MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 4003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017068	TAT	2	6	57	62	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017068	TTG	2	6	75	80	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017068	GGA	2	6	118	123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017068	ATA	2	6	196	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017068	CTA	4	12	1909	1920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017068	GGC	2	6	14606	14611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017068	GTG	2	6	14616	14621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017068	AAT	2	6	14651	14656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017068	ATT	2	6	14740	14745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017068	ACC	2	6	14782	14787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017068	GCC	2	6	14791	14796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017068	TTG	2	6	14823	14828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017068	GTA	2	6	14835	14840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017068	AGG	2	6	14993	14998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017068	GTT	2	6	18427	18432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017068	CTT	2	6	18547	18552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017068	TCT	2	6	18570	18575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017068	ATA	2	6	18589	18594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017068	CCG	2	6	18606	18611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017068	ATA	2	6	18629	18634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017068	CAA	2	6	18671	18676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017068	GCT	2	6	18720	18725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017068	TTG	2	6	18736	18741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017068	TTC	2	6	18766	18771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017068	AAC	2	6	18772	18777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017068	ATG	2	6	18802	18807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017068	ATT	2	6	18862	18867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017068	ATT	2	6	19134	19139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017068	GAA	2	6	19209	19214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017068	GCC	2	6	21495	21500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017068	ACA	3	9	21517	21525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017068	GTT	2	6	21537	21542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017068	ACA	2	6	21559	21564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017068	ATA	2	6	25404	25409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017068	TAT	2	6	25420	25425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017068	TAA	2	6	25466	25471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017068	ATA	2	6	25493	25498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017068	GGT	2	6	26506	26511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017068	TGT	3	9	31046	31054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017068	GAT	2	6	31074	31079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017068	GCC	2	6	36904	36909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017068	GCC	2	6	36915	36920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017068	AGT	2	6	37012	37017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017068	ACA	2	6	37018	37023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017068	TAA	2	6	37167	37172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017068	ATC	2	6	39691	39696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017068	TTG	2	6	39710	39715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017068	TTA	2	6	39723	39728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017068	GTA	2	6	39748	39753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017068	AGG	2	6	39766	39771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017068	CTG	2	6	41819	41824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017068	CTT	2	6	43168	43173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017068	TAA	2	6	43209	43214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017068	TGC	2	6	43963	43968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017068	ATT	2	6	44033	44038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017068	CAG	2	6	44081	44086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017068	ATT	2	6	44131	44136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017068	TGA	2	6	44154	44159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017068	CCT	2	6	47189	47194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017068	AGC	2	6	47209	47214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017068	TCA	2	6	47215	47220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017068	GCT	2	6	47234	47239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017068	ATG	2	6	49195	49200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017068	CTT	2	6	53220	53225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017068	CCT	2	6	53805	53810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017068	CTG	2	6	53853	53858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017068	ATT	2	6	53873	53878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017068	ATG	2	6	55792	55797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017068	GAT	2	6	56190	56195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017068	GTG	2	6	56225	56230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017068	CTT	2	6	57312	57317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017068	TTC	2	6	58663	58668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017068	ATA	2	6	58679	58684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017068	TTA	2	6	58776	58781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017068	TCC	2	6	60201	60206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017068	TTA	2	6	62105	62110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017068	AAT	2	6	62370	62375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017068	ACC	2	6	65324	65329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017068	AGG	2	6	65382	65387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017068	CAG	2	6	65394	65399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017068	ATA	2	6	66057	66062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017068	AGG	2	6	69092	69097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017068	ACA	3	9	69151	69159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017068	TAA	2	6	69163	69168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017068	TAA	2	6	69198	69203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017068	TGG	2	6	69230	69235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017068	ATG	2	6	69283	69288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017068	CGG	2	6	71016	71021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017068	TCG	2	6	71179	71184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017068	ATC	2	6	71200	71205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017068	CGA	2	6	71212	71217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017068	TTA	2	6	71236	71241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017068	TCA	2	6	72782	72787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017068	TCC	2	6	72908	72913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017068	AGC	2	6	72925	72930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017068	GCG	2	6	73117	73122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017068	CCG	2	6	73137	73142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017068	GAA	2	6	73204	73209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017068	AAT	2	6	73266	73271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017068	ATA	2	6	73275	73280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017068	ATG	2	6	75611	75616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017068	TAT	2	6	75627	75632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017068	CAG	2	6	78576	78581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017068	TAA	2	6	78644	78649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017068	GTG	2	6	84711	84716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017068	TAC	2	6	87327	87332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017068	AAG	2	6	87392	87397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017068	GAA	2	6	87447	87452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017068	AAT	2	6	87576	87581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017068	ATG	2	6	87728	87733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017068	CAA	2	6	88851	88856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017068	GAT	2	6	92510	92515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017068	GGA	2	6	92640	92645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017068	AAC	2	6	92742	92747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017068	GAG	2	6	92761	92766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017068	TGA	2	6	92767	92772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017068	AGG	2	6	94332	94337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017068	GGA	2	6	97131	97136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017068	GAA	2	6	97149	97154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017068	CAA	2	6	98068	98073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017068	AGG	2	6	98112	98117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017068	GAG	2	6	98428	98433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017068	GAG	2	6	99827	99832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017068	TAA	2	6	102802	102807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017068	AAT	2	6	102908	102913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017068	CCT	2	6	102984	102989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017068	TAT	2	6	103005	103010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017068	AAT	2	6	103019	103024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017068	ATG	2	6	103029	103034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017068	GGC	2	6	103053	103058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017068	TTA	2	6	104471	104476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017068	TGA	2	6	104515	104520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017068	GTT	2	6	104536	104541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017068	AAT	2	6	106758	106763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017068	GAA	2	6	106963	106968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017068	AGG	2	6	107004	107009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017068	TGT	2	6	108275	108280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017068	ATG	2	6	108286	108291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017068	TAT	2	6	109167	109172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017068	GAA	2	6	109240	109245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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