MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 plasmid p798_93

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017054	ACTGG	2	10	823	832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017054	TCGTC	2	10	1530	1539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017054	ACCAC	2	10	4750	4759	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_017054	ATGTT	2	10	4819	4828	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017054	GCTCC	2	10	4863	4872	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017054	AATTT	2	10	14002	14011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017054	TGCAA	2	10	14805	14814	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017054	GGCCC	2	10	15393	15402	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017054	GCCGT	2	10	16213	16222	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017054	TGACA	2	10	16273	16282	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017054	GTTGA	2	10	32501	32510	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017054	TAATG	2	10	37382	37391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017054	GTCTG	2	10	38624	38633	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017054	TATAA	2	10	39531	39540	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017054	GGACG	2	10	41465	41474	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017054	ACGGG	2	10	47962	47971	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017054	ACGGG	2	10	49139	49148	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017054	GAACA	2	10	54179	54188	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017054	GAACT	2	10	58513	58522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017054	CCCCG	2	10	58552	58561	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
21	NC_017054	TAATT	2	10	60681	60690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017054	TTGTG	2	10	61857	61866	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017054	ATTTC	2	10	83950	83959	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.