MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus REY15A chromosome

Total Repeats: 8467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017276	TAT	2	6	862294	862299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_017276	AAGA	2	8	862569	862576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017276	GAAA	2	8	862631	862638	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017276	A	6	6	862636	862641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017276	AGA	2	6	862655	862660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017276	AAG	2	6	862684	862689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017276	ACT	2	6	862721	862726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017276	ACA	2	6	862727	862732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_017276	CTA	2	6	862807	862812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_017276	CAAG	2	8	862818	862825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_017276	A	8	8	862848	862855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017276	AAG	2	6	862858	862863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017276	GAA	2	6	862867	862872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017276	CT	3	6	862877	862882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_017276	GTA	2	6	862942	862947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017276	TTC	2	6	862976	862981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017276	AGT	2	6	863021	863026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017276	AGG	2	6	863040	863045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017276	CTT	2	6	863069	863074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_017276	ATT	2	6	863122	863127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017276	CTC	2	6	863128	863133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_017276	CTC	2	6	863185	863190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_017276	TAA	2	6	863252	863257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017276	AGA	2	6	863273	863278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017276	ATAAGT	2	12	863314	863325	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017276	TA	3	6	863435	863440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017276	ATT	2	6	863445	863450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017276	TAA	2	6	863451	863456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017276	GAC	2	6	863471	863476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4031	NC_017276	CTTA	2	8	863516	863523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_017276	A	6	6	863543	863548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017276	TTA	2	6	863588	863593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017276	TAA	2	6	863627	863632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017276	ATA	2	6	863633	863638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017276	A	6	6	864264	864269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017276	ATA	2	6	864283	864288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017276	GAA	2	6	864339	864344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017276	CAA	2	6	864423	864428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017276	AATTTT	2	12	864955	864966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017276	GTA	2	6	865007	865012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017276	TCA	2	6	865990	865995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017276	CATG	2	8	866012	866019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_017276	AAAT	2	8	866022	866029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017276	CTT	2	6	866030	866035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017276	ATA	2	6	866093	866098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017276	TA	3	6	866119	866124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017276	TTCA	2	8	866125	866132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_017276	TAAT	2	8	866211	866218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017276	AAT	2	6	866244	866249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017276	TTA	2	6	866280	866285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017276	A	7	7	866288	866294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017276	AT	3	6	866296	866301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017276	TACTT	2	10	867043	867052	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4055	NC_017276	AGGG	2	8	867136	867143	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017276	AGAACC	2	12	867154	867165	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017276	AAT	2	6	867167	867172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017276	TA	3	6	867260	867265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017276	AAT	2	6	867304	867309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017276	CTATGG	2	12	867350	867361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4062	NC_017276	TAA	2	6	867911	867916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017276	GTT	2	6	867965	867970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017276	TAT	2	6	867998	868003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017276	GTT	2	6	868068	868073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017276	TTGA	2	8	868138	868145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017276	GA	3	6	868284	868289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_017276	ATCA	2	8	868309	868316	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_017276	GA	3	6	868375	868380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017276	GTA	2	6	868418	868423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4073	NC_017276	ACT	2	6	868487	868492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4077	NC_017276	GCTGA	2	10	868879	868888	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4078	NC_017276	TTA	2	6	868904	868909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017276	GTT	2	6	868917	868922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4081	NC_017276	GAG	2	6	868984	868989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017276	AAGAGG	2	12	869077	869088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4084	NC_017276	TGG	2	6	869117	869122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017276	GGA	2	6	869169	869174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_017276	ATA	2	6	869263	869268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017276	ATTA	2	8	869274	869281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017276	TA	3	6	869289	869294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017276	TTCA	2	8	869295	869302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4097	NC_017276	CATAC	2	10	869470	869479	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4098	NC_017276	TAGATT	2	12	869488	869499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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4100	NC_017276	ATA	2	6	869586	869591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017276	ATT	2	6	869618	869623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017276	GAA	2	6	869665	869670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017276	CAAA	2	8	869681	869688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_017276	GAA	2	6	869693	869698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4107	NC_017276	TTTTA	2	10	872445	872454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017276	TAT	2	6	872491	872496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017276	ATT	2	6	872512	872517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_017276	AGT	2	6	873996	874001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017276	T	6	6	874004	874009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017276	AT	3	6	874024	874029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017276	ATT	2	6	874076	874081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017276	TTA	3	9	874116	874124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017276	TA	3	6	874155	874160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017276	A	6	6	874172	874177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017276	TAA	2	6	874234	874239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017276	TAA	2	6	874249	874254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017276	TCT	2	6	874439	874444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_017276	CAA	2	6	874457	874462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017276	A	6	6	874554	874559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017276	AAT	2	6	874623	874628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017276	TA	3	6	874632	874637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017276	TGA	2	6	874659	874664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017276	TGA	2	6	874675	874680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017276	TAC	2	6	874685	874690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_017276	CTAG	2	8	874862	874869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_017276	ACT	2	6	875189	875194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_017276	A	6	6	875260	875265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017276	CCT	2	6	875357	875362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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