MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 5263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017327	AC	3	6	262559	262564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_017327	CCATC	2	10	262605	262614	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1003	NC_017327	GGC	2	6	262645	262650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017327	A	7	7	262696	262702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017327	GATC	2	8	262783	262790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_017327	CCT	2	6	265284	265289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_017327	TCT	3	9	265324	265332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_017327	CTT	2	6	265333	265338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017327	GCC	2	6	265435	265440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_017327	GAG	2	6	265454	265459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017327	GGA	2	6	265511	265516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017327	GAT	2	6	268414	268419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017327	TGT	2	6	268534	268539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017327	ATT	2	6	268543	268548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017327	GTT	2	6	268552	268557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017327	CTTT	2	8	268620	268627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_017327	GAC	2	6	268650	268655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017327	GTC	2	6	268719	268724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017327	GTG	2	6	268785	268790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017327	TCGG	2	8	268814	268821	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_017327	CGC	2	6	268837	268842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_017327	AGG	2	6	268961	268966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017327	GTG	2	6	268980	268985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017327	GGA	2	6	269221	269226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017327	ATG	2	6	269231	269236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017327	GC	3	6	269260	269265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_017327	TGT	2	6	269344	269349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017327	GC	4	8	269394	269401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_017327	CTTT	2	8	269463	269470	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017327	ATCA	2	8	269954	269961	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_017327	GAG	2	6	270012	270017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017327	CAA	2	6	270035	270040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017327	AACC	2	8	270071	270078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_017327	AGA	2	6	270104	270109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017327	GTC	2	6	270155	270160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017327	GCC	2	6	270258	270263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_017327	TCA	2	6	270264	270269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017327	GCATTC	2	12	270327	270338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017327	CAG	2	6	270593	270598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017327	GAA	2	6	270628	270633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017327	ATC	2	6	270749	270754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017327	GAG	2	6	270860	270865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017327	GAT	2	6	270911	270916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017327	CTT	2	6	270963	270968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017327	GCC	2	6	271026	271031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_017327	TGG	2	6	271282	271287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017327	CAA	2	6	271293	271298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017327	GCC	2	6	271325	271330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_017327	GCC	2	6	271350	271355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_017327	GCT	2	6	271394	271399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_017327	GCC	2	6	271478	271483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_017327	TCC	2	6	272484	272489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_017327	CAG	2	6	272576	272581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017327	TG	3	6	272682	272687	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017327	ATG	2	6	272696	272701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017327	GC	3	6	272768	272773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_017327	AAG	2	6	273589	273594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017327	G	6	6	273614	273619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017327	GCTG	2	8	273629	273636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_017327	CAA	2	6	273652	273657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017327	GCT	2	6	273687	273692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017327	T	6	6	273733	273738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017327	CCTC	2	8	273774	273781	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1064	NC_017327	GGC	2	6	273797	273802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017327	GCG	2	6	275144	275149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017327	GCC	2	6	275160	275165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_017327	TCG	2	6	275188	275193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017327	GTT	2	6	275302	275307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017327	GCT	2	6	275309	275314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017327	CGA	2	6	275317	275322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017327	CGC	2	6	275337	275342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_017327	CGA	2	6	275358	275363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017327	TC	3	6	275432	275437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_017327	TTCA	2	8	275439	275446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_017327	GCG	2	6	275458	275463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017327	TGC	2	6	275481	275486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_017327	GGC	2	6	275494	275499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017327	AGAC	2	8	275507	275514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_017327	CAG	2	6	275901	275906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_017327	CTGG	2	8	275942	275949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_017327	ATG	2	6	276111	276116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017327	AG	3	6	276156	276161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017327	CGG	2	6	276181	276186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017327	GGAT	2	8	276286	276293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017327	GCA	2	6	276303	276308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017327	TTGAT	2	10	276434	276443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017327	CTT	2	6	276455	276460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017327	TTC	2	6	276510	276515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017327	CTT	2	6	276574	276579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_017327	TTTCG	2	10	276637	276646	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_017327	TTG	2	6	276674	276679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017327	ACG	2	6	276680	276685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_017327	TTGT	2	8	277206	277213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017327	GCT	2	6	278038	278043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017327	GCTC	2	8	278245	278252	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_017327	GCT	2	6	278284	278289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_017327	AGA	3	9	278321	278329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017327	TCG	2	6	278380	278385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017327	AAC	2	6	278466	278471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017327	GCC	2	6	278563	278568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_017327	GCA	2	6	278579	278584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017327	ACG	2	6	278596	278601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017327	CGGC	2	8	278604	278611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_017327	ATTT	2	8	278659	278666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017327	GTT	2	6	278799	278804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017327	T	6	6	280977	280982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017327	CGT	2	6	285741	285746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017327	CCGT	2	8	285822	285829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_017327	TTC	2	6	285906	285911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017327	GCG	2	6	285916	285921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_017327	TTG	2	6	285928	285933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017327	AAG	2	6	285957	285962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017327	AT	3	6	286636	286641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017327	AGG	2	6	286666	286671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017327	TGT	2	6	287289	287294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017327	AGC	2	6	287503	287508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017327	CTG	2	6	287509	287514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017327	GTC	2	6	287525	287530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017327	CGG	2	6	289029	289034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017327	GCAGG	2	10	289052	289061	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_017327	TC	3	6	289110	289115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017327	GGGA	2	8	289118	289125	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017327	AACG	2	8	289137	289144	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_017327	GGGC	2	8	289147	289154	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_017327	GAG	2	6	289223	289228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017327	CAA	2	6	289305	289310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017327	TGT	2	6	289332	289337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017327	CGGG	2	8	289343	289350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_017327	TCGC	2	8	289421	289428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_017327	AAT	2	6	289441	289446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017327	GGC	3	9	289447	289455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017327	CATG	2	8	289601	289608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_017327	GCT	2	6	289635	289640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_017327	TCG	2	6	289715	289720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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