MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017052	TCAAAA	2	12	42381	42392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017052	TTGAAA	2	12	53268	53279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017052	GGGTGG	2	12	54320	54331	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017052	TTAAAT	2	12	74876	74887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017052	CGTTTA	2	12	120210	120221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017052	TTATAG	2	12	141076	141087	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017052	AAGGGT	2	12	153360	153371	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017052	TAGCCC	2	12	172961	172972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017052	TTAAGT	2	12	182214	182225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017052	GGGAAA	2	12	208439	208450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017052	ACCATT	2	12	260404	260415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017052	TAGGCT	2	12	299427	299438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017052	ATCCCC	2	12	326996	327007	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017052	GTTTTA	2	12	334532	334543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017052	ATGCTA	2	12	335700	335711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017052	GGCAAA	2	12	345287	345298	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017052	TCGAAA	2	12	359497	359508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017052	TCAACG	2	12	382923	382934	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017052	TGACCA	2	12	450376	450387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017052	TTTGAC	2	12	454550	454561	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017052	CCATTG	2	12	454771	454782	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017052	GTAACT	2	12	468780	468791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017052	CGGCCC	2	12	484839	484850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017052	GGTTAT	2	12	491562	491573	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017052	AAAATC	2	12	539174	539185	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017052	TTCTCT	2	12	550542	550553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017052	GGTTAG	2	12	566098	566109	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017052	AATGAT	2	12	583685	583696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017052	ATTTTC	2	12	606192	606203	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017052	CGGACG	2	12	633389	633400	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017052	CTTGAA	2	12	663857	663868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017052	TCCGCC	2	12	668747	668758	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017052	TCTTAA	2	12	692755	692766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017052	TTTCCC	2	12	728672	728683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017052	TCCCCC	2	12	755963	755974	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
36	NC_017052	CCTTAC	2	12	763385	763396	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017052	AAAATC	2	12	797925	797936	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017052	AAGTTA	2	12	800265	800276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017052	CTAGGA	2	12	826619	826630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017052	GCTTTA	2	12	843819	843830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017052	CCCCAG	2	12	846162	846173	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017052	CTCTTA	2	12	853543	853554	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017052	GGCAAT	2	12	883442	883453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017052	AGCAAC	2	12	891484	891495	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017052	GGGAAT	2	12	903897	903908	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017052	TCAGTT	2	12	914828	914839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017052	ATTTTA	2	12	920287	920298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017052	ACACCA	2	12	930268	930279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017052	AGAAAA	2	12	961373	961384	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017052	TTGAGT	2	12	988247	988258	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017052	TACTCC	2	12	1025644	1025655	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017052	TATTAA	2	12	1031410	1031421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017052	TTAATT	2	12	1039302	1039313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017052	TTAACT	2	12	1040081	1040092	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017052	AGTCCA	2	12	1076103	1076114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017052	TTGGCC	2	12	1116980	1116991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017052	AGAAGC	2	12	1117080	1117091	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017052	TTAGGT	2	12	1166333	1166344	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017052	ACCTCC	2	12	1170732	1170743	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017052	GCTTAG	2	12	1190752	1190763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017052	TTTCCC	2	12	1197031	1197042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017052	GTTAAG	2	12	1291785	1291796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017052	CTTTGC	2	12	1321608	1321619	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017052	ATCATT	2	12	1324619	1324630	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017052	AATTCA	2	12	1333411	1333422	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017052	CCATCC	2	12	1346272	1346283	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017052	TTACCA	2	12	1374302	1374313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017052	TAAGAG	2	12	1383809	1383820	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017052	AAGGAG	2	12	1421646	1421657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017052	GTATTT	2	12	1523548	1523559	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017052	GGCAAA	2	12	1557397	1557408	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017052	TAGCGA	2	12	1567220	1567231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017052	TTTAAC	2	12	1583539	1583550	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017052	GCTCCC	2	12	1586187	1586198	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017052	GCCAAA	2	12	1605816	1605827	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017052	AATTTA	2	12	1606356	1606367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017052	GAATCT	2	12	1647336	1647347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017052	TAAAAG	2	12	1654239	1654250	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017052	CATTAA	2	12	1654862	1654873	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017052	CCCAGT	2	12	1668087	1668098	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017052	CATTGA	2	12	1671012	1671023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017052	TCAAAC	2	12	1687208	