MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 plasmid p798_93

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017054	CCG	2	6	451	456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017054	CGT	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017054	TAA	2	6	525	530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017054	ACT	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017054	CTG	2	6	621	626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017054	AGC	2	6	690	695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017054	ATA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017054	TTA	2	6	780	785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017054	CAG	2	6	862	867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017054	GTA	2	6	1206	1211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017054	GAG	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017054	GCA	2	6	1415	1420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017054	ACT	2	6	1440	1445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017054	CTA	2	6	1464	1469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017054	AAG	2	6	1503	1508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017054	TGA	2	6	1615	1620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017054	TCT	2	6	1660	1665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017054	CCA	2	6	1716	1721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017054	CCA	2	6	2690	2695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017054	GGA	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017054	GCC	2	6	2748	2753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017054	TTC	2	6	2776	2781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017054	CTG	2	6	2802	2807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017054	CTT	2	6	2975	2980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017054	TCA	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017054	ACA	2	6	3097	3102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017054	ACA	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017054	CAC	2	6	3211	3216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017054	GCC	3	9	3225	3233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017054	TAA	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017054	ATG	2	6	3274	3279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017054	CAG	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017054	CAG	2	6	3430	3435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017054	CGG	2	6	3613	3618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017054	GCG	2	6	3777	3782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017054	ACG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017054	AGT	3	9	4720	4728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017054	GCA	2	6	4732	4737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017054	CAC	2	6	4778	4783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017054	AAT	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017054	TCA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017054	CGC	2	6	5525	5530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017054	CAG	3	9	6506	6514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017054	GGA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017054	CAG	3	9	7284	7292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017054	TCA	2	6	7304	7309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017054	GGC	2	6	7324	7329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017054	TAA	2	6	7422	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017054	CAT	2	6	7442	7447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017054	TTA	2	6	8326	8331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017054	GTT	2	6	9343	9348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017054	GCA	2	6	9463	9468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017054	GAT	2	6	9506	9511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017054	TCA	2	6	9550	9555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017054	TCA	2	6	10126	10131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017054	GGA	2	6	13273	13278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017054	TAA	2	6	13314	13319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017054	GCG	2	6	13406	13411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017054	CGG	2	6	13414	13419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017054	TAA	2	6	14146	14151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017054	AAC	2	6	14249	14254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017054	CAC	2	6	14713	14718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017054	ATA	2	6	14910	14915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017054	ATT	2	6	14941	14946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017054	AAG	2	6	15019	15024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017054	ATT	2	6	15350	15355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017054	GGA	2	6	15381	15386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017054	GAT	2	6	15441	15446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017054	ACA	2	6	15770	15775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017054	GTT	2	6	15815	15820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017054	ACG	2	6	15857	15862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017054	GAT	2	6	15938	15943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017054	CAC	2	6	15944	15949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017054	GGC	2	6	16200	16205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017054	ATG	2	6	16238	16243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017054	TCC	2	6	16253	16258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017054	ACG	2	6	16343	16348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017054	GCT	2	6	16424	16429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017054	TCA	2	6	16431	16436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017054	TAA	2	6	16493	16498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017054	AGC	2	6	17588	17593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017054	AAC	2	6	17627	17632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017054	GAA	2	6	17657	17662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017054	ATA	2	6	17724	17729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017054	ATC	2	6	17783	17788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017054	AGA	2	6	17817	17822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017054	TCT	2	6	17830	17835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017054	TTA	2	6	17866	17871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017054	CTG	2	6	17902	17907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017054	AAT	2	6	17936	17941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017054	TTA	2	6	18043	18048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017054	CAG	2	6	18113	18118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017054	TCT	2	6	18141	18146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017054	GCT	2	6	18156	18161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017054	CAT	2	6	18324	18329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017054	CAG	2	6	18337	18342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017054	TCC	2	6	18355	18360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017054	AAC	2	6	18398	18403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017054	CAG	2	6	18674	18679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017054	AGA	2	6	18714	18719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017054	GAC	2	6	19327	19332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017054	TCT	2	6	19486	19491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017054	CTG	2	6	19547	19552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017054	TGT	2	6	19564	19569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017054	GGC	2	6	19869	19874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017054	AGC	2	6	19998	20003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017054	CAT	2	6	20282	20287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017054	CGG	2	6	20301	20306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017054	TGC	2	6	20540	20545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017054	AGT	2	6	20548	20553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017054	GGT	2	6	20697	20702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017054	CGG	2	6	20760	20765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017054	ACC	2	6	20800	20805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017054	GAC	2	6	20885	20890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017054	GGC	2	6	22748	22753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017054	GCG	2	6	22798	22803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017054	GTT	2	6	22904	22909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017054	GCT	2	6	23871	23876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017054	GCG	2	6	23908	23913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017054	ATG	2	6	23923	23928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017054	CGC	2	6	23942	23947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017054	CAG	2	6	23955	23960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017054	GAC	2	6	23964	23969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017054	TCC	2	6	24063	24068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017054	CCA	2	6	24120	24125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017054	GCC	2	6	24227	24232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017054	CAC	2	6	25632	25637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017054	TTC	2	6	25654	25659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017054	TTC	2	6	26541	26546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017054	ATA	2	6	26596	26601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017054	ATT	3	9	26753	26761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017054	ATA	2	6	26868	26873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017054	TAA	2	6	27014	27019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017054	ATT	2	6	27703	27708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017054	CAT	2	6	27744	27749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017054	AGC	2	6	27751	27756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017054	AGG	2	6	27769	27774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017054	ATT	2	6	27846	27851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017054	AAG	2	6	27959	27964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017054	ACT	2	6	27988	27993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017054	TGC	2	6	29950	29955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_017054	GAA	2	6	62482	62487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017054	ATT	2	6	63247	63252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017054	CTG	2	6	68214	68219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_017054	CTG	2	6	71543	71548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_017054	ATT	2	6	73171	73176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017054	CAG	2	6	74109	74114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_017054	CGG	2	6	74171	74176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_017054	AAT	2	6	77400	77405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_017054	TGA	2	6	77499	77504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017054	ATA	2	6	77520	77525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017054	TGA	2	6	82939	82944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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307	NC_017054	GCG	2	6	93865	93870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.