MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	AGCC	3	12	922	933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017069	CAGA	2	8	4342	4349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017069	GACG	2	8	5704	5711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017069	CTCG	2	8	7631	7638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017069	ACTA	2	8	8028	8035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017069	AACG	2	8	8507	8514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017069	TAAA	2	8	8608	8615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017069	AACT	2	8	8735	8742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017069	AAAT	2	8	8784	8791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017069	AAAT	2	8	8810	8817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017069	TAGG	2	8	9041	9048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017069	ATAA	2	8	9178	9185	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017069	GGAG	2	8	10097	10104	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017069	TTTG	2	8	11431	11438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017069	CAAA	2	8	16022	16029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017069	TTAT	2	8	16039	16046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017069	GGCT	2	8	17388	17395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017069	AGGG	2	8	17405	17412	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017069	ATCA	2	8	21882	21889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017069	TAAA	2	8	42966	42973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017069	AAGA	2	8	45325	45332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017069	TTGA	2	8	45706	45713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017069	TGGT	2	8	46584	46591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017069	GCCA	2	8	46795	46802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017069	AGAA	2	8	50129	50136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017069	TATT	2	8	50690	50697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017069	TATG	2	8	50734	50741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017069	TTAT	2	8	50823	50830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017069	ATTT	2	8	52489	52496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017069	ATTT	2	8	52505	52512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017069	TATG	2	8	52515	52522	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017069	TATT	2	8	53844	53851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017069	ATTT	2	8	54127	54134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017069	TATG	2	8	55131	55138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017069	TGTT	2	8	55151	55158	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017069	TGTA	2	8	55161	55168	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017069	ATTT	2	8	62830	62837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017069	TCTT	2	8	63057	63064	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017069	CGTC	2	8	63328	63335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017069	TTCT	2	8	63580	63587	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017069	GAAT	2	8	63625	63632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017069	CTAG	2	8	63847	63854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017069	ACCA	2	8	63991	63998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017069	GTTT	2	8	68723	68730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.