1687219	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017052	ACTGGG	2	12	1721119	1721130	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017052	ACTCAA	2	12	1784803	1784814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017052	GGTAAA	2	12	1814339	1814350	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017052	GTTGTA	2	12	1830559	1830570	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017052	CTGTTA	2	12	1832614	1832625	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017052	TAATGG	2	12	1849632	1849643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017052	AAACGA	2	12	1886003	1886014	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017052	TGGCAA	2	12	1921026	1921037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017052	TTATCT	2	12	1923062	1923073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017052	ACAGAA	2	12	1971583	1971594	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017052	GATTTC	2	12	1979348	1979359	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017052	AGTCAA	2	12	2003611	2003622	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017052	CCCCAT	2	12	2011647	2011658	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017052	GATTTT	2	12	2078052	2078063	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017052	ATGGGG	2	12	2131879	2131890	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017052	TGATCG	2	12	2136388	2136399	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017052	CTAAAC	2	12	2155228	2155239	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017052	TTTCAT	2	12	2191338	2191349	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017052	CCCCTT	2	12	2228269	2228280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017052	ATCGTA	2	12	2260417	2260428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017052	GCAAAA	2	12	2262715	2262726	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017052	TAGAAA	2	12	2288303	2288314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017052	TTTGCA	2	12	2288407	2288418	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017052	AATCCC	2	12	2334860	2334871	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017052	TGGCTC	2	12	2386853	2386864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017052	TTTCTT	2	12	2402368	2402379	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017052	GACCAT	2	12	2420630	2420641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017052	AGCTCA	2	12	2434210	2434221	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017052	AAAAAC	2	12	2445949	2445960	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017052	ATCGCC	2	12	2459115	2459126	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017052	CCATTG	2	12	2554464	2554475	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017052	CCATAT	2	12	2559202	2559213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017052	CCCATT	2	12	2597114	2597125	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017052	CTTTCC	2	12	2602400	2602411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017052	TAAATC	2	12	2629913	2629924	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017052	TGGGCT	2	12	2644339	2644350	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017052	TCTACC	2	12	2653861	2653872	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017052	GACAGT	2	12	2705912	2705923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017052	CTAGTC	2	12	2768460	2768471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017052	CCTGAC	2	12	2775226	2775237	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017052	AGTAAG	2	12	2790955	2790966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017052	GAATAA	2	12	2829463	2829474	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017052	GGAACT	2	12	2829619	2829630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017052	TAGGGA	2	12	2835526	2835537	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017052	AAAGGC	2	12	2849600	2849611	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017052	GGCAAA	2	12	2851309	2851320	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017052	TCTAAG	2	12	2855273	2855284	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017052	GATTGA	2	12	2860224	2860235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017052	ATTTCC	2	12	2882674	2882685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017052	TAGAGC	2	12	2915324	2915335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017052	AGACAG	2	12	2939512	2939523	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017052	TAATTA	2	12	2945983	2945994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017052	TATTCT	2	12	2948510	2948521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017052	TATAAT	2	12	2952094	2952105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017052	TAGCCC	2	12	2964447	2964458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017052	TCTGTT	2	12	2995929	2995940	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017052	TATCAT	2	12	3030100	3030111	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017052	CATAGT	2	12	3041886	3041897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017052	TTGACA	2	12	3056168	3056179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_017052	TAAGAG	2	12	3064154	3064165	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_017052	GAAAAT	2	12	3095014	3095025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017052	ATTTCT	2	12	3101571	3101582	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017052	TGATAC	2	12	3116175	3116186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017052	AATCAA	2	12	3186021	3186032	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017052	CCCAGG	2	12	3212374	3212385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017052	TGGGAT	2	12	3266789	3266800	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017052	GCCCTG	2	12	3282819	3282830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017052	TTGAAC	2	12	3339924	3339935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_017052	GATGAA	2	12	3403020	3403031	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017052	AATTAA	2	12	3413833	3413844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017052	AGGGGA	2	12	3416989	3417000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017052	TTTAAT	2	12	3419639	3419650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017052	TTATTT	2	12	3424987	3424998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017052	TGGTTG	2	12	3458380	3458391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017052	GGCAAC	2	12	3479019	3479030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017052	ATTTTT	2	12	3520077	3520088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017052	TGCCAT	2	12	3521433	3521444	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017052	GGACTT	2	12	3523512	3523523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_017052	GTTTAC	2	12	3534305	3534316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_017052	ACAAGA	2	12	3539647	3539658	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.