MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017319	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017319	AT	3	6	1156	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017319	AT	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017319	AT	3	6	4963	4968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017319	TG	3	6	4989	4994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017319	TA	4	8	5113	5120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017319	AG	3	6	5258	5263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017319	AT	3	6	10319	10324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017319	GC	3	6	10962	10967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017319	AT	5	10	11933	11942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017319	CT	3	6	12423	12428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017319	AT	3	6	18739	18744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017319	TC	3	6	19613	19618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017319	TG	3	6	19626	19631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017319	CT	3	6	20536	20541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017319	AG	3	6	20547	20552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017319	AT	3	6	21340	21345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017319	GA	3	6	21648	21653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017319	AT	3	6	24378	24383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017319	CA	3	6	24667	24672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017319	GT	3	6	26334	26339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017319	GC	3	6	26848	26853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017319	GA	3	6	30096	30101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017319	AG	3	6	37828	37833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017319	AT	3	6	38552	38557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017319	AT	3	6	39442	39447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017319	AT	3	6	39514	39519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017319	AT	3	6	39569	39574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017319	AT	3	6	47722	47727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017319	AT	4	8	49380	49387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017319	AG	4	8	58705	58712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017319	GT	3	6	61388	61393	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017319	GA	3	6	67849	67854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017319	TA	3	6	68258	68263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017319	AT	3	6	69966	69971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017319	TC	4	8	73285	73292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017319	TA	3	6	76931	76936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017319	AT	3	6	77201	77206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017319	TA	4	8	78750	78757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017319	AT	3	6	79081	79086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017319	GA	3	6	79580	79585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017319	TG	3	6	86851	86856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017319	AT	3	6	89474	89479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017319	TC	3	6	90424	90429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017319	CT	3	6	93480	93485	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017319	CT	3	6	101890	101895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017319	AT	3	6	102179	102184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017319	TG	3	6	103610	103615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017319	TG	3	6	103666	103671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017319	AT	3	6	104032	104037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017319	AT	3	6	108774	108779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017319	TA	3	6	114765	114770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017319	AT	3	6	114771	114776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017319	AG	3	6	114934	114939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017319	CA	3	6	129233	129238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017319	AG	3	6	134515	134520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017319	TA	3	6	134551	134556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017319	AG	4	8	137918	137925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017319	TA	3	6	139501	139506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017319	AG	3	6	140558	140563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017319	CA	3	6	144934	144939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017319	AT	4	8	147813	147820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017319	AT	3	6	148177	148182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017319	AT	3	6	148231	148236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017319	GA	3	6	155891	155896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017319	AC	3	6	157670	157675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017319	TC	3	6	159938	159943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017319	CA	3	6	159953	159958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017319	GT	3	6	161737	161742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017319	GA	3	6	164098	164103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017319	TA	3	6	165652	165657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017319	GT	3	6	170904	170909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017319	TA	3	6	170980	170985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017319	TA	4	8	171113	171120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017319	AT	3	6	176453	176458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017319	TC	3	6	177123	177128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017319	AT	3	6	180424	180429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017319	TA	3	6	183194	183199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017319	TA	3	6	183205	183210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017319	GT	3	6	195604	195609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017319	AG	4	8	205356	205363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017319	TC	3	6	214950	214955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017319	AT	3	6	214991	214996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017319	AT	3	6	215105	215110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017319	CA	3	6	215752	215757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017319	GA	3	6	221768	221773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.