MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 3243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017053	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017053	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017053	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017053	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017053	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017053	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017053	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017053	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017053	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017053	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017053	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017053	TCT	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017053	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017053	GAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017053	AAC	2	6	8750	8755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017053	TGC	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017053	GAT	2	6	14890	14895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017053	TTA	2	6	14909	14914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017053	AAT	2	6	14995	15000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017053	AGA	2	6	15001	15006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017053	AGA	2	6	15009	15014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017053	TAG	2	6	15077	15082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017053	ATA	2	6	16510	16515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017053	AGT	2	6	16560	16565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017053	TAA	2	6	16832	16837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017053	GGC	2	6	17104	17109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017053	CGA	2	6	17349	17354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017053	GCA	2	6	17423	17428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017053	CGC	2	6	17470	17475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017053	TGT	2	6	17509	17514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017053	AGA	2	6	17518	17523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017053	ATG	2	6	17524	17529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017053	CCA	2	6	17545	17550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017053	CAG	2	6	17592	17597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017053	GGA	2	6	17782	17787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017053	GAA	2	6	18046	18051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017053	GGT	2	6	18120	18125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017053	GTC	2	6	18134	18139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017053	CAT	2	6	18202	18207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017053	TAA	2	6	18237	18242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017053	GGA	2	6	18246	18251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017053	ATC	2	6	18270	18275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017053	CGC	2	6	18436	18441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017053	CAC	2	6	18481	18486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017053	GAT	2	6	18552	18557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017053	CCT	2	6	18608	18613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017053	AGG	2	6	18707	18712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017053	CTA	2	6	18753	18758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017053	TAA	2	6	19001	19006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017053	TAA	2	6	19032	19037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017053	GAA	2	6	19085	19090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017053	ACG	2	6	19102	19107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017053	TAG	2	6	19273	19278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017053	AGA	2	6	19361	19366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017053	GGA	2	6	19477	19482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017053	ACA	2	6	19595	19600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017053	ATG	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017053	TGT	2	6	19732	19737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017053	GGA	2	6	19795	19800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017053	ATC	2	6	20002	20007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017053	ACC	2	6	20060	20065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017053	AGC	2	6	20140	20145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017053	AAG	2	6	20277	20282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017053	GAG	2	6	20292	20297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017053	TAG	2	6	20605	20610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017053	GAT	2	6	20851	20856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017053	AGG	2	6	20896	20901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017053	CGG	2	6	20942	20947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017053	GTT	2	6	21202	21207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017053	TAC	2	6	21212	21217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017053	CCT	2	6	21300	21305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017053	GGT	2	6	21436	21441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017053	TCG	2	6	21551	21556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017053	CGT	2	6	21631	21636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017053	CAG	2	6	22072	22077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017053	AGT	2	6	22329	22334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017053	CGT	2	6	22669	22674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017053	GAG	2	6	22683	22688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017053	CTC	2	6	22848	22853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017053	CGC	2	6	23014	23019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017053	TAT	2	6	23020	23025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017053	ATT	2	6	23130	23135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017053	GGA	2	6	23138	23143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017053	TCC	2	6	23221	23226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017053	TCG	2	6	23261	23266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017053	GTT	2	6	23325	23330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017053	CGG	2	6	23378	23383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017053	TGT	2	6	23455	23460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017053	GGT	2	6	23535	23540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017053	GGT	2	6	23570	23575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017053	AGA	2	6	23762	23767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017053	ATT	2	6	23827	23832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017053	ACT	2	6	23860	23865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017053	GTT	2	6	23905	23910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017053	AGT	2	6	23934	23939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017053	AAT	2	6	24035	24040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017053	TAT	2	6	24130	24135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017053	TGA	2	6	24136	24141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017053	TAG	2	6	24324	24329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017053	TAA	2	6	24352	24357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017053	GAT	2	6	24397	24402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017053	ATT	2	6	24493	24498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017053	CTA	2	6	24609	24614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017053	TAA	2	6	24753	24758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017053	ATA	2	6	24817	24822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017053	ATA	2	6	24842	24847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017053	TTA	2	6	24865	24870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017053	AAG	2	6	24902	24907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017053	TTA	2	6	24955	24960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017053	ATA	2	6	24965	24970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017053	GCT	2	6	25059	25064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017053	TTA	2	6	25103	25108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017053	AGT	2	6	25183	25188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017053	ATT	2	6	26386	26391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017053	GTT	2	6	26404	26409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017053	GGA	2	6	26625	26630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017053	ATA	2	6	27615	27620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017053	TAA	2	6	27713	27718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017053	AAC	2	6	27726	27731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017053	ACG	2	6	27770	27775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017053	TAA	2	6	28582	28587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017053	AAT	2	6	29888	29893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017053	TAT	2	6	29915	29920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017053	ATA	2	6	29964	29969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017053	AGA	2	6	30741	30746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017053	CGT	2	6	37351	37356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017053	ATC	2	6	37400	37405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017053	AGA	2	6	38017	38022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017053	TCG	2	6	38104	38109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017053	CCT	2	6	40894	40899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017053	TTA	2	6	40905	40910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017053	GAT	2	6	40944	40949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017053	CTA	2	6	41031	41036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017053	CGT	2	6	42548	42553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017053	CTT	2	6	46990	46995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017053	ATA	2	6	47065	47070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017053	GTT	2	6	47080	47085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017053	ATT	2	6	48071	48076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_017053	AGT	2	6	48145	48150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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