MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01

Total Repeats: 1005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017324	CCCA	2	8	1953	1960	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017324	CATG	2	8	4680	4687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017324	GCAT	2	8	6881	6888	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017324	ACCG	2	8	7373	7380	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017324	ATGC	2	8	7543	7550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017324	CAAG	2	8	11813	11820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017324	CCTT	2	8	11849	11856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017324	TGCC	2	8	13977	13984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017324	GCCG	2	8	14102	14109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017324	GCTT	2	8	26206	26213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017324	GCCT	2	8	26566	26573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017324	CAAT	2	8	27260	27267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017324	TTTG	2	8	27280	27287	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017324	GATC	2	8	34457	34464	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017324	GGCG	2	8	35199	35206	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017324	TCCC	2	8	36917	36924	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_017324	ACAA	2	8	46841	46848	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017324	CGCC	2	8	48642	48649	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017324	GATG	2	8	55479	55486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017324	ATGA	2	8	57675	57682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017324	AAGC	2	8	61224	61231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017324	CGAT	2	8	61694	61701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017324	TGCG	2	8	62362	62369	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017324	GTTC	2	8	62612	62619	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017324	GCGG	2	8	63173	63180	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017324	GATG	2	8	63320	63327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017324	TTCA	2	8	66855	66862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017324	AGCG	2	8	67018	67025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017324	ATCC	2	8	67341	67348	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017324	TAAA	2	8	67635	67642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017324	TATT	2	8	67706	67713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017324	GCAC	2	8	68807	68814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017324	GTGA	2	8	70467	70474	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017324	GAGC	2	8	74675	74682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017324	GCCG	2	8	76540	76547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017324	CCGG	2	8	76675	76682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017324	TGCC	2	8	76753	76760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017324	CGGA	2	8	77369	77376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017324	AAGC	2	8	77784	77791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017324	CGCC	2	8	77797	77804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_017324	ATCG	2	8	77940	77947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017324	CCGG	2	8	80242	80249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017324	AGGC	2	8	80662	80669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017324	AAGG	2	8	81384	81391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017324	TTGG	2	8	82682	82689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017324	CGAC	2	8	90262	90269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017324	CTTC	2	8	90322	90329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017324	GTGC	2	8	90535	90542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017324	CGCA	2	8	91026	91033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017324	ACCA	2	8	91131	91138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017324	CCGT	2	8	91273	91280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017324	TCGA	2	8	91305	91312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017324	ATTG	2	8	91773	91780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017324	GCCG	2	8	94014	94021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017324	GCCG	2	8	94164	94171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017324	AGTT	2	8	99925	99932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017324	GCAG	2	8	100246	100253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017324	GCGA	2	8	100267	100274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017324	TGTT	2	8	100569	100576	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017324	ATCG	2	8	100588	100595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017324	TCGA	2	8	109260	109267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017324	GGAT	2	8	109457	109464	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017324	CTCG	2	8	111316	111323	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017324	CCCT	2	8	112641	112648	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_017324	CCGG	2	8	118284	118291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017324	TGAA	2	8	118419	118426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017324	GCTC	2	8	120370	120377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017324	AATC	2	8	122150	122157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017324	ATCG	2	8	124209	124216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017324	CAGT	2	8	124499	124506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017324	GGCC	2	8	125246	125253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017324	CATC	2	8	126556	126563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017324	CGGC	2	8	126803	126810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017324	CGAG	2	8	128413	128420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017324	AATT	2	8	128503	128510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017324	GTGC	2	8	132743	132750	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017324	TGGC	2	8	133109	133116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017324	CACT	2	8	134146	134153	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017324	GGAT	2	8	134641	134648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017324	GCCG	2	8	135097	135104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017324	CGAA	2	8	135277	135284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017324	CAAT	2	8	135559	135566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017324	GCTT	2	8	135631	135638	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017324	GCCC	2	8	136783	136790	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_017324	CTTC	2	8	136924	136931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017324	CATC	2	8	137226	137233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017324	CCCG	2	8	137236	137243	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_017324	GCCT	2	8	137257	137264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017324	GGGA	2	8	137762	137769	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017324	ATTG	2	8	137936	137943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017324	CGGT	2	8	139949	139956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017324	GTCA	2	8	140204	140211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017324	TGCC	2	8	140227	