MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017333	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017333	GTAGG	2	10	14401	14410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017333	TTTTA	2	10	22211	22220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017333	TCGAT	2	10	23813	23822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017333	ATATT	2	10	24351	24360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017333	CAATT	2	10	34471	34480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017333	GAAAT	2	10	42734	42743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017333	ATGAG	2	10	46057	46066	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017333	GCCAT	2	10	50416	50425	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017333	TATAG	2	10	54208	54217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017333	GAAAA	2	10	63287	63296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017333	ATGTT	2	10	63305	63314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017333	CAAAA	2	10	63782	63791	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017333	TTGAA	2	10	63902	63911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017333	GAAGG	2	10	64168	64177	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017333	GATTA	2	10	67392	67401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017333	AAAAT	2	10	70152	70161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017333	GTCCT	2	10	75068	75077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017333	TAAAA	2	10	81537	81546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017333	AAAAT	2	10	88301	88310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017333	AAAAG	2	10	94922	94931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017333	AAAGT	2	10	96807	96816	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017333	ATTTA	2	10	100582	100591	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017333	TTTTA	2	10	101536	101545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017333	ATTCA	2	10	107491	107500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017333	CTAAT	2	10	108340	108349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017333	CAATT	2	10	109447	109456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017333	GTAAT	2	10	123442	123451	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017333	TAAAA	2	10	127729	127738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017333	TCATT	2	10	146130	146139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017333	AAAGC	2	10	191208	191217	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017333	CGTTT	2	10	192427	192436	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017333	TATCA	2	10	201003	201012	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017333	TAGAG	2	10	214405	214414	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017333	CAACT	2	10	223269	223278	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017333	GCTTT	2	10	227781	227790	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017333	TAACA	2	10	232854	232863	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017333	AATAT	2	10	252248	252257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017333	TATTT	2	10	258238	258247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017333	AACAT	2	10	266620	266629	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017333	GATAA	2	10	270557	270566	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017333	ATAAC	2	10	275204	275213	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017333	TGAAT	2	10	275315	275324	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017333	ATTAA	2	10	276270	276279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017333	AAAGT	2	10	280015	280024	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017333	TAAAA	2	10	281727	281736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017333	AAATT	2	10	283044	283053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017333	GAAAA	2	10	305340	305349	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017333	ATAAA	2	10	305458	305467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017333	AAATT	2	10	315720	315729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017333	TCATA	2	10	316760	316769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017333	TGATG	2	10	329752	329761	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017333	ATTTA	2	10	330685	330694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017333	GATTT	2	10	347645	347654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017333	TAAAT	2	10	361141	361150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017333	ATTTT	2	10	366698	366707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017333	ATTAA	2	10	386414	386423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017333	ATAGA	2	10	420117	420126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017333	TGACA	2	10	420309	420318	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017333	GATAA	2	10	432611	432620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017333	TGAAA	2	10	443707	443716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017333	ATCAT	2	10	464124	464133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017333	TTGAA	2	10	466795	466804	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017333	AGAAT	2	10	467121	467130	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017333	ATGGT	2	10	468375	468384	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017333	TAAAA	2	10	473186	473195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017333	TAAAT	2	10	476016	476025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017333	AAAAT	2	10	476652	476661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017333	ACAGT	2	10	478588	478597	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017333	TAAAA	2	10	479085	479094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017333	GATTG	2	10	485727	485736	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017333	ATATC	2	10	486586	486595	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017333	TTATG	2	10	497589	497598	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017333	CAATT	2	10	500814	500823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017333	CATAA	2	10	502573	502582	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017333	AATCT	2	10	503951	503960	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017333	ACAGA	2	10	510675	510684	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017333	AAATT	2	10	517844	517853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017333	GGATT	2	10	522110	522119	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017333	CATAT	2	10	525843	525852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017333	TAAAG	2	10	526405	526414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017333	CTCAC	2	10	528323	528332	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_017333	CAAAG	2	10	528348	528357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017333	CTTAA	2	10	545948	545957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017333	TGGTG	2	10	563769	563778	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017333	TGTGG	2	10	563791	563800	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017333	CAACT	2	10	564335	564344	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017333	GGTAA	2	10	564808	564817	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017333	TCGTG	2	10	565627	565636	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017333	GATTG	2	10	567945	567954	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017333	GATTT	2	10	572570	572579	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017333	ATATA	2	10	574988	574997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017333	CAAAG	2	10	581536	581545	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017333	TTGAT	2	10	584698	584707	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017333	ATGAA	2	10	584769	584778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017333	AGACA	2	10	598657	598666	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017333	AAGTA	2	10	601093	601102	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017333	GATAA	2	10	603256	603265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017333	GGTAA	2	10	608717	608726	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017333	TCGTG	2	10	609536	609545	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017333	GATTG	2	10	611841	611850	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017333	GGTAA	2	10	613927	613936	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017333	TCGTG	2	10	614746	614755	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017333	GATTG	2	10	617032	617041	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017333	ATATA	2	10	623367	623376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017333	AAAAT	2	10	628141	628150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017333	TTTAT	2	10	628250	628259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017333	TTATG	2	10	631256	631265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017333	ATTTA	2	10	631401	631410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017333	ACAAT	2	10	633206	633215	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017333	TGAAT	2	10	637675	637684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017333	GTATA	2	10	637732	637741	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017333	TATAA	2	10	641449	641458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017333	TAAAG	2	10	661811	661820	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017333	GAAGC	2	10	663166	663175	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017333	TAAAA	2	10	667863	667872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017333	ATATT	2	10	667945	667954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017333	AATTT	2	10	670474	670483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017333	ATAAA	2	10	674948	674957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017333	TTATA	2	10	690392	690401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017333	AATCA	2	10	690848	690857	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017333	ATGAT	2	10	699839	699848	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017333	TAATT	2	10	703326	703335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017333	TATTG	2	10	708287	708296	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017333	AATGA	2	10	709194	709203	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017333	TTTAA	2	10	711429	711438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017333	TAAAT	2	10	717503	717512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017333	AAATT	2	10	719506	719515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017333	TAAAA	2	10	726552	726561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017333	ATTAA	2	10	728740	728749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017333	TTATT	2	10	728789	728798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017333	CAATA	2	10	728855	728864	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017333	TTAAT	2	10	731481	731490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017333	ATAAA	2	10	740453	740462	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017333	TTTTA	2	10	742719	742728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017333	AAAGG	2	10	743040	743049	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017333	ATATA	2	10	746342	746351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017333	AAACT	2	10	749866	749875	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017333	TTCAC	2	10	755079	755088	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017333	TTTGT	2	10	758987	758996	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017333	AATGA	2	10	759060	759069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017333	GGTTG	2	10	766063	766072	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017333	AAGTT	2	10	776114	776123	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017333	AATTG	2	10	776146	776155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017333	ATTTA	2	10	778407	778416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017333	AAAGT	2	10	780654	780663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017333	AATTT	2	10	783263	783272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017333	AGAAT	2	10	785205	785214	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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