MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 10987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017274	GTT	2	6	209132	209137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017274	TGGA	2	8	209150	209157	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017274	ATG	2	6	209223	209228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017274	ATT	2	6	209259	209264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017274	TGA	2	6	209276	209281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017274	GCC	2	6	215200	215205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_017274	TCA	2	6	215236	215241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017274	TAA	2	6	215268	215273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017274	ATT	2	6	215281	215286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017274	TC	3	6	215319	215324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_017274	ATA	2	6	215341	215346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017274	TAT	2	6	215384	215389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017274	AT	3	6	215388	215393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017274	T	6	6	216814	216819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017274	TCT	2	6	218257	218262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017274	TGA	2	6	218273	218278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017274	GT	3	6	219336	219341	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017274	AT	3	6	221637	221642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017274	GGAA	2	8	222812	222819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017274	TA	3	6	224807	224812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017274	ATA	2	6	224879	224884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017274	AT	3	6	224928	224933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017274	TAA	2	6	224951	224956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017274	AATATA	2	12	224975	224986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017274	AATT	2	8	224990	224997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017274	AGG	2	6	225011	225016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017274	TA	3	6	226109	226114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017274	TCAT	2	8	226161	226168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
529	NC_017274	T	6	6	226173	226178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017274	A	6	6	226183	226188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017274	TAAAT	2	10	226256	226265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017274	T	6	6	232246	232251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017274	T	6	6	232296	232301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017274	AATT	2	8	232303	232310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017274	ATGTA	2	10	232321	232330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017274	TTC	2	6	234810	234815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017274	TC	3	6	234833	234838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
538	NC_017274	TAT	2	6	234877	234882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017274	AG	3	6	235094	235099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017274	ATA	2	6	235109	235114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017274	A	6	6	235138	235143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017274	A	6	6	235146	235151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017274	AAG	2	6	236910	236915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017274	ATT	2	6	236921	236926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017274	AATA	2	8	236927	236934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017274	TTA	2	6	238310	238315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017274	TA	3	6	241010	241015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017274	ATTT	2	8	241110	241117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017274	ATT	2	6	241126	241131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017274	GGT	2	6	241176	241181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017274	GATA	2	8	241247	241254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017274	TAG	2	6	241274	241279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017274	TTA	2	6	241302	241307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017274	ATG	2	6	241338	241343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017274	A	6	6	241412	241417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017274	TA	3	6	241458	241463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017274	ATC	2	6	241473	241478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017274	TAT	2	6	241486	241491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017274	GGGGA	2	10	241497	241506	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017274	GAG	2	6	241515	241520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017274	AAT	2	6	242632	242637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017274	TTA	2	6	242750	242755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017274	TGG	2	6	242763	242768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017274	AGT	2	6	242818	242823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017274	A	6	6	242848	242853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017274	TGA	2	6	242907	242912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017274	AGATT	2	10	242993	243002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017274	ATT	2	6	243067	243072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017274	TAA	2	6	243147	243152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017274	CTAA	2	8	243200	243207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_017274	AC	3	6	243246	243251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_017274	AG	3	6	243316	243321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017274	TGAAA	2	10	243326	243335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017274	CTT	2	6	243338	243343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017274	GAAA	2	8	243405	243412	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017274	TA	4	8	243417	243424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017274	AAT	2	6	243674	243679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017274	GTA	2	6	243699	243704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017274	TA	3	6	243829	243834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017274	TA	3	6	243884	243889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017274	TTC	2	6	243891	243896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017274	CTG	3	9	243985	243993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017274	AGT	2	6	244017	244022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017274	AGC	2	6	244028	244033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017274	TA	3	6	244071	244076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017274	TAG	2	6	244087	244092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017274	TTA	2	6	244119	244124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017274	TAA	2	6	244162	244167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017274	TACA	2	8	244193	244200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_017274	TGC	2	6	244217	244222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017274	GTAATT	2	12	244272	244283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017274	A	6	6	244318	244323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017274	TTGG	2	8	244329	244336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017274	ATA	2	6	244357	244362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017274	TTC	2	6	245627	245632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017274	TGA	2	6	245689	245694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017274	ATT	2	6	245722	245727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017274	AAT	2	6	245752	245757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017274	GGT	2	6	245819	245824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017274	TAA	2	6	245844	245849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017274	GCT	2	6	245870	245875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017274	TGG	2	6	245902	245907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017274	AAT	2	6	245923	245928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017274	AGC	3	9	245935	245943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017274	TAA	2	6	245964	245969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017274	GCTA	2	8	246010	246017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_017274	TTAGCT	2	12	246044	246055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
608	NC_017274	ATT	2	6	246097	246102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017274	AAT	2	6	246109	246114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017274	TGC	2	6	246286	246291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017274	AT	3	6	246375	246380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017274	GGA	2	6	246385	246390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017274	T	6	6	246422	246427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017274	GTG	2	6	247219	247224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017274	TAA	2	6	248195	248200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017274	CTT	2	6	248274	248279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017274	AATTT	2	10	248285	248294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017274	ATA	2	6	248302	248307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017274	ACT	2	6	248334	248339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017274	TG	3	6	248450	248455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017274	AG	3	6	248458	248463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017274	G	7	7	248469	248475	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017274	CTT	2	6	248552	248557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017274	TAA	2	6	248560	248565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017274	CTAT	2	8	248582	248589	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
626	NC_017274	TAT	2	6	248717	248722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017274	TA	3	6	248732	248737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017274	TAT	2	6	249440	249445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017274	A	6	6	249446	249451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017274	AGT	2	6	252830	252835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017274	GAAG	2	8	253924	253931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017274	GTACT	2	10	255765	255774	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
633	NC_017274	TTA	2	6	255777	255782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017274	TAT	2	6	255788	255793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017274	AAC	2	6	255809	255814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017274	CT	4	8	256412	256419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_017274	AT	3	6	256524	256529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017274	AG	3	6	256570	256575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_017274	AGT	2	6	256627	256632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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