MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED133 chromosome

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017337	ATAAAT	2	12	3294	3305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017337	TTTAAA	2	12	3471	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017337	TTGTTC	2	12	37567	37578	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017337	TTAATT	2	12	40807	40818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017337	AATTAA	2	12	55858	55869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017337	AATATA	2	12	64809	64820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017337	TTAAAT	2	12	73609	73620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017337	GTTTTT	2	12	111347	111358	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017337	TGAAAG	2	12	112216	112227	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017337	TTTATA	2	12	157987	157998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017337	ATTAAT	2	12	158010	158021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017337	AAATTT	2	12	185164	185175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017337	ATATGA	2	12	204937	204948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017337	CTTCAA	2	12	210157	210168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017337	AGTGGA	2	12	219961	219972	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017337	ATATAG	2	12	241193	241204	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017337	ATTTTC	2	12	247320	247331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017337	ATAATT	2	12	248270	248281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017337	AATTAT	2	12	255692	255703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017337	AACGAT	2	12	258451	258462	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017337	AAGGTA	2	12	368846	368857	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017337	TTGTAA	2	12	379839	379850	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017337	GATGCT	2	12	391663	391674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017337	TTTATT	2	12	392428	392439	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017337	TTTAAA	2	12	392608	392619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017337	AATTTG	2	12	417883	417894	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017337	TAAAGA	2	12	420009	420020	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017337	TAAAAT	2	12	445388	445399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017337	AATTAT	2	12	446144	446155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017337	TTGAAA	2	12	457322	457333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017337	TGTATA	2	12	472792	472803	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017337	TTAATT	2	12	479132	479143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017337	TTTTTA	2	12	482536	482547	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017337	AAAATG	2	12	487967	487978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017337	ACGTTG	2	12	508422	508433	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017337	AAAATA	2	12	509146	509157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017337	TTACTT	2	12	522834	522845	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017337	TTATAA	2	12	528543	528554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017337	AAATTT	2	12	535302	535313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017337	TTACTT	2	12	567609	567620	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017337	AAAGTT	2	12	573352	573363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017337	TTATAA	2	12	590956	590967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017337	GTTATA	2	12	591627	591638	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017337	CTTAAA	2	12	600058	600069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017337	ACATGT	2	12	610028	610039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017337	ATTGCG	2	12	639397	639408	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017337	TAAAAT	2	12	658734	658745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017337	TTTTAA	2	12	664824	664835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017337	CATTAT	2	12	681428	681439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017337	CATCAA	2	12	691776	691787	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017337	TAATTT	2	12	696016	696027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017337	TGAATA	2	12	712494	712505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017337	GGATTC	2	12	723845	723856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017337	TAGTTA	2	12	742982	742993	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017337	TAATTA	2	12	753798	753809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017337	TTTTTA	2	12	761195	761206	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017337	TGAAAA	2	12	769437	769448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017337	AATGAT	2	12	797800	797811	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017337	TAAAAA	2	12	858011	858022	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017337	TATCAA	2	12	864495	864506	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017337	ATATAA	2	12	865868	865879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017337	TTTTGA	2	12	868318	868329	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017337	AAATTA	2	12	884569	884580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017337	ATGATT	2	12	893449	893460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017337	ATGATT	2	12	893492	893503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017337	TAAAAT	2	12	901234	901245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017337	TTTAAT	2	12	974430	974441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017337	ATGGCA	2	12	997799	997810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017337	AACGGA	2	12	1006356	1006367	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017337	CATTTA	2	12	1034546	1034557	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017337	ATCATA	2	12	1036450	1036461	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017337	TCAAAA	2	12	1042956	1042967	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017337	TATGTA	2	12	1056593	1056604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017337	TTTTCT	2	12	1056688	1056699	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017337	TTTATA	2	12	1092466	1092477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017337	CTGTGA	2	12	1115261	1115272	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017337	CAAGTG	2	12	1115441	1115452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017337	AAGAAT	2	12	1120048	1120059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017337	GTAAAT	2	12	1143720	1143731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017337	ATAATT	2	12	1158209	1158220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017337	TCATTA	2	12	1163549	1163560	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017337	TAATGA	2	12	1171640	1171651	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017337	AGTTCT	2	12	1181384	1181395	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017337	ATTTAT	2	12	1190767	1190778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017337	AAATTT	2	12	1195503	1195514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017337	AAGTAA	2	12	1217198	1217209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017337	TTAATT	2	12	1231797	1231808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017337	AATTAA	2	12	1234587	1234598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017337	GAAATT	2	12	1278850	1278861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017337	AATGAT	2	12	1291624	1291635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017337	AGAAAA	2	12	1301859	1301870	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017337	TAAAGA	2	12	1306101	1306112	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017337	TATATT	2	12	1326568	1326579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017337	ATGTAT	2	12	1352269	1352280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017337	AAAGAA	2	12	1352502	1352513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017337	AAATAT	2	12	1359153	1359164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017337	ATTAAA	2	12	1387234	1387245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017337	ATATAA	2	12	1395153	1395164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017337	GTTTTA	2	12	1424970	1424981	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017337	TTACAA	2	12	1428406	1428417	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017337	AGTAAA	2	12	1440543	1440554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017337	TATCTT	2	12	1462589	1462600	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017337	TTGATT	2	12	1462652	1462663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017337	ATTCTA	2	12	1470519	1470530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017337	AATAAA	2	12	1473374	1473385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017337	TTTCTT	2	12	1483572	1483583	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017337	CTTGTT	2	12	1484837	1484848	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017337	GCTTTT	2	12	1485442	1485453	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017337	ATCTGC	2	12	1491909	1491920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017337	CATTAG	2	12	1494110	1494121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017337	GTTGGT	2	12	1495990	1496001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017337	TTTTTG	2	12	1497735	1497746	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017337	TCGCTT	2	12	1498540	1498551	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017337	TTTTTG	2	12	1500758	1500769	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017337	TAACAG	2	12	1506451	1506462	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017337	TTAGCA	2	12	1506666	1506677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017337	ACTGTT	2	12	1506918	1506929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017337	ATTGAA	2	12	1507017	1507028	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017337	TATTCT	2	12	1518447	1518458	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017337	TACTTG	2	12	1528648	1528659	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017337	TTAATC	2	12	1542122	1542133	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017337	TGAAAA	2	12	1561215	1561226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017337	TCTTTT	2	12	1567003	1567014	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017337	ATAAAA	2	12	1585337	1585348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017337	ATTATC	2	12	1588982	1588993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017337	ACAAGA	2	12	1590914	1590925	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017337	TTATAG	2	12	1612946	1612957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017337	AATTTA	2	12	1620981	1620992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017337	AGCCAA	2	12	1648868	1648879	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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132	NC_017337	TTATAA	2	12	1656203	1656214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017337	ACCTTT	2	12	1666160	1666171	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017337	AGTTTT	2	12	1694602	1694613	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_017337	AATTTA	2	12	1708796	1708807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017337	ATTATA	2	12	1885671	1885682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_017337	ATATAA	2	12	2826478	2826489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.