MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 9936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017325	CATG	2	8	1584236	1584243	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_017325	CTT	2	6	1584315	1584320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_017325	GC	3	6	1584334	1584339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_017325	CCG	2	6	1586311	1586316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_017325	ATCCG	2	10	1588465	1588474	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4006	NC_017325	GC	3	6	1588550	1588555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_017325	ACT	2	6	1589189	1589194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017325	CGAT	2	8	1590489	1590496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_017325	CAG	2	6	1591401	1591406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017325	T	6	6	1591443	1591448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017325	CGC	3	9	1591483	1591491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_017325	GCG	2	6	1591563	1591568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_017325	TCGG	2	8	1591619	1591626	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_017325	GCC	2	6	1591646	1591651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_017325	CGCT	2	8	1591692	1591699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4016	NC_017325	CTG	2	6	1591863	1591868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017325	GCC	2	6	1591880	1591885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_017325	ACA	2	6	1591914	1591919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017325	CCTGA	2	10	1591981	1591990	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4020	NC_017325	GAT	2	6	1592098	1592103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017325	A	6	6	1592166	1592171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017325	CGA	2	6	1592185	1592190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017325	GA	3	6	1592201	1592206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017325	ACT	2	6	1598501	1598506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017325	GAT	2	6	1598514	1598519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017325	GCC	2	6	1598534	1598539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_017325	ATCGT	2	10	1598727	1598736	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4028	NC_017325	CATT	2	8	1598778	1598785	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_017325	GT	3	6	1598980	1598985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017325	CCGC	2	8	1598994	1599001	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4031	NC_017325	CGACC	2	10	1599048	1599057	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4032	NC_017325	AGG	2	6	1599499	1599504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017325	CCGC	2	8	1599530	1599537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4034	NC_017325	CTT	2	6	1599552	1599557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_017325	CGACC	2	10	1599586	1599595	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4036	NC_017325	GCT	2	6	1599617	1599622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_017325	TCA	2	6	1599697	1599702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_017325	CCG	2	6	1599719	1599724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_017325	GAA	2	6	1599784	1599789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017325	GCCG	2	8	1599844	1599851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_017325	TCG	2	6	1600217	1600222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017325	A	8	8	1600224	1600231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017325	AGG	2	6	1600261	1600266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_017325	GAGG	2	8	1600284	1600291	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017325	TGC	2	6	1600329	1600334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017325	TGC	2	6	1600351	1600356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_017325	GAC	2	6	1600367	1600372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_017325	TCC	2	6	1600466	1600471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_017325	GCT	3	9	1600504	1600512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017325	TCT	2	6	1600561	1600566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017325	CG	3	6	1600637	1600642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_017325	GCG	3	9	1600640	1600648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017325	GCCT	2	8	1600656	1600663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_017325	TCA	2	6	1600668	1600673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017325	AG	3	6	1603268	1603273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017325	GCC	2	6	1603942	1603947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_017325	AG	3	6	1603959	1603964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017325	CGA	2	6	1603985	1603990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017325	ATG	2	6	1606587	1606592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017325	CAA	2	6	1606681	1606686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_017325	CGTC	2	8	1607308	1607315	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_017325	CCG	2	6	1607357	1607362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_017325	T	6	6	1607394	1607399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017325	CGG	2	6	1607404	1607409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_017325	CGC	2	6	1607457	1607462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_017325	TGA	2	6	1607545	1607550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017325	CCG	2	6	1607645	1607650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_017325	TTC	2	6	1607661	1607666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_017325	GTT	2	6	1608171	1608176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017325	T	6	6	1609201	1609206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017325	GAT	2	6	1609299	1609304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017325	GGC	2	6	1609332	1609337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017325	CGA	2	6	1609349	1609354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_017325	GCA	2	6	1609505	1609510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_017325	GCG	2	6	1612155	1612160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_017325	GCG	2	6	1612219	1612224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_017325	CCGC	2	8	1612245	1612252	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4078	NC_017325	GAGC	2	8	1612259	1612266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_017325	GGC	2	6	1612308	1612313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_017325	CCGA	2	8	1612333	1612340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_017325	CCG	2	6	1612390	1612395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_017325	GC	3	6	1612401	1612406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_017325	AT	3	6	1612412	1612417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017325	GCG	3	9	1612454	1612462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017325	TTGA	2	8	1613502	1613509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_017325	CG	3	6	1613601	1613606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_017325	GCC	2	6	1613619	1613624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_017325	TC	3	6	1614625	1614630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_017325	CCG	2	6	1614633	1614638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_017325	GCG	2	6	1614718	1614723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017325	TGA	2	6	1614796	1614801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017325	GCG	2	6	1614873	1614878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_017325	AAC	2	6	1616012	1616017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017325	CGT	2	6	1616045	1616050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_017325	T	6	6	1616064	1616069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017325	CGGC	2	8	1616126	1616133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_017325	TTGA	2	8	1616146	1616153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017325	ACGCG	2	10	1616154	1616163	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4099	NC_017325	GC	3	6	1618917	1618922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_017325	GCG	2	6	1618942	1618947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017325	CAGGG	2	10	1620731	1620740	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4102	NC_017325	GCA	2	6	1620761	1620766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_017325	ACG	2	6	1620780	1620785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_017325	GAC	2	6	1620796	1620801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017325	CCT	2	6	1623977	1623982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_017325	GCT	2	6	1624020	1624025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017325	CATC	2	8	1624639	1624646	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_017325	GC	3	6	1624668	1624673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_017325	GAA	2	6	1624730	1624735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017325	ACG	2	6	1625787	1625792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017325	CGC	2	6	1625805	1625810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_017325	CG	4	8	1627123	1627130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_017325	GGC	2	6	1627216	1627221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_017325	CTCAC	2	10	1627268	1627277	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4115	NC_017325	GCG	2	6	1627318	1627323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_017325	GTC	2	6	1627348	1627353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017325	GCC	2	6	1631131	1631136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4118	NC_017325	ATT	2	6	1631139	1631144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017325	CGG	2	6	1631164	1631169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_017325	AATC	2	8	1631230	1631237	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_017325	CGC	2	6	1632831	1632836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_017325	AGG	2	6	1632957	1632962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017325	CAA	2	6	1632987	1632992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017325	T	7	7	1633687	1633693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017325	GCC	2	6	1634747	1634752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_017325	CAC	2	6	1634808	1634813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_017325	CCA	2	6	1634819	1634824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_017325	TGCG	2	8	1636172	1636179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_017325	T	6	6	1636236	1636241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017325	CCGG	2	8	1636252	1636259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_017325	TGC	2	6	1636270	1636275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4163	NC_017325	GGTCG	2	10	1644649	1644658	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4242	NC_017325	GGA	2	6	1665659	1665664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_017325	GAT	2	6	1670900	1670905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4245	NC_017325	GATC	2	8	1672871	1672878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4246	NC_017325	GCA	3	9	1672889	1672897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4251	NC_017325	GT	3	6	1674463	1674468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_017325	CAG	2	6	1675923	1675928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4255	NC_017325	CGGC	2	8	1679612	1679619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4256	NC_017325	TTC	2	6	1680952	1680957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_017325	TTGC	2	8	1680972	1680979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4258	NC_017325	GGC	2	6	1681015	1681020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_017325	GC	3	6	1681019	1681024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4261	NC_017325	TTC	2	6	1682197	1682202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_017325	TCG	2	6	1682211	1682216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4388	NC_017325	TCCAA	2	10	1718037	1718046	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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