MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 10987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017274	TCA	2	6	1247580	1247585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017274	TA	3	6	1247613	1247618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017274	CCT	2	6	1247678	1247683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_017274	AATT	2	8	1247690	1247697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017274	TAA	2	6	1247708	1247713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_017274	AG	3	6	1247720	1247725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017274	CT	3	6	1247739	1247744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_017274	GTT	2	6	1247847	1247852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017274	TCTT	2	8	1249039	1249046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_017274	AATT	2	8	1249048	1249055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017274	TAT	2	6	1249081	1249086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017274	ATT	2	6	1249116	1249121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_017274	T	6	6	1249120	1249125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017274	TCT	2	6	1249225	1249230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_017274	AAGG	2	8	1249277	1249284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_017274	ATT	2	6	1250824	1250829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017274	TAT	2	6	1250878	1250883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017274	TAAT	2	8	1250933	1250940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017274	ATA	2	6	1250987	1250992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017274	CTA	2	6	1250993	1250998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_017274	TTTA	2	8	1251008	1251015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017274	TCA	2	6	1251191	1251196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_017274	ATAA	2	8	1251218	1251225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_017274	TAC	2	6	1251274	1251279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_017274	TCCC	2	8	1251288	1251295	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4026	NC_017274	TAA	2	6	1251366	1251371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017274	ACA	2	6	1251420	1251425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_017274	TAA	2	6	1251441	1251446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017274	TCA	2	6	1251533	1251538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_017274	CTC	2	6	1251604	1251609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_017274	TAT	2	6	1251653	1251658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017274	CAA	2	6	1251698	1251703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_017274	GTTA	2	8	1251763	1251770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017274	TAA	2	6	1251790	1251795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_017274	TACA	2	8	1251829	1251836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_017274	CT	3	6	1251901	1251906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_017274	AAAT	2	8	1252068	1252075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017274	GTG	2	6	1252406	1252411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_017274	ATA	3	9	1252412	1252420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_017274	GTA	2	6	1252433	1252438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017274	AAG	3	9	1252444	1252452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017274	T	7	7	1252487	1252493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017274	ATCT	2	8	1255359	1255366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_017274	ATA	2	6	1256364	1256369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017274	CTT	2	6	1256396	1256401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_017274	TACGAA	2	12	1257638	1257649	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4047	NC_017274	GTT	2	6	1257667	1257672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017274	AATT	2	8	1257725	1257732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017274	ATTT	2	8	1257749	1257756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017274	T	6	6	1257759	1257764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_017274	TAT	2	6	1257768	1257773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017274	ATA	2	6	1261380	1261385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017274	GTC	2	6	1261426	1261431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_017274	CGG	2	6	1261452	1261457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017274	CATA	2	8	1261461	1261468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_017274	ACT	2	6	1261474	1261479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017274	CTAA	2	8	1261491	1261498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_017274	ATA	2	6	1261519	1261524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017274	TCG	2	6	1261558	1261563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_017274	TGG	2	6	1261581	1261586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_017274	ATC	2	6	1261613	1261618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_017274	AGA	2	6	1261717	1261722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017274	TAA	2	6	1261723	1261728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017274	ATA	2	6	1261759	1261764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017274	TTTA	2	8	1263077	1263084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017274	CCGG	2	8	1263172	1263179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4067	NC_017274	CTGT	2	8	1263247	1263254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4068	NC_017274	CAA	2	6	1263279	1263284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_017274	TAT	2	6	1263310	1263315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017274	TTTA	2	8	1263319	1263326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017274	T	7	7	1267104	1267110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017274	AT	3	6	1267120	1267125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017274	ATT	2	6	1268333	1268338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_017274	T	8	8	1268340	1268347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_017274	CTTTTT	2	12	1268356	1268367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4076	NC_017274	TGA	2	6	1268416	1268421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017274	ATTTA	2	10	1268499	1268508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017274	AGC	3	9	1268531	1268539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_017274	A	7	7	1268548	1268554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017274	ATT	2	6	1268575	1268580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_017274	CGG	2	6	1268653	1268658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_017274	CATA	2	8	1268662	1268669	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_017274	TC	4	8	1270872	1270879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_017274	GTAT	2	8	1270890	1270897	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017274	ACTTT	2	10	1270911	1270920	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4086	NC_017274	AGT	2	6	1270923	1270928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_017274	GAA	2	6	1270942	1270947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017274	ATC	2	6	1270964	1270969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_017274	T	6	6	1270993	1270998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017274	ACTA	2	8	1271039	1271046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4091	NC_017274	ACGGG	2	10	1271080	1271089	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_017274	GAA	2	6	1271095	1271100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017274	GTT	2	6	1271204	1271209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017274	TTTAA	2	10	1271283	1271292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017274	TAA	2	6	1271456	1271461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017274	AAT	2	6	1276283	1276288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017274	TA	3	6	1276306	1276311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017274	A	6	6	1282474	1282479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_017274	ATTT	2	8	1282505	1282512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017274	ATT	2	6	1282523	1282528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_017274	TAG	2	6	1282565	1282570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017274	TA	3	6	1284620	1284625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017274	GTA	2	6	1287434	1287439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017274	TA	3	6	1288329	1288334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017274	CA	3	6	1288351	1288356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_017274	AGT	2	6	1289019	1289024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_017274	CTT	2	6	1291949	1291954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_017274	CTTAA	2	10	1291966	1291975	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4109	NC_017274	TAA	2	6	1300553	1300558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_017274	T	6	6	1301547	1301552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017274	TAAC	2	8	1301571	1301578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_017274	TAT	2	6	1301588	1301593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017274	TTTATT	2	12	1304018	1304029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017274	ATA	2	6	1304045	1304050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017274	TTATT	2	10	1305047	1305056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017274	TAC	2	6	1305060	1305065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_017274	TA	3	6	1305067	1305072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_017274	T	7	7	1308732	1308738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017274	TAG	2	6	1308837	1308842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017274	TGT	2	6	1308851	1308856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017274	AAT	2	6	1308857	1308862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017274	T	6	6	1308873	1308878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_017274	GTA	2	6	1308879	1308884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_017274	CT	3	6	1309687	1309692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_017274	T	6	6	1309696	1309701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017274	ATC	2	6	1309725	1309730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_017274	TAATT	2	10	1309784	1309793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017274	CAT	2	6	1309848	1309853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017274	ACT	2	6	1310270	1310275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_017274	CT	3	6	1314009	1314014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_017274	ACA	2	6	1314021	1314026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_017274	TTTAC	2	10	1315093	1315102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4133	NC_017274	A	6	6	1315128	1315133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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