MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20

Total Repeats: 13937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017331	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017331	AC	4	8	148	155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017331	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017331	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017331	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017331	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017331	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017331	GTT	2	6	411	416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017331	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017331	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017331	GTT	2	6	466	471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017331	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017331	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017331	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017331	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017331	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017331	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017331	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017331	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017331	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017331	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017331	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017331	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017331	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017331	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017331	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017331	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017331	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017331	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017331	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017331	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017331	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017331	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017331	A	7	7	9667	9673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017331	G	6	6	9693	9698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017331	CTATA	2	10	9725	9734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017331	AT	3	6	10619	10624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017331	TAT	2	6	10644	10649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017331	ATT	3	9	10664	10672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017331	ATT	2	6	10730	10735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017331	ACA	2	6	10746	10751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017331	ATA	2	6	10789	10794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017331	AAG	2	6	10849	10854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017331	TGAT	2	8	12413	12420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017331	TAA	2	6	12475	12480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017331	AT	3	6	12503	12508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017331	AG	3	6	12522	12527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017331	AT	4	8	12556	12563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017331	CTAC	2	8	12568	12575	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017331	T	7	7	12706	12712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017331	A	6	6	12720	12725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017331	ATA	2	6	12745	12750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017331	ATT	2	6	12758	12763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017331	TA	3	6	14096	14101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017331	ATA	2	6	14138	14143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017331	GTG	2	6	14153	14158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017331	T	7	7	14175	14181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017331	AAC	2	6	14217	14222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017331	TGT	2	6	14236	14241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017331	CAA	2	6	14270	14275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017331	ATG	2	6	14288	14293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017331	TAT	2	6	14333	14338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017331	A	6	6	14354	14359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017331	GTA	2	6	14374	14379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017331	GTAGG	2	10	14397	14406	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017331	G	6	6	14405	14410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017331	TCA	2	6	14451	14456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017331	A	6	6	14465	14470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017331	AAC	2	6	14491	14496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017331	GTA	2	6	14521	14526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017331	TAAA	2	8	14528	14535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017331	TAT	2	6	14661	14666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017331	T	6	6	14666	14671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017331	TA	3	6	14678	14683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017331	AGG	2	6	14699	14704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017331	ATC	2	6	15809	15814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017331	AAC	2	6	15873	15878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017331	TCA	2	6	15900	15905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017331	CTT	2	6	16044	16049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017331	T	6	6	16071	16076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017331	AGG	2	6	16082	16087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017331	TA	3	6	17070	17075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017331	TAAATC	2	12	17154	17165	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017331	AAT	2	6	17193	17198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017331	CA	3	6	17216	17221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017331	TTA	2	6	17267	17272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017331	ATA	2	6	17336	17341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017331	AAT	2	6	22169	22174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017331	AT	3	6	22224	22229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017331	TGA	2	6	22251	22256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017331	TA	3	6	23719	23724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017331	AGG	2	6	23773	23778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017331	TCGAT	2	10	23802	23811	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017331	A	6	6	23821	23826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017331	GGT	2	6	23839	23844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017331	AGA	2	6	23863	23868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017331	GAT	2	6	23872	23877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017331	ATT	2	6	24004	24009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017331	ATA	2	6	24010	24015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017331	TTC	2	6	24055	24060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017331	A	6	6	24061	24066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017331	A	6	6	24084	24089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017331	ATCT	2	8	24122	24129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017331	CGG	2	6	24180	24185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017331	T	6	6	24218	24223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017331	GCCT	2	8	24250	24257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017331	T	6	6	24326	24331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017331	ATATT	2	10	24339	24348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017331	T	6	6	24470	24475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017331	TTA	2	6	24496	24501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017331	ATA	2	6	24550	24555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017331	TATT	2	8	24557	24564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017331	T	6	6	24596	24601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017331	TAA	2	6	24610	24615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017331	CCG	2	6	24670	24675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017331	TAA	2	6	24684	24689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017331	A	6	6	24688	24693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017331	AT	3	6	24699	24704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017331	TA	3	6	24750	24755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017331	T	6	6	24824	24829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017331	A	6	6	24854	24859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017331	ATA	2	6	24867	24872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017331	TAA	2	6	29569	29574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017331	TCA	2	6	29590	29595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017331	TAT	2	6	29634	29639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017331	AT	3	6	29677	29682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017331	TAA	2	6	29755	29760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017331	CATT	2	8	29767	29774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017331	AG	3	6	29919	29924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017331	CTG	2	6	30775	30780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017331	T	7	7	30801	30807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017331	TGT	2	6	30809	30814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017331	TGG	2	6	30815	30820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017331	TGT	2	6	30829	30834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017331	A	6	6	30861	30866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017331	AAT	2	6	30893	30898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017331	ATCA	2	8	30908	30915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017331	ATA	2	6	30935	30940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017331	AT	3	6	33294	33299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017331	TAC	2	6	33309	33314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017331	T	7	7	33345	33351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017331	A	7	7	33355	33361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017331	TAA	2	6	33405	33410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017331	TAA	2	6	33580	33585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017331	TAA	2	6	33607	33612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017331	GGA	2	6	33645	33650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017331	GGA	2	6	34185	34190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017331	AT	3	6	34196	34201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017331	TAA	2	6	34251	34256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017331	TGA	2	6	34273	34278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017331	AT	3	6	34285	34290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017331	AATTA	2	10	34326	34335	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017331	TGA	3	9	34342	34350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017331	TTTAAA	2	12	34354	34365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_017331	ATA	2	6	34797	34802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_017331	GA	3	6	34877	34882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017331	TA	4	8	35804	35811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017331	TTAA	2	8	35838	35845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017331	GA	3	6	35848	35853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_017331	A	6	6	36303	36308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017331	AT	3	6	36326	36331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017331	AAT	2	6	36429	36434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017331	ATT	2	6	36895	36900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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