MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017319	A	6	6	1022	1027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017319	T	7	7	1076	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017319	A	6	6	2168	2173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017319	A	6	6	2179	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017319	T	6	6	2253	2258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017319	T	6	6	2301	2306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017319	T	6	6	2320	2325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017319	A	6	6	12592	12597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017319	T	6	6	12700	12705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017319	A	6	6	17759	17764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017319	T	7	7	18813	18819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017319	T	9	9	18868	18876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017319	A	6	6	19737	19742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017319	T	6	6	20526	20531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017319	A	6	6	22472	22477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017319	A	6	6	22538	22543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017319	T	6	6	24291	24296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017319	T	7	7	24343	24349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017319	G	6	6	24560	24565	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017319	A	6	6	24870	24875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017319	T	8	8	26910	26917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017319	T	8	8	29208	29215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017319	T	6	6	34881	34886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017319	A	6	6	35193	35198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017319	T	6	6	37372	37377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017319	A	6	6	38154	38159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017319	T	7	7	38166	38172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017319	A	6	6	38204	38209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017319	G	6	6	39629	39634	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017319	C	6	6	40997	41002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_017319	A	6	6	47322	47327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017319	A	6	6	49477	49482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017319	T	6	6	56928	56933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017319	A	8	8	56979	56986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017319	T	7	7	56999	57005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017319	G	6	6	57028	57033	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017319	T	6	6	58356	58361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017319	A	6	6	58668	58673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017319	T	7	7	61892	61898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017319	A	7	7	62042	62048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017319	T	6	6	64032	64037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017319	T	7	7	64264	64270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017319	G	6	6	67571	67576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017319	T	6	6	67676	67681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017319	A	7	7	68212	68218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017319	T	6	6	69725	69730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017319	T	6	6	73325	73330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017319	A	6	6	73637	73642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017319	A	6	6	76788	76793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017319	T	6	6	78865	78870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017319	A	7	7	78935	78941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017319	T	6	6	79018	79023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017319	T	6	6	79056	79061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017319	T	7	7	79106	79112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017319	A	6	6	80925	80930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017319	C	7	7	82788	82794	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_017319	G	6	6	82876	82881	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017319	T	6	6	84812	84817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017319	C	6	6	89588	89593	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_017319	G	11	11	93947	93957	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017319	C	6	6	97686	97691	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_017319	G	6	6	98953	98958	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017319	C	6	6	100321	100326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_017319	C	6	6	101546	101551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_017319	A	6	6	102409	102414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017319	T	6	6	103516	103521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017319	G	6	6	103552	103557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017319	T	6	6	104047	104052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017319	T	6	6	104084	104089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017319	A	8	8	104104	104111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017319	A	6	6	105582	105587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017319	T	6	6	114960	114965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017319	A	10	10	129249	129258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017319	T	6	6	137569	137574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017319	A	6	6	137881	137886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017319	C	6	6	139370	139375	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_017319	A	6	6	140275	140280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017319	A	6	6	143187	143192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017319	T	6	6	143295	143300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017319	T	6	6	146074	146079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017319	T	7	7	146540	146546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017319	T	7	7	148133	148139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017319	T	7	7	152113	152119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017319	T	6	6	160029	160034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017319	T	6	6	160065	160070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017319	T	6	6	161547	161552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017319	T	6	6	171062	171067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017319	A	6	6	176694	176699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017319	A	6	6	176734	176739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017319	A	7	7	180336	180342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017319	A	6	6	180352	180357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017319	T	7	7	181248	181254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017319	A	6	6	181285	181290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017319	C	6	6	191169	191174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
95	NC_017319	T	7	7	191362	191368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017319	A	6	6	205687	205692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017319	T	6	6	205819	205824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017319	A	6	6	208724	208729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017319	A	6	6	210257	210262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017319	A	6	6	210277	210282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017319	C	6	6	210316	210321	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_017319	A	6	6	210624	210629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017319	C	6	6	210662	210667	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_017319	A	7	7	211152	211158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017319	T	6	6	211260	211265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017319	A	6	6	211577	211582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017319	T	7	7	215066	215072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017319	T	8	8	215110	215117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017319	A	6	6	215444	215449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017319	T	7	7	215454	215460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017319	A	6	6	216038	216043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017319	A	6	6	221243	221248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017319	T	7	7	221890	221896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017319	A	6	6	223183	223188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.