MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398 plasmid pS0385-3

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017336	TCG	2	6	2	7	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017336	A	6	6	64	69	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017336	TAC	2	6	189	194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017336	CTA	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017336	T	6	6	226	231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017336	TAG	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017336	T	6	6	241	246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017336	TA	3	6	313	318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017336	TA	3	6	323	328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017336	TC	3	6	382	387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017336	TTAC	2	8	418	425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017336	T	7	7	460	466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017336	TA	3	6	499	504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017336	CT	3	6	525	530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017336	TA	3	6	537	542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017336	T	6	6	570	575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017336	T	6	6	595	600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017336	A	7	7	649	655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017336	A	7	7	754	760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017336	T	6	6	1836	1841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017336	T	6	6	1849	1854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017336	TA	3	6	1930	1935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017336	CAAGA	2	10	1940	1949	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017336	AAT	2	6	2874	2879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017336	TA	4	8	2901	2908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017336	A	6	6	2922	2927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017336	TTC	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017336	TTCTT	2	10	3096	3105	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.