MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus REY15A chromosome

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017276	TACAAA	2	12	5587	5598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017276	TGGTAT	2	12	17652	17663	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017276	CTTTTC	2	12	32570	32581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017276	TATTTA	2	12	38098	38109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017276	TCTAGT	2	12	47968	47979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017276	AATAAA	2	12	71884	71895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017276	AGTTAA	2	12	90646	90657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017276	GTATGA	2	12	116149	116160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017276	AAAATA	2	12	129999	130010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017276	AATATT	2	12	174490	174501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017276	GTAAGC	2	12	227583	227594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017276	TTACAT	2	12	229758	229769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017276	CATCCC	2	12	309148	309159	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017276	CTCATA	2	12	309411	309422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017276	CTCATT	2	12	313158	313169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017276	AAAAGA	2	12	327604	327615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017276	TAGAAG	2	12	341949	341960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017276	ATATTT	2	12	359316	359327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017276	TTTATA	2	12	362369	362380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017276	ACTTAT	2	12	367678	367689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017276	CCTCTT	2	12	376290	376301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017276	TTCAAT	2	12	400584	400595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017276	AATACT	2	12	414938	414949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017276	ATGAAA	2	12	417061	417072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017276	AATGAC	2	12	417343	417354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017276	TTTATC	2	12	420737	420748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017276	AAAATT	2	12	428709	428720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017276	TTTACC	2	12	442037	442048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017276	CTCATA	2	12	490193	490204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017276	AAATTT	2	12	497434	497445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017276	GGAAGT	2	12	515953	515964	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017276	TAGTGA	2	12	542105	542116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017276	CCTCTT	2	12	554085	554096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017276	AGCTAA	2	12	575164	575175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017276	ATATTA	2	12	587175	587186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017276	ATTTTC	2	12	588016	588027	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017276	GATGTA	2	12	620907	620918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017276	ATGTTT	2	12	670680	670691	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017276	TTATAT	2	12	671105	671116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017276	TTCCAA	2	12	694775	694786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017276	GAAAGT	2	12	704633	704644	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017276	CCCTTA	2	12	714135	714146	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017276	AAAATT	2	12	714151	714162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017276	AAAATA	2	12	722277	722288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017276	ATCTTC	2	12	727965	727976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017276	GCATAG	2	12	728021	728032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017276	TTTATG	2	12	730019	730030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017276	ATTCCT	2	12	742511	742522	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017276	CAGCTG	2	12	742524	742535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017276	GGAAAA	2	12	754053	754064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017276	TTTATA	2	12	771381	771392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017276	ATAAGT	2	12	776573	776584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017276	ATATTA	2	12	788061	788072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017276	GTATGA	2	12	816050	816061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017276	AATTGA	2	12	816229	816240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017276	ACTTAT	2	12	821566	821577	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017276	TATTTA	2	12	822566	822577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017276	ATCAAC	2	12	832436	832447	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017276	AAAATT	2	12	837555	837566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017276	ATAGAT	2	12	838035	838046	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017276	CTATAT	2	12	842422	842433	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017276	ATAAGT	2	12	863314	863325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017276	AATTTT	2	12	864955	864966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017276	AGAACC	2	12	867154	867165	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017276	CTATGG	2	12	867350	867361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017276	AAGAGG	2	12	869077	869088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017276	TAGATT	2	12	869488	869499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017276	AATACA	2	12	872547	872558	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017276	ACTTAT	2	12	879821	879832	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017276	AAGAGG	2	12	883327	883338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017276	TAATAC	2	12	906718	906729	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017276	TTACAA	2	12	911372	911383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017276	AAAACA	2	12	936659	936670	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017276	AAAGTA	2	12	1009377	1009388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017276	TAAAGA	2	12	1062553	1062564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017276	ACTCTT	2	12	1073097	1073108	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017276	TCATAA	2	12	1261592	1261603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017276	GGGGAT	2	12	1271649	1271660	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017276	CTCATA	2	12	1283069	1283080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017276	TTCTAT	2	12	1304635	1304646	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017276	ACTTTA	2	12	1373374	1373385	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017276	ATAAGT	2	12	1380597	1380608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017276	TTACCT	2	12	1384500	1384511	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017276	AAGAGA	2	12	1389078	1389089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017276	TCTAAG	2	12	1389395	1389406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017276	AATTTT	2	12	1407399	1407410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017276	TACAAA	2	12	1413215	1413226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017276	TAAAAA	2	12	1438348	1438359	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017276	TAAAAA	2	12	1545415	1545426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017276	TATAAA	2	12	1643130	1643141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017276	CCTCTT	2	12	1663528	1663539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017276	AATATA	2	12	1762721	1762732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017276	ATTTAT	2	12	1762736	1762747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017276	ACTATC	2	12	1786586	1786597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017276	AATTGG	2	12	1853084	1853095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017276	GATAAA	2	12	1894277	1894288	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017276	TTAGCT	2	12	1894358	1894369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017276	ATATTA	2	12	1910324	1910335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017276	ATAAGT	2	12	1915272	1915283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017276	TAACAT	2	12	1934649	1934660	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017276	TTAATT	2	12	1951320	1951331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017276	TCCTTT	2	12	1984984	1984995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017276	CCTTCC	2	12	1988759	1988770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017276	TTTATG	2	12	2015252	2015263	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017276	ATCTTC	2	12	2050069	2050080	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017276	TAAATA	2	12	2050954	2050965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017276	CTAGGG	2	12	2056071	2056082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017276	TACAAA	2	12	2056778	2056789	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017276	AATTTT	2	12	2057654	2057665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017276	TATTTT	2	12	2065939	2065950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017276	GTATGA	2	12	2089990	2090001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017276	TTCCTT	2	12	2110959	2110970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017276	ATCATA	2	12	2117597	2117608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017276	TTATTT	2	12	2121496	2121507	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017276	AAAAAG	2	12	2134135	2134146	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017276	ATAAGT	2	12	2144145	2144156	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017276	TAATTA	2	12	2153263	2153274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017276	TTCTTT	2	12	2245179	2245190	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017276	CATGTT	2	12	2249960	2249971	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017276	GTAAAC	2	12	2272341	2272352	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017276	TTATAT	2	12	2272543	2272554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017276	ATTAAA	2	12	2280516	2280527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017276	TAAACT	2	12	2284985	2284996	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017276	CTTTTT	2	12	2294687	2294698	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017276	TTTTTA	2	12	2311304	2311315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017276	ATAAAA	2	12	2329208	2329219	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017276	TAATAT	2	12	2331413	2331424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017276	TAAAAA	2	12	2361009	2361020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017276	GTATGA	2	12	2361273	2361284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017276	AATATT	2	12	2363273	2363284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017276	ATATTT	2	12	2385764	2385775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017276	TATATG	2	12	2396847	2396858	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017276	GCAGAT	2	12	2452801	2452812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017276	TAAATT	2	12	2455860	2455871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017276	TCTTTT	2	12	2456652	2456663	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017276	TAAACA	2	12	2469150	2469161	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017276	AAAAAT	2	12	2478749	2478760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017276	TATTTA	2	12	2486527	2486538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017276	ATAAGT	2	12	2487935	2487946	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.