MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 10987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017274	TCC	2	6	337942	337947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_017274	GGA	2	6	337951	337956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017274	GAA	2	6	337991	337996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017274	AGG	2	6	338047	338052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017274	AAG	2	6	338169	338174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017274	CGG	2	6	338210	338215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_017274	AGGA	2	8	338277	338284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017274	ATT	2	6	338295	338300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017274	GAG	2	6	338312	338317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017274	GAG	2	6	338400	338405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017274	A	6	6	339605	339610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017274	CCT	2	6	340649	340654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_017274	AATATT	2	12	340754	340765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017274	AGGA	2	8	340821	340828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017274	TCT	2	6	340853	340858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017274	GGA	2	6	340888	340893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017274	CCT	2	6	340931	340936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_017274	CG	3	6	340965	340970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_017274	GTGAA	2	10	340975	340984	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017274	CCT	2	6	341020	341025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017274	AATT	2	8	341039	341046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017274	TTA	2	6	341080	341085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017274	ATT	2	6	341089	341094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017274	AT	4	8	341103	341110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017274	AAT	2	6	341122	341127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017274	AGA	2	6	341168	341173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017274	GGA	2	6	341267	341272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017274	AAG	2	6	341283	341288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017274	TGGT	2	8	341290	341297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017274	TC	3	6	341301	341306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_017274	GAG	3	9	341312	341320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017274	GTA	2	6	341360	341365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017274	AAG	2	6	341384	341389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017274	TCG	2	6	341397	341402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017274	CT	3	6	341460	341465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_017274	GTTT	2	8	341476	341483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017274	TAG	2	6	341502	341507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017274	TC	3	6	341525	341530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_017274	AAG	2	6	341613	341618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017274	GAAT	2	8	341971	341978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017274	ATT	2	6	341979	341984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017274	TA	3	6	342020	342025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017274	TAT	2	6	343127	343132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017274	TAT	2	6	343136	343141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017274	CAA	2	6	345717	345722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017274	TAA	2	6	345738	345743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017274	TA	3	6	345744	345749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017274	AAG	2	6	345876	345881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017274	TAA	2	6	345929	345934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017274	T	6	6	345972	345977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017274	TGA	3	9	346001	346009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017274	CTC	2	6	346656	346661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_017274	AC	3	6	346665	346670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_017274	TTA	2	6	347138	347143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017274	TA	3	6	347142	347147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017274	TAT	2	6	347153	347158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017274	TTAT	3	12	347155	347166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017274	A	7	7	347169	347175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017274	ATT	2	6	347233	347238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017274	TTAA	2	8	347239	347246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017274	TGG	2	6	347269	347274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017274	T	6	6	347595	347600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017274	ATT	2	6	349193	349198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017274	AGTA	2	8	349223	349230	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017274	ACG	2	6	349251	349256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_017274	TGG	2	6	349309	349314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017274	TTA	2	6	349318	349323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017274	ATC	2	6	349451	349456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017274	GA	3	6	349480	349485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017274	GAACAT	2	12	349491	349502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1071	NC_017274	TGA	2	6	349521	349526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017274	GGA	2	6	349570	349575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017274	TTG	2	6	349583	349588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017274	AAG	2	6	349735	349740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017274	AAG	2	6	349744	349749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017274	TCC	2	6	349812	349817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_017274	AAG	2	6	349819	349824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017274	CTA	2	6	349832	349837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_017274	AGT	2	6	350000	350005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017274	GAA	2	6	350100	350105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017274	AAAT	2	8	350111	350118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_017274	ATTA	2	8	350119	350126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_017274	A	6	6	350130	350135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_017274	TAC	2	6	350232	350237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017274	T	6	6	350527	350532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017274	TACGT	2	10	350595	350604	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_017274	AT	3	6	350610	350615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017274	AAG	2	6	350668	350673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_017274	AGT	2	6	351021	351026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_017274	GATT	2	8	351084	351091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017274	AAG	2	6	351128	351133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_017274	TAA	2	6	351778	351783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017274	A	6	6	351809	351814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017274	TTC	2	6	351887	351892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017274	TAT	2	6	351926	351931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017274	TAA	2	6	351942	351947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017274	GAT	2	6	351956	351961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1108	NC_017274	TGGTT	2	10	352002	352011	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_017274	AGAGGA	2	12	352116	352127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017274	A	6	6	354832	354837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017274	GGTAAG	2	12	354844	354855	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017274	CTAA	2	8	354857	354864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_017274	T	6	6	355869	355874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017274	TA	3	6	358070	358075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017274	T	6	6	359654	359659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017274	ATTT	2	8	360551	360558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017274	TTA	2	6	360562	360567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017274	TCT	2	6	360568	360573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_017274	CTC	2	6	361940	361945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_017274	ATA	2	6	361976	361981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017274	TACTT	2	10	362050	362059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_017274	TAT	2	6	362078	362083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017274	AGG	2	6	362096	362101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017274	TA	3	6	362179	362184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017274	TCG	2	6	362220	362225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_017274	TGA	2	6	362305	362310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017274	AGA	2	6	362312	362317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017274	AGGG	2	8	362345	362352	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017274	TAT	2	6	363248	363253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017274	TGA	2	6	363269	363274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017274	TGA	2	6	363294	363299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017274	GAG	2	6	365215	365220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_017274	ATC	2	6	365242	365247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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