MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017078	ATATA	2	10	2846	2855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017078	CAGGT	2	10	12098	12107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017078	ATAAA	2	10	22304	22313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017078	AAGTA	2	10	27323	27332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017078	CTGTT	2	10	29730	29739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017078	TCAAG	2	10	33302	33311	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017078	CAGGA	2	10	33889	33898	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017078	ATATC	2	10	34624	34633	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017078	CTGGG	2	10	34751	34760	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017078	TCCTG	2	10	35984	35993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017078	AGCTC	2	10	39305	39314	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017078	AGGAT	2	10	66081	66090	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017078	ATTAA	2	10	75279	75288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017078	ATCTG	2	10	80040	80049	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017078	AAAAT	2	10	88080	88089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017078	ATATA	2	10	93867	93876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017078	AGGGG	2	10	121548	121557	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017078	GATCA	2	10	133372	133381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017078	TATAA	2	10	148868	148877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017078	ATCTG	2	10	157288	157297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017078	ATATA	2	10	157404	157413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017078	GTGTG	2	10	159116	159125	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017078	AAAAG	2	10	171060	171069	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017078	TCTTT	2	10	172753	172762	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017078	TTTCT	2	10	185795	185804	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017078	TTTTA	2	10	187953	187962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017078	ACTTC	2	10	189722	189731	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017078	TTTAT	2	10	189946	189955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017078	TAAAT	2	10	189958	189967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017078	AATCA	2	10	194469	194478	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017078	ATTTT	2	10	200035	200044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017078	TCACT	2	10	203074	203083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017078	TTGGA	2	10	242281	242290	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017078	CTGTC	2	10	251283	251292	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017078	AATAA	2	10	251356	251365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017078	CGAAT	2	10	251619	251628	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017078	TATTT	2	10	256302	256311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017078	TCTCC	2	10	261716	261725	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017078	CGTTT	2	10	266442	266451	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017078	CAATC	2	10	271080	271089	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017078	TGCCC	2	10	273690	273699	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017078	TCACC	2	10	282036	282045	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.