MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 5263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017327	AGG	2	6	143664	143669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017327	TGA	2	6	143690	143695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017327	TGC	2	6	143744	143749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017327	AGG	2	6	143850	143855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017327	CGC	2	6	143884	143889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_017327	GC	3	6	143888	143893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_017327	CAA	2	6	143926	143931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017327	TTG	2	6	143949	143954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017327	CGA	2	6	144037	144042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017327	AATT	2	8	144122	144129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017327	ACA	2	6	144130	144135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017327	TTC	2	6	144160	144165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017327	AGG	2	6	144249	144254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017327	GC	3	6	145028	145033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_017327	CGG	2	6	145101	145106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017327	CGA	2	6	145145	145150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017327	GCGG	2	8	145166	145173	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
518	NC_017327	GCC	2	6	145206	145211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017327	CCT	2	6	145248	145253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_017327	GC	3	6	145260	145265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_017327	TCG	2	6	145280	145285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017327	GTCG	2	8	145289	145296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_017327	GC	3	6	145325	145330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_017327	CCG	2	6	145428	145433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_017327	AAC	2	6	145476	145481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017327	CATTT	2	10	145540	145549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
527	NC_017327	CAT	2	6	145575	145580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017327	CA	3	6	145599	145604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017327	CGG	2	6	145858	145863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017327	TCCG	2	8	145892	145899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017327	TTG	2	6	145940	145945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017327	A	7	7	145998	146004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017327	CT	3	6	146085	146090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_017327	CTG	2	6	146129	146134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017327	TGC	2	6	147935	147940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_017327	GCC	2	6	148083	148088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_017327	GAC	2	6	148092	148097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_017327	TCA	2	6	148121	148126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017327	AGGT	2	8	148139	148146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017327	GCCGA	2	10	148183	148192	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
541	NC_017327	CAG	2	6	148237	148242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017327	GCA	2	6	148277	148282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017327	AGGAAC	2	12	148301	148312	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
544	NC_017327	CAGG	2	8	148360	148367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_017327	AAC	2	6	148410	148415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017327	TGA	2	6	148453	148458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017327	TCG	2	6	148461	148466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017327	TGC	2	6	148471	148476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017327	CAT	2	6	148499	148504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017327	GCA	2	6	148513	148518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017327	GCA	2	6	148522	148527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017327	CGA	2	6	148546	148551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017327	TCGC	2	8	149185	149192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_017327	GCA	2	6	149250	149255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017327	TCGA	2	8	149372	149379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
556	NC_017327	CGG	2	6	149384	149389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017327	GCT	2	6	149406	149411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017327	AATTC	2	10	149434	149443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
559	NC_017327	GGA	2	6	149447	149452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017327	GGC	2	6	149486	149491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017327	CCAC	2	8	149529	149536	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
562	NC_017327	TCG	2	6	150029	150034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017327	GC	3	6	150107	150112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
564	NC_017327	CCT	2	6	150127	150132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_017327	GA	3	6	150166	150171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017327	GGTGG	2	10	152144	152153	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017327	GGGC	2	8	152212	152219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
568	NC_017327	CGG	2	6	152261	152266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017327	GTG	2	6	152299	152304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017327	GA	3	6	152350	152355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017327	ATC	2	6	152374	152379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017327	CCTG	2	8	152400	152407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
573	NC_017327	TCG	2	6	152441	152446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_017327	AGC	2	6	152447	152452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017327	ATG	2	6	153348	153353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017327	CG	3	6	153978	153983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
577	NC_017327	GTG	2	6	154276	154281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017327	CGA	2	6	155347	155352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_017327	TCGGC	2	10	155428	155437	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
580	NC_017327	TAG	2	6	156548	156553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017327	CT	3	6	156571	156576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_017327	CGT	2	6	157131	157136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017327	GCA	2	6	157154	157159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017327	GCC	2	6	157652	157657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_017327	GCG	2	6	157685	157690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017327	GCCC	2	8	157721	157728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
587	NC_017327	A	6	6	158940	158945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017327	ATC	2	6	158965	158970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017327	CGT	2	6	159122	159127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017327	CCT	3	9	159140	159148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_017327	GGAAA	2	10	159192	159201	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017327	AG	3	6	159235	159240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017327	CGG	2	6	159244	159249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017327	CAC	2	6	160116	160121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_017327	AGC	2	6	160589	160594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017327	AAG	2	6	161638	161643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017327	TTGA	2	8	161669	161676	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017327	A	7	7	161680	161686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017327	C	6	6	161866	161871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
600	NC_017327	GAT	2	6	161904	161909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017327	GCC	2	6	161910	161915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_017327	CTG	2	6	161945	161950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017327	CTTC	2	8	161962	161969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_017327	AGGA	2	8	161979	161986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017327	GA	3	6	162001	162006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017327	TGAA	2	8	164302	164309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017327	ACA	2	6	164313	164318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017327	ATC	2	6	164319	164324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017327	ATC	2	6	164355	164360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017327	ATC	2	6	164379	164384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017327	GGC	2	6	164397	164402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017327	CG	3	6	164494	164499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_017327	CCA	2	6	166539	166544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_017327	AAATT	2	10	166570	166579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017327	AGT	2	6	166950	166955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017327	TCCG	2	8	167467	167474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
617	NC_017327	GTT	2	6	167490	167495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017327	AT	3	6	167557	167562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017327	TCA	2	6	167567	167572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017327	CCGCAG	2	12	167596	167607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
621	NC_017327	AGG	2	6	167614	167619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017327	GCC	2	6	167666	167671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_017327	GTC	2	6	167712	167717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017327	GCC	2	6	167725	167730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_017327	CCAT	2	8	167734	167741	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_017327	ACG	2	6	167744	167749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017327	CAG	2	6	167801	167806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_017327	TCA	2	6	167832	167837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017327	CCG	2	6	167858	167863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_017327	AAT	2	6	167878	167883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017327	GGC	2	6	167901	167906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017327	ATG	2	6	167927	167932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017327	CCA	2	6	167978	167983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_017327	AAT	2	6	168001	168006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017327	CGA	2	6	168052	168057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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637	NC_017327	TCGCT	2	10	168171	168180	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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792	NC_017327	CG	3	6	189756	189761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
793	NC_017327	GTG	2	6	189780	189785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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799	NC_017327	CTT	2	6	190050	190055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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910	NC_017327	AAGC	2	8	236609	236616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
911	NC_017327	TCGCG	2	10	238464	238473	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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914	NC_017327	TCT	2	6	238561	238566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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949	NC_017327	TCC	2	6	243917	243922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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