MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST398

Total Repeats: 12299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017333	CAAT	2	8	30	37	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017333	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017333	AC	4	8	148	155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017333	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017333	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017333	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017333	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017333	ACT	2	6	382	387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017333	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017333	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017333	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017333	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017333	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017333	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017333	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017333	CATA	2	8	2004	2011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017333	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017333	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017333	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017333	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017333	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017333	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017333	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017333	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017333	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017333	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017333	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017333	A	6	6	3538	3543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017333	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017333	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017333	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017333	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017333	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017333	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017333	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017333	AGT	2	6	9748	9753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017333	AT	3	6	10625	10630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017333	TAT	2	6	10650	10655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017333	ATT	3	9	10670	10678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017333	ATT	2	6	10736	10741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017333	ACA	2	6	10752	10757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017333	ATA	2	6	10795	10800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017333	AAG	2	6	10855	10860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017333	TGAT	2	8	12419	12426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017333	TAA	2	6	12481	12486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017333	AT	3	6	12509	12514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017333	AG	3	6	12528	12533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017333	AT	4	8	12562	12569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017333	CTAC	2	8	12574	12581	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017333	T	7	7	12712	12718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017333	A	6	6	12726	12731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017333	ATA	2	6	12751	12756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017333	ATT	2	6	12764	12769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017333	TA	3	6	14102	14107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017333	GTG	2	6	14158	14163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017333	T	7	7	14180	14186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017333	AAC	2	6	14222	14227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017333	CAA	2	6	14275	14280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017333	ATG	2	6	14293	14298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017333	TAT	2	6	14338	14343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017333	GTA	2	6	14378	14383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017333	GTAGG	2	10	14401	14410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017333	TCA	2	6	14460	14465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017333	A	6	6	14474	14479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017333	AAC	2	6	14500	14505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017333	TAAA	2	8	14537	14544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017333	TAT	2	6	14670	14675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017333	T	6	6	14675	14680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017333	TA	3	6	14687	14692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017333	AGG	2	6	14708	14713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017333	AAC	2	6	15882	15887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017333	TCA	2	6	15909	15914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017333	CTT	2	6	16053	16058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017333	T	7	7	16080	16086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017333	AGG	2	6	16092	16097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017333	TA	3	6	17080	17085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017333	TAAATC	2	12	17164	17175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017333	AAT	2	6	17203	17208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017333	CA	3	6	17226	17231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017333	TTA	2	6	17261	17266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017333	TTA	2	6	17277	17282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017333	ATA	2	6	17346	17351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017333	AAT	2	6	22180	22185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017333	ATTATG	2	12	22187	22198	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017333	TTTTA	2	10	22211	22220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017333	AT	3	6	22235	22240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017333	TA	3	6	23730	23735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017333	AGG	2	6	23784	23789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017333	TCGAT	2	10	23813	23822	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017333	A	6	6	23832	23837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017333	AGA	2	6	23874	23879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017333	GAT	2	6	23883	23888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017333	AAG	2	6	23923	23928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017333	TGAA	2	8	23972	23979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017333	ATT	2	6	24015	24020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017333	TTC	2	6	24066	24071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017333	A	6	6	24072	24077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017333	A	6	6	24095	24100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017333	ATCT	2	8	24133	24140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017333	CGG	2	6	24191	24196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017333	T	6	6	24229	24234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017333	GCCT	2	8	24261	24268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017333	T	7	7	24337	24343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017333	ATATT	2	10	24351	24360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017333	AGT	2	6	24424	24429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017333	T	6	6	24460	24465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017333	GAC	2	6	24493	24498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017333	AAAT	2	8	24500	24507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017333	TTA	2	6	24613	24618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017333	AT	3	6	24628	24633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017333	TTC	2	6	24650	24655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017333	CCA	2	6	24667	24672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017333	TCC	2	6	24674	24679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017333	AAT	2	6	24704	24709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017333	ATTT	2	8	24713	24720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017333	TAT	2	6	24765	24770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017333	TCA	2	6	24784	24789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017333	CCG	2	6	24815	24820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017333	TAA	2	6	24829	24834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017333	A	6	6	24833	24838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017333	AT	3	6	24844	24849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017333	TA	3	6	24895	24900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017333	T	6	6	24969	24974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017333	A	6	6	24999	25004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017333	ATA	2	6	25012	25017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017333	TAA	2	6	29714	29719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017333	TCA	2	6	29735	29740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017333	TTA	2	6	29778	29783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017333	AT	3	6	29822	29827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017333	TAA	2	6	29900	29905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017333	CATT	2	8	29912	29919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017333	ATA	2	6	29974	29979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017333	AG	4	8	30064	30071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017333	CTG	2	6	30920	30925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017333	TGT	2	6	30954	30959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017333	TGG	2	6	30960	30965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017333	TGT	2	6	30974	30979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017333	A	6	6	31006	31011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017333	AAT	2	6	31038	31043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017333	ATCA	2	8	31053	31060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017333	ATA	2	6	31080	31085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017333	AT	3	6	33442	33447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017333	TAC	2	6	33457	33462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017333	T	6	6	33493	33498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017333	TAA	2	6	33551	33556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017333	GGA	2	6	34331	34336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017333	AT	3	6	34342	34347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017333	TAA	2	6	34397	34402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017333	TGA	2	6	34419	34424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017333	AT	3	6	34431	34436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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