140234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017324	GTTT	2	8	141753	141760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017324	CTCA	2	8	141763	141770	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017324	AATC	2	8	145874	145881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017324	AAGG	2	8	146178	146185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017324	ATGC	2	8	147212	147219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017324	TTTC	2	8	147768	147775	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017324	TGAC	2	8	148028	148035	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017324	CAGC	2	8	148363	148370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017324	ATCC	2	8	148537	148544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017324	GTTC	2	8	148985	148992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017324	CGAA	2	8	151259	151266	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017324	TTGC	2	8	152174	152181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017324	CAAC	2	8	152435	152442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017324	GTCG	3	12	152967	152978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017324	ACCA	2	8	153026	153033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017324	GCCC	2	8	153373	153380	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_017324	CACT	2	8	153397	153404	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017324	CCAG	2	8	153919	153926	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017324	TGGT	2	8	156884	156891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017324	CCTG	2	8	157106	157113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017324	ATGG	2	8	157722	157729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017324	CGGA	2	8	157989	157996	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017324	TTGG	2	8	158524	158531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017324	CCGG	2	8	161403	161410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017324	CCAA	2	8	161734	161741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017324	GGAA	2	8	161751	161758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017324	CTGG	2	8	162165	162172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017324	GGCC	2	8	162584	162591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017324	AAAC	2	8	163178	163185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017324	GGGC	2	8	164748	164755	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017324	GGGC	2	8	167386	167393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017324	CTGA	2	8	167405	167412	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017324	GGTC	2	8	167610	167617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017324	AGCG	2	8	167858	167865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017324	CGGA	2	8	168329	168336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017324	CGCC	2	8	168583	168590	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_017324	CGAC	2	8	170765	170772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017324	GCCT	2	8	171121	171128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017324	GCTG	2	8	171188	171195	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017324	GTGG	2	8	171267	171274	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017324	GCAT	2	8	172382	172389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017324	TCCT	2	8	172530	172537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017324	GTAT	2	8	172574	172581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017324	CCCA	2	8	172649	172656	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_017324	CTCG	2	8	172785	172792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017324	AGGA	2	8	173150	173157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017324	GCGA	2	8	174426	174433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017324	CGGA	2	8	177719	177726	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017324	CGAA	2	8	178062	178069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017324	ACCG	2	8	178320	178327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017324	CCGC	2	8	178445	178452	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
145	NC_017324	TCCC	2	8	179359	179366	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_017324	TAAT	2	8	179485	179492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017324	GAAG	2	8	187160	187167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017324	CTGA	2	8	187434	187441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017324	TGGC	2	8	188462	188469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017324	AAGA	2	8	190028	190035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017324	ACGA	2	8	190045	190052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017324	CGAG	2	8	190211	190218	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017324	GCAA	2	8	190772	190779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_017324	CTAC	2	8	190819	190826	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_017324	TTTC	2	8	191447	191454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_017324	GCCG	2	8	191872	191879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_017324	CACC	2	8	192089	192096	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
158	NC_017324	AGGC	2	8	192437	192444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_017324	GTTC	2	8	193658	193665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_017324	ATCC	2	8	196438	196445	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_017324	CGGG	2	8	196591	196598	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
164	NC_017324	TTTG	2	8	197059	197066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_017324	GAGC	2	8	197585	197592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_017324	TGGG	2	8	197672	197679	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017324	ACCG	2	8	197731	197738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
169	NC_017324	GGTA	2	8	203424	203431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_017324	GCCC	2	8	216175	216182	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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175	NC_017324	TTTC	2	8	219401	219408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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182	NC_017324	CGAA	2	8	232199	232206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_017324	GCCG	2	8	232701	232708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_017324	GCAA	2	8	236182	236189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_017324	GCCC	2	8	244443	244450	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
193	NC_017324	CGTC	2	8	244562	244569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_017324	TCGG	2	8	246300	246307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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231	NC_017324	ATCG	2	8	342287	342294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
232	NC_017324	CGCA	2	8	342313	342320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
233	NC_017324	CCTG	2	8	342482	342489	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
234	NC_017324	GTCA	2	8	344536	344543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
235	NC_017324	TCCT	2	8	345967	345974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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297	NC_017324	GGCG	2	8	472712	472719	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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