MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11c

Total Repeats: 5263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017327	CCG	2	6	1528104	1528109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_017327	GGA	2	6	1528129	1528134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017327	TCCC	2	8	1528140	1528147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5004	NC_017327	ACT	2	6	1528149	1528154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_017327	CATG	2	8	1528159	1528166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_017327	GCCT	2	8	1528174	1528181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_017327	CGC	2	6	1528234	1528239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_017327	CCT	2	6	1529301	1529306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_017327	AGG	2	6	1529314	1529319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017327	CCG	2	6	1529374	1529379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_017327	CTC	2	6	1529402	1529407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_017327	TC	3	6	1529406	1529411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_017327	ATC	2	6	1529425	1529430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017327	GCT	2	6	1531156	1531161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017327	AGG	2	6	1531223	1531228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017327	GCGT	2	8	1531460	1531467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_017327	AC	3	6	1531615	1531620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_017327	TCA	2	6	1532555	1532560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017327	TTA	2	6	1532574	1532579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017327	GGT	2	6	1533634	1533639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017327	GCT	2	6	1533659	1533664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017327	AGG	2	6	1533694	1533699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017327	GCT	2	6	1533934	1533939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017327	T	6	6	1533962	1533967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017327	CCG	2	6	1534323	1534328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_017327	GAG	2	6	1534346	1534351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017327	CCT	2	6	1534694	1534699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_017327	CAA	2	6	1534706	1534711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017327	GA	3	6	1534732	1534737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017327	GCC	2	6	1534789	1534794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_017327	GAT	2	6	1534880	1534885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017327	ACG	3	9	1534948	1534956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_017327	ATTC	2	8	1534970	1534977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_017327	GCC	2	6	1535011	1535016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_017327	C	6	6	1536180	1536185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5036	NC_017327	GGCA	2	8	1536193	1536200	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_017327	CGG	2	6	1536258	1536263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017327	CGAG	2	8	1536270	1536277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_017327	CAG	2	6	1536286	1536291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_017327	CGG	2	6	1536325	1536330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017327	CTG	2	6	1536341	1536346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017327	TCG	2	6	1536458	1536463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017327	CG	3	6	1536526	1536531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_017327	CAA	2	6	1537490	1537495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_017327	GCC	2	6	1537562	1537567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_017327	CGA	2	6	1537641	1537646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_017327	CGAG	3	12	1537662	1537673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_017327	CCG	2	6	1540301	1540306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_017327	CAA	2	6	1540333	1540338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_017327	CGG	3	9	1540343	1540351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_017327	CGC	2	6	1540909	1540914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_017327	TCC	2	6	1542627	1542632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_017327	C	6	6	1542729	1542734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5054	NC_017327	TAAA	2	8	1542761	1542768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017327	TGG	2	6	1542781	1542786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_017327	GCA	2	6	1543548	1543553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_017327	TTA	2	6	1543608	1543613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_017327	CGG	2	6	1543620	1543625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017327	GAA	2	6	1543646	1543651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017327	GC	3	6	1544674	1544679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_017327	GC	3	6	1544684	1544689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_017327	GAT	2	6	1544714	1544719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017327	CT	3	6	1550106	1550111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_017327	TA	3	6	1550147	1550152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017327	GAT	2	6	1550157	1550162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017327	C	7	7	1550196	1550202	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5067	NC_017327	TCCGT	2	10	1550220	1550229	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5068	NC_017327	AG	3	6	1551098	1551103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017327	AGA	2	6	1552970	1552975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017327	CGA	2	6	1552986	1552991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017327	AATG	2	8	1553036	1553043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017327	TCC	2	6	1553049	1553054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_017327	CCGG	2	8	1554539	1554546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_017327	CAA	2	6	1554554	1554559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017327	CCG	2	6	1555329	1555334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_017327	CTC	2	6	1557531	1557536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_017327	GCT	2	6	1557544	1557549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_017327	GTAA	2	8	1557579	1557586	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017327	TCC	2	6	1560205	1560210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_017327	GGCT	2	8	1560839	1560846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_017327	CCG	2	6	1560853	1560858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_017327	GCCC	2	8	1560878	1560885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5083	NC_017327	GCC	2	6	1560887	1560892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_017327	TGG	2	6	1560915	1560920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017327	TCGC	2	8	1562320	1562327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_017327	TCC	2	6	1562335	1562340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_017327	TCA	2	6	1562869	1562874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017327	GCG	2	6	1562875	1562880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017327	GCG	2	6	1563249	1563254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_017327	CGTT	2	8	1563320	1563327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_017327	TCCG	2	8	1563375	1563382	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5092	NC_017327	GCGT	2	8	1563431	1563438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5093	NC_017327	AACT	2	8	1563491	1563498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_017327	TCACG	2	10	1563600	1563609	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5095	NC_017327	AAT	2	6	1563620	1563625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017327	CG	3	6	1563648	1563653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_017327	GCC	2	6	1563679	1563684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5098	NC_017327	AGAA	2	8	1563700	1563707	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017327	AGC	2	6	1565713	1565718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_017327	CCGG	2	8	1565730	1565737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_017327	GGC	2	6	1565745	1565750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_017327	AAC	2	6	1565759	1565764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017327	GACG	2	8	1565765	1565772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_017327	ATCAG	2	10	1566224	1566233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5105	NC_017327	GCCC	2	8	1566446	1566453	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5106	NC_017327	CGG	2	6	1566457	1566462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_017327	TCA	2	6	1566470	1566475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_017327	CGG	2	6	1566657	1566662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_017327	GCT	2	6	1567247	1567252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_017327	TA	3	6	1567285	1567290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017327	CGA	2	6	1567317	1567322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_017327	ACC	2	6	1567367	1567372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_017327	CCA	2	6	1568715	1568720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_017327	GAC	2	6	1568813	1568818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_017327	GGC	2	6	1568844	1568849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_017327	GAG	2	6	1568852	1568857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_017327	ACG	2	6	1568929	1568934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017327	CG	3	6	1572252	1572257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_017327	T	6	6	1572322	1572327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_017327	CG	3	6	1572381	1572386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_017327	CTT	2	6	1572408	1572413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_017327	GGA	2	6	1572496	1572501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017327	CGCA	2	8	1572506	1572513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_017327	GAG	2	6	1572681	1572686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_017327	GCG	2	6	1572714	1572719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017327	GAA	2	6	1572786	1572791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017327	AGC	2	6	1573101	1573106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_017327	GCA	2	6	1573122	1573127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017327	GC	3	6	1573136	1573141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_017327	CTG	2	6	1573182	1573187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017327	CGC	2	6	1573203	1573208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_017327	CTG	2	6	1573214	1573219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_017327	CT	3	6	1573220	1573225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5134	NC_017327	CGC	2	6	1573229	1573234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5161	NC_017327	CCG	3	9	1592414	1592422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5247	NC_017327	TTC	2	6	1632013	1632018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_017327	CGG	2	6	1632356	1632361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5253	NC_017327	GTCC	2	8	1632442	1632449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5254	NC_017327	GAT	2	6	1632586	1632591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5256	NC_017327	CGC	2	6	1632799	1632804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5257	NC_017327	CGG	2	6	1632813	1632818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5258	NC_017327	ATC	2	6	1632822	1632827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_017327	AGGC	2	8	1632865	1632872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5260	NC_017327	GC	3	6	1632952	1632957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5261	NC_017327	CGTC	2	8	1632961	1632968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5262	NC_017327	GC	3	6	1633170	1633175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5263	NC_017327	AGT	2	6	1633243	1633248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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