6	88574	88579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017338	TTGT	2	8	88592	88599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017338	ATA	2	6	88610	88615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017338	AGA	2	6	88681	88686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017338	AAC	2	6	91515	91520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017338	A	6	6	91526	91531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017338	TA	3	6	91534	91539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017338	AAG	2	6	91551	91556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017338	TGC	2	6	91603	91608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017338	ATAA	2	8	91635	91642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017338	CCT	2	6	91643	91648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_017338	AAT	2	6	91693	91698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017338	ATT	2	6	91749	91754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017338	TTA	2	6	91821	91826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017338	ATG	2	6	91845	91850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017338	ATA	2	6	91854	91859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017338	TCA	2	6	91887	91892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017338	ACC	2	6	91896	91901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_017338	CAA	2	6	91925	91930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017338	CAT	2	6	91936	91941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017338	TGA	2	6	91984	91989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017338	CAA	2	6	92028	92033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017338	A	6	6	92032	92037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017338	CAA	2	6	92117	92122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_017338	ATG	2	6	92196	92201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017338	AG	3	6	92290	92295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017338	ACG	2	6	92354	92359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017338	ATTGC	2	10	92414	92423	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
533	NC_017338	CAA	2	6	92528	92533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017338	GAA	2	6	92591	92596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017338	TCATT	2	10	92602	92611	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
536	NC_017338	CAAC	2	8	92651	92658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
537	NC_017338	TCAA	2	8	92670	92677	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_017338	ATT	2	6	92687	92692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017338	ATCA	2	8	92730	92737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
540	NC_017338	TCA	2	6	92752	92757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017338	ATG	2	6	92787	92792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017338	AT	3	6	92800	92805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017338	ATG	2	6	92835	92840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017338	AT	3	6	92853	92858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017338	ATA	2	6	92895	92900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017338	GTCA	2	8	92990	92997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
547	NC_017338	GAC	2	6	93028	93033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017338	TGAT	2	8	93057	93064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017338	ATT	2	6	93076	93081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017338	TGG	2	6	93088	93093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017338	TTG	2	6	93137	93142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017338	CA	3	6	93156	93161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_017338	ATG	2	6	93192	93197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017338	TAA	2	6	93208	93213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017338	AATG	2	8	93214	93221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017338	ATG	3	9	93219	93227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017338	ATT	2	6	93251	93256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017338	TCA	2	6	93292	93297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017338	GGT	2	6	93377	93382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017338	ATC	2	6	93383	93388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017338	ATT	2	6	93397	93402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017338	GTCA	2	8	93458	93465	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_017338	TCA	2	6	93508	93513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017338	TAA	2	6	93556	93561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017338	TGA	2	6	93586	93591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017338	ATG	2	6	93639	93644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017338	AGA	2	6	93730	93735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017338	GTAT	2	8	93738	93745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017338	CAT	2	6	93806	93811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017338	T	6	6	94018	94023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017338	A	6	6	94044	94049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017338	TGT	2	6	94067	94072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017338	ATAA	2	8	94080	94087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017338	ATG	2	6	94101	94106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017338	AC	3	6	96726	96731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_017338	TAA	2	6	96741	96746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017338	AAT	2	6	96776	96781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_017338	TTTA	2	8	96810	96817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017338	TATAG	2	10	96877	96886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017338	TTA	2	6	96911	96916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017338	AT	4	8	96946	96953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017338	TAT	2	6	96980	96985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017338	ATG	2	6	96988	96993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_017338	AGG	2	6	97028	97033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017338	TA	3	6	98515	98520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017338	AT	3	6	98523	98528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017338	GAC	2	6	98532	98537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017338	TAA	2	6	98541	98546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_017338	TAA	2	6	99135	99140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017338	TAT	2	6	99146	99151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_017338	AAC	2	6	101189	101194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017338	AAT	2	6	101197	101202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017338	CAT	2	6	101214	101219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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607	NC_017338	AAT	2	6	103220	103225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017338	ATT	2	6	103233	103238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017338	ATTAT	2	10	103301	103310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017338	GTAAT	2	10	103337	103346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017338	AAAG	2	8	103385	103392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017338	ATG	2	6	103891	103896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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614	NC_017338	ATAA	2	8	103926	103933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017338	AT	3	6	103958	103963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017338	TATT	2	8	103964	103971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017338	GAT	2	6	104102	104107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_017338	AG	3	6	104123	104128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017338	TGT	2	6	105741	105746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017338	ATT	2	6	105777	105782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017338	T	6	6	105830	105835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017338	TTG	2	6	105850	105855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017338	TTC	2	6	105879	105884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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626	NC_017338	CAA	2	6	105927	105932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017338	GAT	2	6	105954	105959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017338	TA	3	6	105995	106000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017338	TTGT	2	8	106043	106050	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017338	TGTA	2	8	107544	107551	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017338	TCA	2	6	107561	107566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017338	TTAAAT	2	12	107613	107624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017338	AAAT	2	8	107644	107651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017338	TAA	2	6	107716	107721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017338	T	6	6	107744	107749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017338	A	6	6	107780	107785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017338	GTT	2	6	107867	107872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017338	A	6	6	107895	107900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017338	AGA	2	6	107922	107927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017338	ATA	2	6	108750	108755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_017338	ATA	2	6	108786	108791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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