MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 5263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017327	CTG	2	6	1208593	1208598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017327	GCG	2	6	1208611	1208616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017327	ATC	2	6	1208628	1208633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_017327	GCG	2	6	1212212	1212217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_017327	GGC	2	6	1212234	1212239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_017327	CAG	2	6	1213489	1213494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017327	TGG	2	6	1213521	1213526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_017327	CAA	2	6	1213636	1213641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017327	TCG	2	6	1215001	1215006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017327	CAG	2	6	1215049	1215054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_017327	TGC	2	6	1215057	1215062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_017327	GAG	2	6	1215212	1215217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017327	TGCG	2	8	1216055	1216062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_017327	ATG	2	6	1216082	1216087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017327	CG	3	6	1216126	1216131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_017327	TCT	2	6	1216151	1216156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017327	AATC	2	8	1216176	1216183	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4018	NC_017327	CTG	3	9	1216228	1216236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017327	TGC	2	6	1216262	1216267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017327	CAG	2	6	1216285	1216290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017327	GCC	2	6	1216305	1216310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_017327	GCC	2	6	1216398	1216403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_017327	GCC	2	6	1216441	1216446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_017327	TGC	3	9	1217624	1217632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017327	TCT	2	6	1217715	1217720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_017327	TGA	2	6	1217737	1217742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017327	ACG	2	6	1217754	1217759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017327	CGT	2	6	1217770	1217775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_017327	CTTCG	2	10	1217783	1217792	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4030	NC_017327	GCC	2	6	1219547	1219552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_017327	ACT	2	6	1220312	1220317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_017327	CCA	2	6	1220794	1220799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_017327	A	6	6	1220799	1220804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017327	AGA	2	6	1220807	1220812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017327	AAG	2	6	1220850	1220855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017327	GCC	2	6	1220868	1220873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_017327	CGC	2	6	1220932	1220937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_017327	AAC	2	6	1220959	1220964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017327	CAA	2	6	1221060	1221065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017327	GT	3	6	1221122	1221127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017327	CAT	2	6	1221209	1221214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017327	AG	3	6	1221229	1221234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017327	ACGC	2	8	1221278	1221285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_017327	TGCC	2	8	1221390	1221397	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_017327	GGC	2	6	1221406	1221411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017327	GCA	2	6	1221415	1221420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017327	CG	3	6	1221492	1221497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4048	NC_017327	GTC	2	6	1221545	1221550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_017327	AAC	2	6	1221649	1221654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017327	CCT	2	6	1221940	1221945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_017327	TGG	2	6	1221957	1221962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017327	ACCC	2	8	1221970	1221977	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4053	NC_017327	AGG	2	6	1221985	1221990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017327	TCG	2	6	1222403	1222408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017327	TGG	2	6	1222488	1222493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017327	CGG	2	6	1222494	1222499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017327	GTC	2	6	1222509	1222514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017327	GGC	2	6	1222875	1222880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017327	TC	3	6	1222929	1222934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4060	NC_017327	CCG	2	6	1222968	1222973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_017327	CAG	2	6	1223035	1223040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017327	TTGG	2	8	1223683	1223690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017327	CGG	2	6	1223781	1223786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_017327	CGA	2	6	1223823	1223828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017327	AAT	2	6	1224341	1224346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017327	CTC	2	6	1224408	1224413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_017327	AGA	2	6	1224444	1224449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017327	CCAT	2	8	1224513	1224520	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_017327	CGG	2	6	1225243	1225248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017327	GCTG	2	8	1225250	1225257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4071	NC_017327	TGG	2	6	1225279	1225284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017327	TTCC	2	8	1225287	1225294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_017327	CT	3	6	1225339	1225344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_017327	TCCG	2	8	1225383	1225390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_017327	CAT	2	6	1225409	1225414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017327	CA	3	6	1225433	1225438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_017327	CGG	2	6	1225471	1225476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_017327	ATCT	2	8	1225522	1225529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_017327	CAT	2	6	1225611	1225616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017327	CGTGA	2	10	1225622	1225631	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4081	NC_017327	TTC	2	6	1226502	1226507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017327	CCGG	2	8	1226520	1226527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_017327	GC	3	6	1226858	1226863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_017327	GGC	2	6	1226870	1226875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017327	CGA	2	6	1226880	1226885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017327	TA	3	6	1226930	1226935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017327	GGCT	2	8	1229160	1229167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4088	NC_017327	CAT	2	6	1229173	1229178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017327	CGC	2	6	1229270	1229275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_017327	ACA	2	6	1229292	1229297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017327	CG	3	6	1229303	1229308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_017327	GCT	2	6	1230372	1230377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017327	GCGTCG	2	12	1230378	1230389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017327	CGC	2	6	1230420	1230425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_017327	GGC	2	6	1230639	1230644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_017327	C	6	6	1230683	1230688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4097	NC_017327	GGC	2	6	1230694	1230699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_017327	TGGGAC	2	12	1230764	1230775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4099	NC_017327	ATC	2	6	1232703	1232708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_017327	CAA	2	6	1232742	1232747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017327	GA	3	6	1232767	1232772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017327	GCC	2	6	1232775	1232780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_017327	GAC	2	6	1232798	1232803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017327	CCG	2	6	1232835	1232840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_017327	CTG	2	6	1232848	1232853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_017327	TTCCT	2	10	1235227	1235236	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4107	NC_017327	AGG	2	6	1235239	1235244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017327	GT	3	6	1235283	1235288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017327	CGTG	2	8	1235315	1235322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4110	NC_017327	CGA	2	6	1240599	1240604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017327	CCG	3	9	1240637	1240645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_017327	TAA	2	6	1240720	1240725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017327	GTA	2	6	1240802	1240807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017327	TGC	2	6	1240845	1240850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017327	GTG	2	6	1240858	1240863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017327	GCA	2	6	1240894	1240899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017327	CG	3	6	1240945	1240950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_017327	CACC	2	8	1240972	1240979	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4119	NC_017327	CGC	2	6	1240993	1240998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_017327	GCG	3	9	1241112	1241120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_017327	CCA	2	6	1241128	1241133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_017327	GTC	3	9	1241224	1241232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017327	TGT	2	6	1241255	1241260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017327	GT	3	6	1241265	1241270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017327	TC	3	6	1243836	1243841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_017327	G	6	6	1244933	1244938	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017327	ATCG	2	8	1245641	1245648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_017327	CG	3	6	1245696	1245701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_017327	CAAG	2	8	1245752	1245759	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_017327	CGA	2	6	1245765	1245770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4132	NC_017327	AT	3	6	1245924	1245929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017327	TCG	2	6	1245974	1245979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4139	NC_017327	GC	3	6	1246328	1246333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4140	NC_017327	CCCG	2	8	1246425	1246432	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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4384	NC_017327	CGG	2	6	1322512	1322517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4390	NC_017327	CGA	2	6	1324422	1324427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4391	NC_017327	ATC	2	6	1324439	1324444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4392	NC_017327	AAAC	2	8	1324459	1324466	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4393	NC_017327	CGAT	2	8	1324508	1324515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4394	NC_017327	ATC	2	6	1324523	1324528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4395	NC_017327	CGT	2	6	1324563	1324568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4396	NC_017327	GCG	2	6	1324587	1324592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4398	NC_017327	GTC	2	6	1324657	1324662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4399	NC_017327	ATC	2	6	1324822	1324827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4400	NC_017327	CTTGCA	2	12	1324849	1324860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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