MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 678

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017078	TCT	2	6	187758	187763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017078	TAC	2	6	187766	187771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_017078	TAT	2	6	187832	187837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017078	T	6	6	187878	187883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017078	ATT	2	6	187890	187895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017078	ATA	2	6	187899	187904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017078	ACT	2	6	187914	187919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017078	TTTTA	2	10	187953	187962	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017078	AT	3	6	188036	188041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017078	ACTTC	2	10	189722	189731	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
511	NC_017078	TTA	2	6	189772	189777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017078	ATA	2	6	189781	189786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017078	AT	3	6	189810	189815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017078	TTAA	2	8	189822	189829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017078	TAA	2	6	189835	189840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017078	TA	3	6	189857	189862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017078	A	6	6	189902	189907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017078	AT	3	6	189909	189914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017078	CTG	2	6	189920	189925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017078	TA	4	8	189938	189945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017078	TTTAT	2	10	189946	189955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017078	TAAAT	2	10	189958	189967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017078	AGG	2	6	189991	189996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017078	TCT	2	6	194451	194456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017078	AATCA	2	10	194469	194478	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
526	NC_017078	AGG	2	6	194480	194485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017078	AGA	2	6	195759	195764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017078	T	7	7	195806	195812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017078	ACA	2	6	195815	195820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017078	A	7	7	195837	195843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017078	ATA	2	6	195864	195869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017078	CAT	2	6	195886	195891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017078	TGTC	2	8	195977	195984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_017078	ATT	2	6	196008	196013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017078	T	6	6	196012	196017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017078	GCCA	2	8	196087	196094	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
537	NC_017078	ATT	2	6	196107	196112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017078	C	6	6	198514	198519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
539	NC_017078	TTC	2	6	198946	198951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017078	CTA	2	6	199864	199869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017078	ATT	2	6	199895	199900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017078	AATA	2	8	199940	199947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017078	A	6	6	199975	199980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017078	CTG	2	6	200012	200017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_017078	ATTTT	2	10	200035	200044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017078	ATT	2	6	200102	200107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017078	AGG	2	6	200161	200166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017078	A	6	6	201843	201848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017078	AGG	2	6	201896	201901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017078	GGC	2	6	202538	202543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017078	CTC	2	6	202949	202954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_017078	ATT	2	6	203009	203014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017078	TAA	2	6	203027	203032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017078	ATTG	2	8	203041	203048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017078	TGC	2	6	203052	203057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_017078	T	6	6	203067	203072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017078	TCACT	2	10	203074	203083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
558	NC_017078	ATT	2	6	203095	203100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017078	TAA	2	6	203105	203110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017078	ATT	2	6	203139	203144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017078	ATGT	2	8	203165	203172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017078	GCA	2	6	203228	203233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017078	CAT	2	6	232901	232906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_017078	TAT	2	6	234617	234622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017078	CT	3	6	234627	234632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_017078	TAAA	2	8	234667	234674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017078	TCC	2	6	234775	234780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_017078	TGC	2	6	235897	235902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017078	T	6	6	237926	237931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017078	CAT	2	6	237942	237947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017078	TTTA	2	8	237956	237963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017078	ATC	2	6	237968	237973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017078	GAA	3	9	238052	238060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017078	TTGGA	2	10	242281	242290	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017078	AGC	2	6	242312	242317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017078	TCT	2	6	242343	242348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017078	TAT	2	6	242435	242440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017078	ATT	2	6	242442	242447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017078	AGCA	2	8	242523	242530	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
580	NC_017078	CAC	2	6	242544	242549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_017078	AAAC	2	8	242560	242567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
582	NC_017078	A	6	6	243255	243260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017078	TGA	2	6	243344	243349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017078	TGC	2	6	243356	243361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017078	AGT	2	6	243400	243405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017078	TG	3	6	243477	243482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017078	GAG	2	6	245180	245185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017078	CTC	2	6	249373	249378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_017078	CTT	2	6	251114	251119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_017078	A	9	9	251136	251144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017078	ATG	2	6	251224	251229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017078	CAT	2	6	251268	251273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_017078	CTGTC	2	10	251283	251292	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
594	NC_017078	CTAT	2	8	251323	251330	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
595	NC_017078	AATAA	2	10	251356	251365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017078	TTG	2	6	251442	251447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017078	AAAT	2	8	251463	251470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017078	ATT	2	6	251577	251582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017078	CGAAT	2	10	251619	251628	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
600	NC_017078	TA	3	6	251681	251686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017078	TGA	2	6	251724	251729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017078	ATTA	2	8	251733	251740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017078	CCA	2	6	251741	251746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017078	ATGA	2	8	251767	251774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017078	ATA	2	6	251818	251823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017078	AT	3	6	253800	253805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017078	TCA	2	6	254758	254763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017078	ACTG	2	8	254837	254844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_017078	CAT	2	6	254857	254862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017078	TGT	2	6	256251	256256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017078	TATTT	2	10	256302	256311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017078	TTC	2	6	258111	258116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017078	TCTCC	2	10	261716	261725	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
614	NC_017078	ATTT	2	8	261731	261738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017078	ATA	3	9	261828	261836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017078	TCC	2	6	266294	266299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_017078	CATA	2	8	266312	266319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_017078	TCA	2	6	266346	266351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017078	CTA	2	6	266393	266398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017078	AGGC	2	8	266409	266416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_017078	T	6	6	266435	266440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017078	CGTTT	2	10	266442	266451	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
623	NC_017078	AGGG	2	8	266487	266494	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017078	CCT	2	6	267719	267724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_017078	AAC	2	6	267759	267764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017078	TCA	2	6	267787	267792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017078	A	7	7	269325	269331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017078	AAAG	2	8	269338	269345	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017078	CAATC	2	10	271080	271089	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
630	NC_017078	CTTT	2	8	271097	271104	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_017078	A	7	7	271135	271141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017078	ATA	2	6	271199	271204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017078	GAG	2	6	271298	271303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017078	GTAT	2	8	271304	271311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017078	CTC	2	6	272676	272681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_017078	ACA	2	6	272710	272715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017078	A	6	6	272717	272722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017078	ACA	2	6	272725	272730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017078	GTT	2	6	272784	272789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017078	T	6	6	273574	273579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.