MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d

Total Repeats: 3684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017326	CGC	2	6	438033	438038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_017326	GCGG	2	8	438059	438066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_017326	AG	3	6	440498	440503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017326	AGC	2	6	441108	441113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_017326	TA	3	6	441148	441153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017326	GTA	2	6	441156	441161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017326	TAA	2	6	441162	441167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017326	ATA	2	6	441178	441183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017326	T	7	7	441303	441309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017326	AGT	2	6	441310	441315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017326	CGGA	2	8	441396	441403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_017326	GCC	2	6	441473	441478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_017326	GC	3	6	441522	441527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_017326	GAA	2	6	441571	441576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017326	GCGCCG	2	12	441585	441596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_017326	GTC	2	6	441635	441640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017326	CGG	2	6	441707	441712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_017326	GAAG	2	8	441773	441780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017326	TCC	2	6	441793	441798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_017326	CGG	2	6	442200	442205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_017326	GCC	2	6	443117	443122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_017326	CGT	2	6	444694	444699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017326	CGA	4	12	444703	444714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017326	T	7	7	444733	444739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017326	G	6	6	444754	444759	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017326	CCT	2	6	445180	445185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_017326	TGC	2	6	445225	445230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_017326	CGT	2	6	445233	445238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017326	GCT	2	6	448956	448961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017326	ACAAA	2	10	448965	448974	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1031	NC_017326	GC	4	8	449032	449039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_017326	GGC	2	6	449050	449055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017326	AGA	2	6	451428	451433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017326	TGGA	2	8	452992	452999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017326	CGG	2	6	453144	453149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017326	GGTCG	2	10	453201	453210	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_017326	AAG	2	6	453239	453244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017326	GCGG	2	8	453259	453266	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_017326	CA	3	6	453274	453279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_017326	GTG	2	6	453770	453775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017326	GC	4	8	455120	455127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_017326	CGAT	2	8	455153	455160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_017326	GC	3	6	455162	455167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_017326	GC	3	6	457414	457419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_017326	TGAC	2	8	457424	457431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_017326	GCT	2	6	457432	457437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017326	CAA	2	6	457453	457458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017326	CG	3	6	457561	457566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_017326	G	6	6	457600	457605	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017326	ATG	2	6	457834	457839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017326	GCG	2	6	457860	457865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017326	GAT	2	6	457905	457910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017326	GC	3	6	458108	458113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_017326	GGC	2	6	458124	458129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017326	GAT	2	6	458146	458151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017326	CGC	2	6	458170	458175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_017326	CT	3	6	458248	458253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_017326	CCT	2	6	458289	458294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_017326	TTG	2	6	459169	459174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017326	GGA	2	6	459301	459306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017326	CTC	2	6	460287	460292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_017326	AGG	2	6	460295	460300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017326	GCC	2	6	460308	460313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_017326	ACG	2	6	462896	462901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017326	GGC	2	6	462933	462938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017326	GCC	2	6	462945	462950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_017326	CT	3	6	466642	466647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_017326	CT	3	6	466769	466774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_017326	GAT	2	6	466775	466780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017326	CCTG	2	8	466860	466867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_017326	A	6	6	468088	468093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017326	TC	3	6	470679	470684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_017326	CCG	2	6	472017	472022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_017326	CCAG	2	8	472065	472072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_017326	CTC	2	6	472096	472101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_017326	CGC	2	6	472105	472110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_017326	GCT	2	6	472120	472125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017326	GAG	2	6	472158	472163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017326	GCGG	2	8	472197	472204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_017326	CCT	2	6	474566	474571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_017326	GAG	2	6	474582	474587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017326	GC	3	6	474645	474650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_017326	CT	3	6	474656	474661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_017326	TCG	2	6	474672	474677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017326	AGGA	2	8	474684	474691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017326	GCG	2	6	474693	474698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017326	GTC	2	6	476292	476297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017326	CT	3	6	477082	477087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_017326	GC	3	6	477145	477150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_017326	GTTTT	2	10	477221	477230	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017326	GAA	2	6	478956	478961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017326	AC	3	6	478963	478968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_017326	AT	3	6	478991	478996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017326	TGC	2	6	479016	479021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_017326	TCAT	2	8	479070	479077	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_017326	GCCGG	2	10	479876	479885	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_017326	GGCT	2	8	479890	479897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_017326	ACA	2	6	480627	480632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_017326	AGCC	2	8	481192	481199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_017326	GCCG	2	8	482244	482251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_017326	C	6	6	483100	483105	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1102	NC_017326	CTGCC	2	10	483107	483116	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1103	NC_017326	TGG	2	6	483147	483152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017326	CAA	2	6	483179	483184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017326	GTT	2	6	483270	483275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017326	TTG	2	6	483276	483281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017326	GGCAG	2	10	484428	484437	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_017326	G	6	6	484439	484444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017326	CCCGCT	2	12	484452	484463	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017326	GC	3	6	484471	484476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_017326	CT	3	6	484523	484528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_017326	TGC	2	6	484529	484534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017326	GCAG	2	8	485839	485846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_017326	TTG	2	6	485891	485896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017326	C	6	6	485946	485951	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1116	NC_017326	CGG	2	6	487234	487239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017326	TCG	2	6	488269	488274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_017326	GCG	2	6	488364	488369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017326	CTT	2	6	489041	489046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_017326	CGGGA	2	10	489065	489074	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1121	NC_017326	CGG	2	6	491304	491309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_017326	CAG	2	6	491310	491315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017326	T	6	6	491347	491352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017326	GCG	2	6	491363	491368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_017326	GCC	2	6	491411	491416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_017326	GTCGCG	2	12	491553	491564	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_017326	A	7	7	491629	491635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017326	CTC	2	6	492141	492146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_017326	TGCCTG	2	12	492159	492170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_017326	CCAG	2	8	492181	492188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_017326	A	6	6	492206	492211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017326	CCGCA	2	10	492219	492228	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1133	NC_017326	GGA	2	6	492271	492276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017326	C	6	6	492283	492288	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1135	NC_017326	TCA	2	6	492323	492328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017326	GCC	3	9	493579	493587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_017326	TTC	2	6	493612	493617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_017326	GCC	3	9	564288	564296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1258	NC_017326	GCG	2	6	565880	565885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1263	NC_017326	GCT	2	6	567288	567293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_017326	GATC	2	8	570386	570393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1267	NC_017326	GGC	2	6	570424	570429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1268	NC_017326	CT	3	6	570441	570446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1269	NC_017326	CAA	2	6	570447	570452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_017326	TC	3	6	570483	570488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1408	NC_017326	GCC	2	6	629634	629639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_017326	GTC	2	6	629887	629892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_017326	TCG	2	6	630526	630531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_017326	CGC	2	6	630534	630539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1412	NC_017326	TGC	2	6	631362	631367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1443	NC_017326	AAATC	2	10	657632	657641	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1451	NC_017326	CCG	2	6	664124	664129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1453	NC_017326	GGC	2	6	667865	667870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1471	NC_017326	GCCT	3	12	678107	678118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1472	NC_017326	CCG	2	6	678138	678143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1484	NC_017326	CGG	2	6	695357	695362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1485	NC_017326	CTC	2	6	695375	695380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1499	NC_017326	AT	3	6	701234	701239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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