MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus REY15A chromosome

Total Repeats: 8467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017276	AAGA	2	8	2352684	2352691	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_017276	GAG	2	6	2352987	2352992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_017276	CCG	2	6	2353006	2353011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8004	NC_017276	TTA	2	6	2353062	2353067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_017276	AAT	2	6	2353843	2353848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017276	ATA	2	6	2354699	2354704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017276	AT	3	6	2354706	2354711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017276	TATTT	2	10	2355147	2355156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017276	T	6	6	2355160	2355165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_017276	TTA	2	6	2358720	2358725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_017276	TAAAAA	2	12	2361009	2361020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_017276	GTC	2	6	2361049	2361054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_017276	TCA	2	6	2361144	2361149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_017276	TGT	2	6	2361150	2361155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017276	GT	3	6	2361176	2361181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_017276	CTT	2	6	2361199	2361204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_017276	CAT	3	9	2361221	2361229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_017276	AAG	2	6	2361233	2361238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017276	GAGG	2	8	2361241	2361248	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_017276	GTATGA	2	12	2361273	2361284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_017276	TGG	2	6	2361346	2361351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017276	AGTTG	2	10	2361357	2361366	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017276	GTG	2	6	2361395	2361400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017276	TTG	2	6	2361401	2361406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017276	GTT	2	6	2361412	2361417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017276	ACTT	2	8	2361430	2361437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8027	NC_017276	GAT	2	6	2361592	2361597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017276	AG	3	6	2361698	2361703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_017276	ATG	2	6	2361736	2361741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017276	GA	3	6	2361766	2361771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017276	GAC	2	6	2361800	2361805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_017276	AC	3	6	2361813	2361818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_017276	CA	3	6	2361880	2361885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_017276	ATT	2	6	2361933	2361938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_017276	CTAA	2	8	2362182	2362189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8036	NC_017276	AT	3	6	2362229	2362234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017276	TAA	2	6	2362235	2362240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017276	ATC	2	6	2362257	2362262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_017276	TAATA	2	10	2362313	2362322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_017276	TAA	2	6	2362324	2362329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017276	TAA	2	6	2363093	2363098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_017276	TAA	2	6	2363128	2363133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_017276	AT	3	6	2363154	2363159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_017276	TAA	2	6	2363179	2363184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_017276	AAG	2	6	2363217	2363222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_017276	AGA	2	6	2363227	2363232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_017276	AATATT	2	12	2363273	2363284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_017276	TAAG	2	8	2363294	2363301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017276	TAC	2	6	2363328	2363333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_017276	AAT	2	6	2363348	2363353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017276	TA	5	10	2363377	2363386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_017276	AAT	2	6	2363406	2363411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_017276	TAAA	2	8	2363466	2363473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_017276	TTATA	2	10	2363474	2363483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_017276	ATA	2	6	2363532	2363537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_017276	TAA	2	6	2363551	2363556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_017276	ATT	2	6	2363576	2363581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_017276	TAAC	2	8	2363605	2363612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_017276	TCT	2	6	2363723	2363728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_017276	AT	4	8	2365228	2365235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_017276	ATTTA	2	10	2365246	2365255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_017276	TCT	2	6	2365256	2365261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_017276	TAT	2	6	2365287	2365292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017276	AAC	2	6	2365312	2365317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_017276	CT	3	6	2365372	2365377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8066	NC_017276	TAAC	2	8	2365430	2365437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8067	NC_017276	AAAT	2	8	2365457	2365464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_017276	TAA	2	6	2365536	2365541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_017276	AAT	2	6	2365552	2365557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_017276	ATATA	2	10	2365564	2365573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_017276	AGC	2	6	2365613	2365618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_017276	TAT	2	6	2365649	2365654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_017276	AGA	2	6	2365662	2365667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_017276	A	6	6	2365678	2365683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017276	AGT	2	6	2366543	2366548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_017276	ATG	2	6	2366558	2366563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017276	TGGG	2	8	2366573	2366580	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_017276	TTA	2	6	2366624	2366629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017276	TTC	2	6	2366643	2366648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_017276	AT	3	6	2366674	2366679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_017276	TA	3	6	2366741	2366746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_017276	TTG	2	6	2366762	2366767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_017276	CCT	2	6	2367368	2367373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_017276	GTA	2	6	2367377	2367382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_017276	ATA	2	6	2367562	2367567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_017276	TAT	2	6	2367592	2367597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_017276	TAA	2	6	2367612	2367617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_017276	AAT	2	6	2367633	2367638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_017276	TTG	2	6	2367658	2367663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_017276	AAT	3	9	2372458	2372466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_017276	ATG	2	6	2372478	2372483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_017276	AAT	2	6	2372503	2372508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_017276	TA	3	6	2375529	2375534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_017276	TCT	2	6	2375561	2375566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_017276	A	6	6	2376487	2376492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_017276	T	6	6	2376502	2376507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017276	ATT	2	6	2378606	2378611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017276	TTA	2	6	2378675	2378680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017276	TAA	3	9	2378685	2378693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_017276	AT	3	6	2380823	2380828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_017276	T	6	6	2380858	2380863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017276	AAT	2	6	2382829	2382834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017276	AATA	2	8	2382845	2382852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017276	TA	3	6	2382878	2382883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017276	ATT	2	6	2382891	2382896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_017276	AT	3	6	2382907	2382912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_017276	AT	3	6	2382915	2382920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_017276	TA	3	6	2382931	2382936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017276	TAA	2	6	2383039	2383044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017276	CAAA	2	8	2383055	2383062	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8111	NC_017276	ATT	2	6	2383070	2383075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_017276	TTAC	2	8	2385544	2385551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8113	NC_017276	A	6	6	2385578	2385583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017276	TTTTA	2	10	2385584	2385593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_017276	TTTA	2	8	2385618	2385625	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_017276	TAT	2	6	2385678	2385683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_017276	TAAA	2	8	2385698	2385705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_017276	ATATTT	2	12	2385764	2385775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017276	TAT	2	6	2385789	2385794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017276	ATA	2	6	2385816	2385821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_017276	TTAAC	2	10	2385883	2385892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8122	NC_017276	TTA	2	6	2385909	2385914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017276	A	6	6	2385961	2385966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_017276	GTGA	2	8	2389687	2389694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017276	T	7	7	2390028	2390034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_017276	ATT	2	6	2390037	2390042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017276	T	6	6	2390041	2390046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017276	AT	3	6	2390071	2390076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017276	TAG	2	6	2390097	2390102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017276	TA	3	6	2390127	2390132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_017276	TA	4	8	2390194	2390201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.